| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,198,502 | T→C | intergenic (+38922/+222435) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,198,502 | 0 | T | C | 100.0% | 187.2 / NA | 68 | intergenic (+38922/+222435) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (32/36); total (32/36) | |||||||||||
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tcttAGATTCGTTTGAAAGTAACGTCAATAGTAAATTGAAAACTATTGATAAACTCGCTAAACGGATGACAAAATCTCAAGATGTCAAAGAAAGCCAGGACTTAAAAAATGCAATGGACGTGCAGTTGGCCGCATTGCAATCACAAAAAGTCCAGTTGGATTTATTCAACGCACGGCAAACGGAATAc > 1:214849/1‑188 (MQ=255) tcttAGATTCGTTTGAAAGTAACGTCAATAGTAAATTGAAAACTATTGATAAACTCGCTAAACGGATGACAAAATCTCAAGATGTCAAAGAAAGCCAGGACTTAAAAAATGCAATGGACGTGCAGTTGGCCGCATTGCAATCACAAAAAGTCCAGTTGGATTTATTCAACGCACGGCAAACGGAATACCTACGCTTAATGAATGAGCAACAAAAACAGTTAGCGTCTCAACGTCGCTTAAACGTTAAggg > 1:14967/1‑250 (MQ=255) tcttAGATTCGTTTGAAAGTAACGTCAATAGTAAATTGAAAACTATTGATAAACTCGCTAAACGGATGACAAAATCTCAAGATGTCAAAGAAAGCCAGGACTTAAAAAATGCAATGGACGTGCAGTTGGCCGCATTGCAATCACAAAAAGTCCAGTTGGATTTATTCAACGCACGGCAAACGGAATACCTACGCTTAATGAATGAGCAACAAAAACAGTTAGCGTCTCAACGTCGCTTAAACGTTAAggg > 1:364191/1‑250 (MQ=255) cGTTTGAAAGTAACGTCAATAGTAAATTGAAAACTATTGATAAACTCGCTAAACGGATGACAAAATCTCAAGATGTCAAAGAAAGCCAGGACTTAAAAAATGCAATGGACGTGCAGTTGGCCGCATTGCAATCACAAAAAGTCCAGTTGGATTTATTCAACGCACGGCAAACGGAATACCTACGCTTAATGAATGAGCAACAAAAACAGTTAGCGTCTCAACGTCGCTTAAACGTTAAGGGCGTTATAtt > 1:517490/1‑250 (MQ=255) gTTTGAAAGTAACGTCAATAGTAAATTGAAAACTATTGATAAACTCGCTAAACGGATGACAAAATCTCAAGATGTCAAAGAAAGCCAGGACTTAAAAAATGCAATGGACGTGCAGTTGGCCGCATTGCAATCACAAAAAGTCCAGTTGGATTTATTCAACGCACGGCAAACGGAATACCTACGCTTAATGAATGAGCAACAAAAACAGTTAGCGTCTCAACGTCGCTTAAACGTTAAGGGCGTTATATTc < 1:548839/250‑1 (MQ=255) tttGAAAGTAACGTCAATAGTAAATTGAAAACTATTGATAAACTCGCTAAACGGATGACAAAATCTCAAGATGTCAAAGAAAGCCAGGACTTAAAAAATGCAATGGACGTGCAGTTGGCCGCATTGCAATCACAAAAAGTCCAGTTGGATTTATTCAACGCACGGCAAACGGAATACCTACGCTTAATGAATGAGCAACAAAAACAGTTAGCGTCTCAACGt < 1:883047/222‑1 (MQ=255) ttGAAAGTAACGTCAATAGTAAATTGAAAACTATTGATAAACTCGCTAAACGGATGACAAAATCTCAAGATGTCAAAGAAAGCCAGGACTTAAAAAATGCAATGGACGTGCAGTTGGCCGCATTGCAATCACAAAAAGTCCAGTTGGATTTATTCAACGCACGGCAAACGGAATACCTACGCTTAATGAATGAGCAACAAAAACAGTTAGCGTCTCAACGTCGCTTAAACGTTAAGGGCGTTATATTCaac < 1:806231/251‑2 (MQ=255) ttGAAAGTAACGTCAATAGTAAATTGAAAACTATTGATAAACTCGCTAAACGGATGACAAAATCTCAAGATGTCAAAGAAAGCCAGGACTTAAAAAATGCAATGGACGTGCAGTTGGCCGCATTGCAATCACAAAAAGTCCAGTTGGATTTATTCAACGCACGGCAAACGGAATACCTACGCTTAATGAATGAGCAACAAAAACAGTTAGCGTCTCAACGTCGCTTAAACGTTAAGGGCGTTATATTCaac < 1:256227/251‑2 (MQ=255) | AGCCTTTATTGGTGAAGCGCATAGTTTGTATGGTGAAATAAATGGCTTAAAATCGGAGTTTACCCCGGTAATCGATTTAGTTTCCGGTGGGAAAAACGCATTAAGCGCGAATGCTAAAAGCCTGTTTGAAAAATACAACCTTTTTGACCGTTGTAAGAATTTACGTCAAGGTGAAATTACTTCCTGTGAAGCAAATATTGTTTCCACCGTGGAAAGTATGAGCTTCTTAGATTCGTTTGAAAGTAATGTCAATAGCAAACTTAAAGCAATTGATAAGTTAGCTAATCGTATGGCGAAATCAAACGATGTAAAAGAAAGCCAGGACTTAAAAAATGCAATGGACGTGCAGTTGGCCGCATTGCAATCACAAAAAGTCCAGTTGGATTTATTCAACGCACGGCAAACGGAATACCGACGCTTAATGAATGAGCAACAAAAACAGTTAGCGTCTCAACGTCGCTCAAACGTTAAGGGCGTTATATTCAAT > 1/1198256‑1198742 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |