| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,225,185 | C→T | intergenic (+65605/+195752) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,225,185 | 0 | C | T | 100.0% | 164.8 / NA | 59 | intergenic (+65605/+195752) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (38/21); total (38/21) | |||||||||||
AAGCCGAAATCCTGCGGCGTTAGGGTGTAACGTTCGATATTGCCGTTGCGCACTTCTGCCACTTGTGTGATGCCGTGGATTGCCACTTCGTCCAAACCGCTGCCATGTACGATAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGCGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGCCGTGTTTTGCCACTTTCGCGCCGCAACTTGCCGCGACAATGGCGGATGCGG > 1/1224943‑1225426 | aaGCCGAAATCCTGCGGCGTTAGGGTGTAACGTTCGATATTGCCGTTGCGCACTTCTGCCACTTGTGTGATGCCGTGGATTGCCACTTCGTCCAAACCGCTGCCATGTACGATAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACggg < 1:506494/250‑1 (MQ=255) aaaTCCTGCGGCGTTAGGGTGTAACGTTCGATATTGCCGTTGCGCACTTCTGCCACTTGTGTGATGCCGTGGATTGCCACTTCGTCCAAACCGCTGCCATGTACGATAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTaa < 1:170931/251‑1 (MQ=255) aTCCTGCGGCGTTAGGGTGTAACGTTCGATATTGCCGTTGCGCACTTCTGCCACTTGTGTGATGCCGTGGATTGCCACTTCGTCCAAACCGCTGCCATGTACGATAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTaa > 1:351139/1‑249 (MQ=255) tCCTGCGGCGTTAGGGTGTAACGTTCGATATTGCCGTTGCGCACTTCTGCCACTTGTGTGATGCCGTGGATTGCCACTTCGTCCAAACCGCTGCCATGTACGATAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGc < 1:671138/251‑1 (MQ=255) ccTGCGGCGTTAGGGTGTAACGTTCGATATTGCCGTTGCGCACTTCTGCCACTTGTGTGATGCCGTGGATTGCCACTTCGTCCAAACCGCTGCCATGTACGATAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCt < 1:511012/251‑1 (MQ=255) cggcgTTAGGGTGTAACGTTCGATATTGCCGTTGCGCACTTCTGCCACTTGTGTGATGCCGTGGATTGCCACTTCGTCCAAACCGCTGCCATGTACGATAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTgg > 1:808860/1‑250 (MQ=255) ttCGATATTGCCGTTGCGCACTTCTGCCACTTGTGTGATGCCGTGGATTGCCACTTCGTCCAAACCGCTGCCATGTACGATAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTAtt < 1:734686/251‑1 (MQ=255) cTTCTGCCACTTGTGTGATGCCGTGGATTGCCACTTCGTCCAAACCGCTGCCATGTACGATAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAAc < 1:303513/223‑1 (MQ=255) cACTTGTGTGATGCCGTGGATTGCCACTTCGTCCAAACCGCTGCCATGTACGATAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGa > 1:570397/1‑251 (MQ=255) aTGCCGTGGATTGCCACTTCGTCCAAACCGCTGCCATGTACGATAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAAc < 1:211781/250‑1 (MQ=255) gTCCAAACCGCTGCCATGTACGATAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTa < 1:366080/188‑1 (MQ=255) tCCAAACCGCTGCCATGTACGATAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGc < 1:576878/251‑1 (MQ=255) gCCATGTACGATAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGAGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCtt > 1:436476/1‑251 (MQ=255) gTACGATAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTaa > 1:433051/1‑151 (MQ=255) gTACGATAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGc > 1:493176/1‑235 (MQ=255) aTAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTg > 1:284503/1‑242 (MQ=255) aTAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGa > 1:579761/1‑251 (MQ=255) tgtTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGa < 1:624892/250‑1 (MQ=255) gtTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGc > 1:833729/1‑139 (MQ=255) gtTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATg > 1:892131/1‑251 (MQ=255) tGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGa > 1:578943/1‑250 (MQ=255) tGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGa > 1:87077/1‑250 (MQ=255) gTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGaca > 1:735550/1‑251 (MQ=255) cTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCa > 1:212723/1‑251 (MQ=255) aaTTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAg < 1:375178/251‑1 (MQ=255) ttGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTg < 1:196677/251‑1 (MQ=255) gTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACAcc > 1:402177/1‑236 (MQ=255) ggCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATAttgttg < 1:160241/156‑1 (MQ=255) aaCGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAAc < 1:626759/251‑1 (MQ=255) gggAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACg > 1:483312/1‑251 (MQ=255) gAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGCGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACg > 1:772380/1‑249 (MQ=255) aaTACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTc < 1:326876/181‑1 (MQ=255) aaTACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTg < 1:765234/251‑1 (MQ=255) ccGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTATTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGc > 1:443444/1‑250 (MQ=255) gTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGatat > 1:677389/1‑113 (MQ=255) cGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACggg > 1:316907/1‑55 (MQ=255) cGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTg < 1:706149/166‑1 (MQ=255) ggATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATAttgttg < 1:287861/95‑1 (MQ=255) ggATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGc > 1:666033/1‑140 (MQ=255) ggATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGcc > 1:693955/1‑224 (MQ=255) ggATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGCCGTGTTTTGCCa > 1:314179/1‑235 (MQ=255) ggATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGCCGTGTTTTGCCACTTTCGCGCCGCaa > 1:113764/1‑249 (MQ=255) ggATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGCCGTGTTTTGCCACTTTCGCGCCGCaa > 1:373149/1‑249 (MQ=255) cGGACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGCCGTGTTTTGCCACTTTCGCGCCGCAACTTGCCGCGAc < 1:78021/249‑1 (MQ=255) gACCGAGGATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGCCGTGTTTTGCCACTTTCGCGCCGCAACTTGCCGCGACAATg > 1:491931/1‑251 (MQ=255) ggATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTg < 1:229209/132‑1 (MQ=255) ggATATTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACa > 1:347710/1‑135 (MQ=255) atatTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATAttgt < 1:772099/72‑1 (MQ=255) atatTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCTAATGCTTTGCGGGCTTGCTCCGGTGAc > 1:414570/1‑132 (MQ=255) atatTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGCCGTGTTTTGCCACTTTCGCGCCGCAACTTGCCGCGACAATGGCGGATgg > 1:255338/1‑250 (MQ=255) atatTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGCCGTGTTTTGCCACTTTCGCGCCGCAACTTGCCGCGACAATGGCGGATg > 1:12924/1‑250 (MQ=255) atatTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGCCGTGTTTTGCCACTTTCGCGCCGCAACTTGCCGCGACAATGGCGGATg > 1:235777/1‑250 (MQ=255) atatTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGCCGTGTTTTGCCACTTTCGCGCCGCAACTTGCCGCGACAATGGCGGATg > 1:294944/1‑250 (MQ=255) tatTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGCCGTGTTTTGCCACTTTCGCGCCGCAACTTGCCGCGACAATGGCGGATGCg > 1:698963/1‑251 (MQ=255) atTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGCCGTGTTTTGCCAc > 1:899742/1‑213 (MQ=255) atTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGCCGTGTTTTGCCACTTTCGCGCCGCAACTTGCCGCGACAATGGCGGATGCgg > 1:779311/1‑251 (MQ=255) atTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGCCGTGTTTTGCCACTTTCGCGCCGCAACTTGCCGCGACAATGGCGGATGCgg > 1:173529/1‑251 (MQ=255) atTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGCCGTGTTTTGCCACTTTCGCGCCGCAACTTGCCGCGACAATGGCGGATGCgg > 1:136136/1‑251 (MQ=255) atTAAATAGTGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGCCGTGTTTTGCCACTTTCGCGCCGCAACTTGCCGCGACAATGGCGGATGCgg > 1:115393/1‑251 (MQ=255) | AAGCCGAAATCCTGCGGCGTTAGGGTGTAACGTTCGATATTGCCGTTGCGCACTTCTGCCACTTGTGTGATGCCGTGGATTGCCACTTCGTCCAAACCGCTGCCATGTACGATAATGGTGTGTTCATGTCCTAATTGGGCGACGGTTTTGGCATAAACGTCAATGAGTTCGGGGGAATACACGCCGAGTAGCTGGCGTTTCGGGCGGGCGGGATTAATCAGCGGACCGAGGATATTAAATAGCGTACGGGTTTTTAAGGCTTGGCGCACGGGAACTACGTATTTGAAGCCCGGGTGATATTGTTGGGCGAATAAAAAACAGATGCCGATGTCGTCCAATGCTTTGCGGGCTTGTTCCGGTGACATGGCGATGTTGACACCAAGTGCGGTTAATAAATCGCTTGAACCGGTTTTGCCGGAAACGCTGCGGTTGCCGTGTTTTGCCACTTTCGCGCCGCAACTTGCCGCGACAATGGCGGATGCGG > 1/1224943‑1225426 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |