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tCTATGAGTAGCAGTTTTGCCAGCTCACTTTTTACAATTATTGGCATGACACTGACAATTTACTTTTTAGGAAAAGGATTTGCCGTAATATCTGGCAAAATTGAAGCTCCAGCAACAGCATTAATTTATGATTTTGTCACAAAAATGATTATTGTGGCATTTATGATGAATTATgg > 1:135131/1‑176 (MQ=255) tCTATGAGTAGCAGTTTTGCCAGCTCACTTTTTACAATTATTGGCATGACACTGACAATTTACTTTTTAGGAAAAGGATTTGCCGTAATATCTGGCAAAATTGAAGCTCCAGCAACAGCATTAATTTATGATTTTGTCACAAAAATGATTATTGTGGCATTTATGATGAATTATGGGGGGTATCTAGATAACTCTTTATCGATAATTGATGATCTTAAAACTAGttaaaacgccggtttcttataacacaa > 1:291681‑M1/1‑224 (MQ=255) aTGAGTAGCAGTTTTGCCAGCTCACTTTTTACAATTATTGGCATGACACTGACAATTTACTTTTTAGGAAAAGGTTTTGCCGTAATATCTGGCAAAATTGAAGCTCCAGCAACAGCATTAATTTATGATTTTGTCACAAAAATGATTATTGTGGCATTTATGATGAATTATGGGGGGTATCTAGATAActc > 1:669837/1‑191 (MQ=255) aTGAGTAGCAGTTTTGCCAGCTCACTTTTTACAATTATTGGCATGACACTGACAATTTACTTTTTAGGAAAAGGATTTGCCGTAATATCTGGCAAAATTGAAGCTCCAGCAACAGCATTAATTTATGATTTTGTCACAAAAATGATTATTGTGGCATTTATGATGAATTATGGGGGGTATCTAGAt < 1:75221/186‑1 (MQ=255) gttttGCCAGCTCACTTTTTACAATTATTGGCATGACACTGACAATTTACTTTTTAGGAAAAGGATTTGCCGTAATATCTGGCAAAATTGAAGCTCCAGCAACAGCATTAATTTATGATTTTGTCACAAAAATGATTATTGTGGCATTTATGATGAATTATGGGGGGTATCTAGATAActc > 1:144544/2‑181 (MQ=255) tttgccagctcacttttTACAATTATTGGCATGACACTGACAATTTACTTTTTAGGAAAAGGATTTGCCGTAATATCTGGCAAAATTGAAGCTCCAGCAACAGCATTAATTTATGATTTTGTCACAAAAATGATTATTGTGGCATTTATGATGAATTATGGGGGGTATCTAGATAACTCTTTATCGATAATTGATGATCTTAAAACTAGttaaaacgccggtttcttataacacaaccatttcgccaaatg < 1:710751‑M1/243‑43 (MQ=255) gcTCACTTTTTACAATTATTGGCATGACACTGACAATTTACTTTTTAGGAAAAGGATTTGCCGTAATATCTGGCAAAATTGAAGCTCCAGCAACAGCATTAATTTATGATTTTGTCACAAAAATGATTATTGTGGCATTTATGATGAAt > 1:10097/2‑149 (MQ=255) gcTCACTTTTTACAATTATTGGCATGACACTGACAATTTACTTTTTAGGAAAAGGATTTGCCGTAATATCTGGCAAAATTGAAGCTCCAGCAACAGCATTAATTTATGATTTTGTCACAAAAATGATTATTGTGGCATTTATGATGAATTATgg < 1:432333/153‑1 (MQ=255) cACTTTTTACAATTATTGGCATGACACTGACAATTTACTTTTTAGGAAAAGGATTTGCCGTAATATCTGGCAAAATTGAAGCTCCAGCAACAGCATTAATTTATGATTTTGTCACAAAAATGATTATTGTGGCGTTTATGATGAATTATGGGGGGTAt > 1:686537/1‑158 (MQ=255) cTTTTTACAATTATTGGCATGACACTGACAATTTACTTTTTAGGAAAAGGATTTGCCGTAATATCTGGCAAAATTGAAGCTCCAGCAACAGCATTAATTTATGATTTTGTCACAAAAATGATTATTGTGGCATTTATGATGAATTATGGGGGGTATCTAGATAACTCTTTATCGATAATTGATGATCTTAAAAc > 1:151066/1‑194 (MQ=255) ttACAATTATTGGCATGACACTGACAATTTACTTTTTAGGAAAAGGATTTGCCGTAATATCTGGCAAAATTGAAGCTCCAGCAACAGCATTAATTTATGATTTTGTCACAAAAATGATTATTGTGGCATTTATGATGAATTATGGGGGGTATCTAGATAACTCTTTATCGATAATTGATGATCTTAAAAc > 1:871753/1‑190 (MQ=255) cAATTATTGGCATGACACTGACAATTTACTTTTTAGGAAAAGGATTTGCCGTAATATCTGGCAAAATTGAAGCTCCAGCAACAGCATTAATTTATGATTTTGTCACAAAAATGATTATTGTGGCATTTATGATGAATTATgggggg < 1:891894/146‑1 (MQ=255) cAATTATTGGCATGACACTGACAATTTACTTTTTAGGAAAAGGATTTGCCGTAATATCTGGCAAAATTGAAGCTCCAGCAACAGCATTAATTTATGATTTTGTCACAAAAATGATTATTGTGGCATTTATGATGAATTATGGGGGGTATCTAGATAACTCTTTATCGATAATtgat > 1:236837/1‑176 (MQ=255) attattGGCATGACACTGACAATTTACTTTTTAGGAAAAGGATTTGCCGTAATATCTGGCAAAATTGAAGCTCCAGCAACAGCATTAATTTATGATTTTGTCACAAAAATGATTATTGTGGCATTTATGATGAATTATGGGGGGTATCTAGATAACTCTTTATCGATAATTGATGATCTTAAAACTAGttaaaacgccggtttcttataacacaaccatttcgccaaatgtggcaagagacgaacgatagg > 1:54768‑M1/1‑188 (MQ=255) attattGGCATGACACTGACAATTTACTTTTTAGGAAAAGGATTTGCCGTAATATCTGGCAAAATTGAAGCTCCAGCAACAGCATTAATTTATGATTTTGTCACAAAAATGATTATTGTGGCATTTATGATGAATTATGGGGGGTATCTAGATAACTCTTTATCGATAATTGATGATCTTAAAACTAGttaaaacgccggtttcttataacacaaccatttcgccaaatgtggcaagagacgaacgatagg < 1:224522‑M1/251‑64 (MQ=255) attGGCATGACACTGACAATTTACTTTTTAGGAAAAGGATTTGCCGTAATATCTGGCAAAATTGAAGCTCCAGCAACAGCATTAATTTATGATTTTGTCACAAAAATGATTATTGTGGCATTTATGATGAATTATGGGGGGTATCTAGATAACTCTTTATCGATAATTGATGATCTTAAAACTAGttaaaacgccggtttcttataacacaaccatttcgccaaatgtggcaagagacgaacgataggagg > 1:138048‑M1/1‑185 (MQ=255) | AAATGTTAGAAGAATGTGAGAAAAAAGCCGAACCGCTGATGGCAAATTCTAATTGTCGAAACGCAAATAAAGCACAAGCAAGTATTCGACGTATGAATACTCGAGGTGTTAATTTTTCTAATTAGGTTATCATTATGAGATTCTTTGAGAGTATCGATTCTTTCGTTATTCAGTTATTGGATTCAGTTAGTCAATCTATGAGTAGCAATTTTGCTAACTCACTTTTTACAATTATTGGCGTAACACTGACAATTTACTTTTTAGGAAAAGGATTTGCCGTAATATCTGGCAAGATTGAAGCTCCAGCAACAGCATTAATTTATGATTTTGCCACAAAAATGATCATTGTAGCATTTATGATGAATTATGGAGGGTATCTGGATAACTCTTTAGCGATAATTGATGATCTCAAAACTAGCTTAACCGGCTTTACCGGAAACGGTATAGCCGGTTTAATGGATGACCAATTGGAATTAGGATCGGA > 1/1198862‑1199345 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |