| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,193,537 | C→T | intergenic (+33957/+227400) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,193,537 | 0 | C | T | 100.0% | 233.2 / NA | 82 | intergenic (+33957/+227400) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (47/35); total (47/35) | |||||||||||
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ctTTACAGCACCAGCGATTTTATTTATATCGGTATGCTTGCCTTGCCGTTGACCATGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTGGTGATCAc < 1:648266/251‑1 (MQ=255) tttACAGCACCAGCGATTTTATTTATATCGGTATGCTTGCCTTGCCGTTGACCATGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTGGTGATCAcc < 1:121612/251‑1 (MQ=255) aGCGATTTTATTTATATCGGTATGCTTGCCTTGCCGTTGACCATGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATc > 1:663520/1‑226 (MQ=255) aTTTTATTTATATCGGTATGCTTGCCTTGCCGTTGACCATGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGc > 1:230740/1‑179 (MQ=255) aTTTTATTTATATCGGTATGCTTGCCTTGCCGTTGACCATGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTGGTGATCACCTTAGGCACTATGTa > 1:5018/1‑250 (MQ=255) ttttATTTATATCGGTATGCTTGCCTTGCCGTTGACCATGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTGGTGATCACCTTAGGCACTATGTAcc < 1:615106/251‑1 (MQ=255) atttatATCGGTATGCTTGCCTTGCCGTTGACCATGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTGGTGATCACCTTAGGCACTATGTACCTAtt > 1:558458/1‑251 (MQ=255) atatCGGTATGCTTGCCTTGCCGTTGACCATGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTGGTGa < 1:373757/222‑1 (MQ=255) tCGGTATGCTTGCCTTGCCGTTGACCATGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTgg > 1:470732/1‑216 (MQ=255) tCGGTATGCTTGCCTTGCCGTTGACCATGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTGGTGa > 1:765476/1‑219 (MQ=255) tCGGTATGCTTGCCTTGCCGTTGACCATGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGGCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTGGTGATCACCTTAGGCACTATGTACCTa < 1:438460/242‑1 (MQ=255) tgccGTTGACCATGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTGGTGATCACCTTAGGCACTATGTACCTATTCGGCGGTGGTGCGTTGTTGCTg < 1:337733/251‑1 (MQ=255) gccGTTGACCATGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTGGTGATCACCTTAGGc < 1:124067/214‑1 (MQ=255) gccGTTGACCATGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTGGTGATCACCTTAGGCACTATGTACCTATTCGGCGGTGGTGCGttgttg > 1:249186/1‑247 (MQ=255) cGTTGACCATGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTggg > 1:469380/1‑79 (MQ=255) gACCATGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTGGTGATCACCTTAGGCACTATGTACCTATTCGGCGGTGGTGCGTTGTTGc > 1:154937/1‑242 (MQ=255) tGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGc > 1:810579/1‑58 (MQ=255) tGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTac > 1:784886/1‑170 (MQ=255) tGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCa > 1:749410/1‑185 (MQ=255) tGATTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTGGTGATCACCTTAGGCACTATGTACCTATTCGGCGGTGGTGCGTTGTTGCTGTCCGGTTTTGcc < 1:264096/251‑1 (MQ=255) aTTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTGGTGATCACCTTAGGCACTATg < 1:643118/207‑1 (MQ=255) aTTATCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTGGTGATCACCTTAGGCACTATGTACCTATTCGGCGGTGGTGCGTTGTTGCTGTCCGGTTTTGCCgg > 1:425206/1‑251 (MQ=255) aTCGTCAGTGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTGGTGa < 1:126351/187‑1 (MQ=255) | AAAATAGCACGGGCGTTGATATAAAAGTGCGGTCG‑AAATAAGGAGGGAATAATTATGTTGACGTTGAAAAGATACGGCTGGGAATTGACGTTATTCTGTTTGGTCATCATTGAAATTCTCGGTTTCGGCGCTTTCAATCCGCGTATGCTGGATTTAAACGTGCTGCTTTACAGCACCAGCGATTTTATTTATATCGGTATGCTTGCCTTGCCGTTGACCATGATTATCGTCAGCGGCGGCATGGATATTTCCTTCGGCTCCACCGTCGGCTTATGTGCTATTACCTTGGGTGTGTTGTTTAAAGCCGATGTGCCGTTGATATTGGCGATTCCGTTAACTTTTGTTGCTGGCATATTATGCGGTTTGATTAATGCCGGATTGATTCTCTACACCAAAGTGAATCCATTGGTGATCACCTTAGGCACTATGTACCTATTCGGCGGTGGTGCGTTGTTGCTGTCCGGTTTTGCCGG > 1/1193304‑1193776 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |