| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,203,510 | A→G | intergenic (+43930/+217427) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,203,510 | 0 | A | G | 100.0% | 169.1 / NA | 59 | intergenic (+43930/+217427) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (41/18); total (41/18) | |||||||||||
GTCTTTTTTTGACCTGGATTATTACATCAACAACGGCTTTTTTAGTCGTGTTATCAAGACGGAAAATCGTTTGTCAGATGATGACCGGACACTACTGGAAATTTATCATAAGGGCGATTATGCGGAATTTCTTAAACAAGCGGTTATCTGCGGGAAGAATATTGTGATTGCCGGGGAAACCGGCTCCGGGAAAACCACTTTAATGAAAGCCCTGGTCGATTATATTCCGTTGCATGAACGCCTAGGCACCATCGAAGATACTCCGGAATTATTCTTACGCCAACATAAGAATTATTTCCACTTATTCTATCCAAGCGAAGCAAAAAATGGTGATTTAATCACGGCTGCCTCTTTGCTGAAATCTTGCCTACGAATGAAACCGGATCGTATTTTACTGGCGGAATTACGCGGTGGGGAAACTTATGACTTTATCAATGTGGTTTCTTCCGGGCATAACGGGTCGATTACCTCTTGTCATGCCGGTTCGGT > 1/1203267‑1203755 | gTCTTTTTTTGACCTGGATTATTACATCAACAACGGCTTTTTTAGTCGTGTTATCAAGACGGAAAATCGTTTGTCAGATGATGACTGGACACTACTGGAAATTTATCATAAGGGTGATTATGCGGAATTCCTTAAACAAGCGGTCATTTGCGGGAAAAATATTGTGATTGCCGGGGAAACCGGCTCCGGGAAAACCACTTTAATGAAAGCCCTAGTCGATTATATTCCGTTGCATGAACGCCTGGGGACCa > 1:564395/1‑251 (MQ=255) 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ctactGGAAATTTATCATAAGGGTGATTATGCGGAATTCCTTAAACAAGCGGTCATTTGCGGGAAAAATATTGTGATTGCCGGGGAAACCGGCTCCGGGAAAACCACTTTAATGAAAGCCCTAGTCGATTATATTCCGTTGCATGAACGCCTGGGGACCATTGAAGATACCCCGGAATTATTCTTACGCCAACATAAGAACTATTTCCACTTATTCTATCCAAGCGAAGCAAAAAATGGTGATTTAATCa > 1:161532/1‑250 (MQ=255) ctactGGAAATTTATCATAAGGGTGATTATGCGGAATTCCTTAAACAAGCGGTCATTTGCGGGAAAAATATTGTGATTGCCGGGGAAACCGGCTCCGGGAAAACCACTTTAATGAAAGCCCTAGTCGATTATATTCCGTTGCATGAACGCCTGGGGACCATTGAAGATACCCCGGAATTATTCTTACGCCAACATAAGAACTATTTCCACTTATTCTATCCAAGCGAAGCAAAAAATGGTGATTTAATCa > 1:467232/1‑250 (MQ=255) tGGAAATTTATCATAAGGGTGATTATGCGGAATTCCTTAAACAAGCGGTCATTTGCGGGAAAAATATTGTGATTGCCGGGGAAACCGGCTCCGGGAAAACCACTTTAATGAAAGCCCTAGTCGATTATATTCCGTTGCATGAACGCCTGGGGACCATTGAAGATACCCCGGAATTATTCTTACGCCAACATAAGAACTATTTCCACTTATTCTATc > 1:392256/1‑216 (MQ=255) 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cGCCTGGGGACCATTGAAGATACCCCGGAATTATTCTTACGCCAACATAAGAACTATTTCCACTTATTCTATCCAAGCGAAGCAAAAAATGGTGATTTAATCACGGCTGCCTCTTTGCTGAAATCTTGCCTACGAATGAAACCGGATCGTATTTTACTGGCGGAATTACGCGGTGGGGAAACTTATGACTTTATCAATGTGGTTTCTTCCGGGCATAACGGGTCGATTACCTCTTGTCATGCcggttcggt > 1:297145/1‑251 (MQ=255) | GTCTTTTTTTGACCTGGATTATTACATCAACAACGGCTTTTTTAGTCGTGTTATCAAGACGGAAAATCGTTTGTCAGATGATGACCGGACACTACTGGAAATTTATCATAAGGGCGATTATGCGGAATTTCTTAAACAAGCGGTTATCTGCGGGAAGAATATTGTGATTGCCGGGGAAACCGGCTCCGGGAAAACCACTTTAATGAAAGCCCTGGTCGATTATATTCCGTTGCATGAACGCCTAGGCACCATCGAAGATACTCCGGAATTATTCTTACGCCAACATAAGAATTATTTCCACTTATTCTATCCAAGCGAAGCAAAAAATGGTGATTTAATCACGGCTGCCTCTTTGCTGAAATCTTGCCTACGAATGAAACCGGATCGTATTTTACTGGCGGAATTACGCGGTGGGGAAACTTATGACTTTATCAATGTGGTTTCTTCCGGGCATAACGGGTCGATTACCTCTTGTCATGCCGGTTCGGT > 1/1203267‑1203755 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |