| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,180,276 | G→T | intergenic (+20696/+240661) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,180,276 | 0 | G | T | 100.0% | 16.7 / NA | 8 | intergenic (+20696/+240661) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (7/1); total (7/1) | |||||||||||
GACATGACCCGACCTAATCCGTGTCCTCCGCCAATCGCCACGATTTTTTTTATTTTGCTCAGATTTTCGTGTTGTTGATAGCCGTTAAAGTCCGCCATTTTATTTTCCTTTATTTTGTTTTCGGCAATAGTAACGATGATTTTAAATCGTAAGTTTATAATTATTATGAGGTAGATAAATACCTTTTATTGTTATTTTTTATCGTTATGTAATTTATTATATAATTGATTTTAAAGAATTTTGTTATTTTATAATCTAGATCAAATTAATTGATTGCAATTGCCGAATTTAATCTTTTACAATACGAAAAACTTAATTTAACGCATATAACTCCGAGCTTACTTAACCTACGTTTTGGTCTCAAAATAGGGTGGTAATGCCAATAATACGCAGTTCGTATTATTCAGGGATACGTTGGAAACGATTTATCCTCTCCGTTTTTAGAAAGGTGTCAAATGCAAACCATTC > 1/1180050‑1180517 | gACATGACCCGACCTAATCCGTGTCCTCCGCCAATCGCCACGATTTTTTTTATTTTGCTCAGATTTTCGTGTTGTTGATAGCCGTTAAAGTCCGCCATTTTATTTTCCTTTATTTTGTTTTCGGCAATAGTAACGATGATTTTAAATCGTAAGTTTATAATTATTATGAGGTAGATAAATACCTTTTATTGTTATTTTTTATCGTTATGTAATTTATTATATAATTTATTTTAAAGAATTTTGTTATTTta > 1:901384/1‑251 (MQ=255) cGGCAATAGTAACGATGATTTTAAATCGTAAGTTTATAATTATTATGAGGTAGATAAATACCTTTTATTGTTATTTTTTATCGTTATGTAATTTATTATATAATTTATTTTAAAGAATTTTGTTATTTTATAATCTAGATCAAATTAATTGATTGCAATTGCCGAATTTAATCTTTTACAATACGAAAAACTTAATTTAACGCATATAACTCCGAGcttact > 1:791676/1‑222 (MQ=255) gatTTTAAATCGTAAGTTTATAATTATTATGAGGTAGATAAATACCTTTTATTGTTATTTTTTATCGTTATGTAATTTATTATATAATTTATTTTAAAGAATTTTGTTATTTTATAATCTAGATCAAATTAATTGATTGCAATTGCCGAATTTAATCTTTTACAATACGAAAAACTTAATTTAACGCATATAACTCCGAGCTTACTTAACCTACGTTTTGGTCTCAAAATAGGGTGGTAATGCCAataata > 1:319026/1‑251 (MQ=255) gATAAATACCTTTTATTGTTATTTTTTATCGTTATGTAATTTATTATATAATTTATTTTAAAGAATTTTGTTATTTTATAATCTAGATCAAATTAATTGATTGCAATTGCCGAATTTAATCTTTTACAATACGAAAAACTTAATTTAACGCATATAACTCCGAGCTTACTTAACCTACGTTTTGGTCCCAAAATAGGGTGGTAATGCCAATAATACGCAGTTCGTATTATTCAGGGATACGTTGGAAACGa > 1:84811/1‑251 (MQ=255) tttttATCGTTATGTAATTTATTATATAATTTATTTTAAAGAATTTTGTTATTTTATAATCTAGATCAAATTAATTGATTGCAATTGCCGAATTTAATCTTTTACAATACGAAAAACTTAATTTAACGCATATAACTc > 1:254719/1‑138 (MQ=255) gTTATGTAATTTATTATATAATTTATTTTAAAGAATTTTGTTATTTTATAATCTAGATCAAATTAATTGATTGCAATTGCCGAATTTAATCt > 1:671463/1‑92 (MQ=255) ttattaTATAATTTATTTTAAAGAATTTTGTTATTTTATAATCTAGATCAAATTAATTGATTGCAATTGCCGAATTTAATCTTTTACAATACGAAAAACTTAATTTAACGCATATAACTCCGAGCTTACTTAACCTACGTTTTGGTCTCAAAATAGGGTGGTAATGCCAATAATACGCAg > 1:775431/1‑180 (MQ=255) tatataATTTATTTTAAAGAATTTTGTTATTTTATAATCTAGATCAAATTAATTGATTGCAATTGCCGAATTTAATCTTTTACAATACGAAAAACTTAATTTAACGCATATAACTCCGAGCTTACTTAACCTACGTTTTGGTCTCAAAATAGGGTGGTAATGCCAATAATACGCAGTTCGTATTATTCAGGGATACGTTGGAAACGATTTATCCTCTCCGTTTTTAGAAAGGTGTCAAATGCAAACCATTc < 1:159962/251‑1 (MQ=255) | GACATGACCCGACCTAATCCGTGTCCTCCGCCAATCGCCACGATTTTTTTTATTTTGCTCAGATTTTCGTGTTGTTGATAGCCGTTAAAGTCCGCCATTTTATTTTCCTTTATTTTGTTTTCGGCAATAGTAACGATGATTTTAAATCGTAAGTTTATAATTATTATGAGGTAGATAAATACCTTTTATTGTTATTTTTTATCGTTATGTAATTTATTATATAATTGATTTTAAAGAATTTTGTTATTTTATAATCTAGATCAAATTAATTGATTGCAATTGCCGAATTTAATCTTTTACAATACGAAAAACTTAATTTAACGCATATAACTCCGAGCTTACTTAACCTACGTTTTGGTCTCAAAATAGGGTGGTAATGCCAATAATACGCAGTTCGTATTATTCAGGGATACGTTGGAAACGATTTATCCTCTCCGTTTTTAGAAAGGTGTCAAATGCAAACCATTC > 1/1180050‑1180517 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |