| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,226,236 | G→T | intergenic (+66656/+194701) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,226,236 | 0 | G | T | 100.0% | 246.0 / NA | 87 | intergenic (+66656/+194701) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (48/39); total (48/39) | |||||||||||
ACGGAGTGCGTGCTTGCCTTTTGCCACATCTAAACCGAGTTCCAGGCAGTTATAAATCACTTCCGCCACGGCGGATTTGCGCGGGGAAAGGGTGCGTTTTAAGCCATATACTGTGATCATTGTATTTCCTTTGTTCTTTGTTAATGGAGCGTTTTCTAACTATAGCTGTTGAATACTAAAGTGCGGTCAGAATTTACGGCGTTTTTCGCGCCAACAACCAGTTCACCGATTGTGCCAATAATTGCGCGCCTTGTACCGTTAAAATGGATTCGGGATGGAACTGGAAGCTGCAAATTGGCAACGTGCGGTGGCGAATTGCCATGTTTATGCCGTTGTAGGCGGCGTTCGGAATCAGGTCGTCGGGGAGATTGATGCCCATTAACGAATGGTAGCGCGCCACCGGCATAGGGTTGCTTAAGCCTTTGAACATGGCTTCGTTATCGTGTTCGATTCCGGATACTTTTCCGTGCAGAATTTCACCTGCAT > 1/1225991‑1226476 | aCGGAGTGCGTGCTTGCCTTTTGCCACATCTAAACCGAGTTCCAGGCAGTTATAAATCACTTCCGCCACGGCGGATTTGCGCGGGGAAAGGGTGCGTTTTAAGCCATATACTGTGATCATTGTATTTCCTTTGTTCTTTGTTAATGGAGCGTTTTCTAACTATAGCTGTTGAATACTAAAGTGCGGTCAGAATTTACGGCGTTTTTCGCGCCAACAACCAGTTCACCGATTGTGCCAATAATTgctcgc > 1:882373/1‑249 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |