| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,203,396 | T→C | intergenic (+43816/+217541) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,203,396 | 0 | T | C | 100.0% | 202.7 / NA | 70 | intergenic (+43816/+217541) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (37/33); total (37/33) | |||||||||||
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ggAAATTTATCATAAGGGTGATTATGCGGAATTCCTTAAACAAGCGGTCATTTGCGGGAAAAATATTGTGATTGCCGGGGAAACCGGCTCCGGGAAAACCACTTTAATGAAAGCCCTAGTCGATTATATTCCGTTGCATGAACGCCTGGGGACCATTGAAGATACCCCGGAATTATTCTTACGCCAACATAAGAACTATTTCCACTTATTCTATCCAAGCg < 1:282654/221‑1 (MQ=255) aTCATAAGGGTGATTATGCGGAATTCCTTAAACAAGCGGTCATTTGCGGGAAAAATATTGTGATTGCCGGGGAAACCGGCTCCGGGAAAACCACTTTAATGAAAGCCCTAGTCGATTATATTCCGTTGCATGAACGCCtggggac < 1:567171/145‑7 (MQ=255) aTCATAAGGGTGATTATGCGGAATTCCTTAAACAAGCGGTCATTTGCGGGAAAAATATTGTGATTGCCGGGGAAACCGGCTCCGGGAAAACCACTTTAATGAAAGCCCTAGTCGATTATATTCCGTTGCATGAACGCCTGGGGACCATTGAAGATACCCCGGAATTATTCTTACGCCAACATAAg < 1:566925/185‑1 (MQ=255) tCATAAGGGTGATTATGCGGAATTCCTTAAACAAGCGGTCATTTGCGGGAAAAATATTGTGATTGCCGGGGAAACCGGCTCCGGGAAAACCACTTTAATGAAAGCCCTAGTCGATTATATTCCGTTGCATGAACGCCTGGGGACCATTGAAGATACCCCGGAATTATTCTTACGCCAACATAAGAACTATTTCCACTTATTCTATCCAAGCGAAGCAAAAAATGGTGATTTAATCACGGc > 1:437769/1‑240 (MQ=255) tCATAAGGGTGATTATGCGGAATTCCTTAAACAAGCGGTCATTTGCGGGAAAAATATTGTGATTGCCGGGGAAACCGGCTCCGGGAAAACCACTTTAATGAAAGCCCTAGTCGATTATATTCCGTTGCATGAACGCCTGGGGACCATTGAAGATACCCCGGAATTATTCTTACGCCAACATAAGAACTATTTCCACTTATTCTATCCAAGCGAAGCAAAAAATGGTGATTTAATCACGGCTGCCTCTTTg > 1:806088/1‑250 (MQ=255) aaGGGTGATTATGCGGAATTCCTTAAACAAGCGGTCATTTGCGGGAAAAATATTGTGATTGCCGGGGAAACCGGCTCCGGGAAAACCACTTTAATGAAAGCCCTAGTCGATTATATTCCGTTGCATGAACGCCTGGGGACCATTGAAGATACCCCGGAATTATTCTTACACCAACATAAGAACTATTTCCACTTATTCTATCCAAGCGAAGCAAAAAATGGTGATTTAATCACGGCTGCCTCTTTGCTGaa > 1:437037/1‑251 (MQ=255) aTTATGCGGAATTCCTTAAACAAGCGGTCATTTGCGGGAAAAATATTGTGATTGCCGGGGAAACCGGCTCCGGGAAAACCACTTTAATGAAAGCCCTAGTCGATTATATTCCGTTGCATGAACGCCTGGGGACCATTGAAGATACCCCGGAATTATTCTTACGCCAACATAAGAACTATTTCCACTTATTCTATCCAAGCGAAGCAAAAAATGGTGATTTAATCACGGCTGCCTCTTTGCTGAAATCTTg > 1:420622/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |