| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,160,135 | G→T | intergenic (+555/+260802) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,160,135 | 0 | G | T | 100.0% | 151.6 / NA | 56 | intergenic (+555/+260802) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (29/27); total (29/27) | |||||||||||
GTCTTGCCGGTCAAAATCCGAACGAGGGATCCAATGTGCAACAATTAATGGATATTTTGATTGCACAGGGCGCAGAAGTGAAACTTTGCACCAGTTGCGTAAAAGCACGCGGGTTATTGGATGCCAAATTAATTGACGGCGTCACCCTCGGCACCTTGGCTGATGTATCAGACTGGACCTTATGGGCTGATAAAGTCATCAGTCTCTAATGAGGATATTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTGTTTTATTCAATATTTTATTTTTATTCACCGGTAACCATGCAAGCACTCAATCCGATTTCCATTCCGTTAAACGCCATCAGTCTTATTGAAGCCTCTGCAGGGACGGGCAAAACCTACACCATGGGTTCTCTTTATTTGCGTCTGTTGTTGCAGGCGGGGGAAAATGCCTTTCCTCATGTGTTAAATGTGGAGCAAATTTTAGCGGTGACCTTTACCGAAATGGCAACGGAGGAACTGAAACGTAA > 1/1159893‑1160380 | gTCTTGCCGGTCAAAATCCGAACGAGGGATCCAATGTGCAACAATTAATGGATATTTTGATTGCACAGGGCGCAGAAGTGAAACTTTGCACCAGTTGCGTAAAAGCACGCGGGTTATTGGATGCCAAATTAATTGACGGCGTCACCCTCGGCACCTTGGCTGATGTATCAGACTGGACCTTATGGGCTGATAAAGTCATCAGTCTCTAATGAGGATATTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTTTTTTAtt > 1:332988/1‑250 (MQ=255)gTCTTGCCGGTCAAAATCCGAACGAGGGATCCAATGTGCAACAATTAATGGATATTTTGATTGCACAGGGCGCAGAAGTGAAACTTTGCACCAGTTGCGTAAAAGCACGCGGGTTATTGGATGCCAAATTAATTGACGGCGTCACCCTCGGCACCTTGGCTGATGTATCAGACTGGACCTTATGGGCTGATAAAGTCATCAGTCTCTAATGAGGATATTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTTTTTTAtt > 1:704232/1‑250 (MQ=255) tCTTGCCGGTCAAAATCCGAACGAGGGATCCAATGTGCAACAATTAATGGATATTTTGATTGCACAGGGCGCAGAAGTGAAACTTTGCACCAGTTGCGTAAAAGCACGCGGGTTATTGGATGCCAAATTAATTGACGGCGTCACCCTCGGCACCTTGGCTGATGTATCAGACTGGACCTTATGGGCTGATAAAGTCATCAGTCTCTAATGAGGATATTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTTTTTTATTc < 1:555624/250‑1 (MQ=255) aaaTCCGAACGAGGGATCCAATGTGCAACAATTAATGGATATTTTGATTGCACAGGGCGCAGAAGTGAAACTTTGCACCAGGTGCGTAAAAGCACGCGGGTTATTGGATGCCAAATTAATTGACGGCGTCACCCTCGGCACCTTGGCTGATGTATCAGACTGGACCTTATGGGCTGATAAAGTCATCAGTCTCTAATGAGGATATTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTTTTTTATTCAATattttatttt < 1:425946/251‑1 (MQ=255) 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ggTTATTGGATGCCAAATTAATTGACGGCGTCACCCTCGGCACCTTGGCTGATGTATCAGACTGGACCTTATGGGCTGATAAAGTCATCAGTCTCTAATGAGGATATTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTTTTTTATTCAATATTTTATTTTTATTCACCGGTAACCATGCAAGCACTCAATCCGATTTCCATTCCGTTAAACGCCATCAGTCTTATTGAAGCCTCTGCAGGGa < 1:129960/235‑1 (MQ=255) ggTTATTGGATGCCAAATTAATTGACGGCGTCACCCTCGGCACCTTGGCTGATGTATCAGACTGGACCTTATGGGCTGATAAAGTCATCAGTCTCTAATGAGGATATTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTTTTTTATTCAATATTTTATTTTTATTCACCGGTAACCATGCAAGCACTCAATCCGATTTCCATTCCGTTAAACGCCATCAGTCTTATTGAAGCCTCTGCAGGGACGGGCAAAACCTaca > 1:484615/1‑250 (MQ=255) aattaattGACGGCGTCACCCTCGGCACCTTGGCTGATGTATCAGACTGGACCTTATGGGCTGATAAAGTCATCAGTCTCTAATGAGGATATTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTTTTTTATTCAAtattttattt < 1:720684/137‑1 (MQ=255) aattaattGACGGCGTCACCCTCGGCACCTTGGCTGATGTATCAGACTGGACCTTATGGGCTGATAAAGTCATCAGTCTCTAATGAGGATATTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTTTTTTATTCAATATTTTATTTTTATTCACCGGTAACCATGCAAGCACTCAATCCGATTTCCATTCCGTTAAACGCCATCAGTCTTATTGAAGCCTCTGCAGGGACGGGCAAAACCTACACCATGGGTTCTCTTTa > 1:247160/1‑251 (MQ=255) 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gTCTCTAATGAGGATATTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTTTTTTATTCAATATTTTATTTTTATTCACCGGTAACCATGCAAGCACTCAATCCGATTTCCATTCCGTTAAACGCCATCAGTCTTATTGAAGCCTCTGCAGGGACGGGCAAAACCTacac > 1:171024/1‑161 (MQ=255) tctcTAATGAGGATATTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTTTTTTATTCAATATTTTATTTTTATTCACCGGTAACCATGCAAGCACTCAATCCGATTTCCATTCCGTTAAACGCCATCAGTc < 1:777869/123‑1 (MQ=255) ctctAATGAGGATATTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTTTTTTATTCAATATTTTATTTTTATTCACCGGTAACCATGCAAGCACTCAATCCGATTTCCATTCCGTTAAACGCCATCAGTCTTATTGAAGCCTCTGCAGGGACGGGCAAAACCTACACCATGGGTTCTCTTTATTTGCGTCTGTTGTTGCAGGCGGGGGAAAATGcc < 1:842847/208‑1 (MQ=255) ctAATGAGGATATTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTTTTTTATTCAATATTTTATTTTTATTCACCGGTAACCATGCAAGCACTCAATCCGATTTCCATTCCGTTAAACGCCATCAGTCTTATTg > 1:372991/1‑126 (MQ=255) ctAATGAGGATATTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTTTTTTATTCAATATTTTATTTTTATTCACCGGTAACCATGCAAGCACTCAATCCGATTTCCATTCCGTTAAACGCCATCAGTCTTATTGAAGCCTCTGCAGGGa > 1:40501/1‑141 (MQ=255) 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atatTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTTTTTTATTCAATATTTTATTTTTATTCACCGGTAACCATGCAAGCACTCAATCCGATTTCCATTCCGTTAAACGCCATCAGTCTTATTGAAg < 1:431698/120‑1 (MQ=255) atatTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTTTTTTATTCAATATTTTATTTTTATTCACCGGTAACCATGCAAGCACTCAATCCGATTTCCATTCCGTTAAACGCCATCAGTCTTATTGAAGCCTCTGCAGGGACGGGCAAAACCTACACCATGGGTTCTCTTTATTTGCGTCTGTTGTTGCAGGCGGGGGAAAATGCCTTTCCTCATGTGTTAAATGTGGAGCAAATTTTGGTGGTGACCTTTACCGAAATg > 1:740829/1‑251 (MQ=255) atatTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTTTTTTATTCAATATTTTATTTTTATTCACCGGTAACCATGCAAGCACTCAATCCGATTTCCATTCCGTTAAACGCCATCAGTCTTATTGAAGCCTCTGCAGGGACGGGCAAAACCTACACCATGGGTTCTCTTTATTTGCGTCTGTTGTTGCAGGCGGGGGAAAATGCCTTTCCTCATGTGTTAAATGTGGAGCAAATTTTGGTGGTGACCTTTACCGAAATg > 1:502381/1‑251 (MQ=255) tatTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTTTTTTATTCAATATTTTATTTTTATTCACCGGTAACCATGCAAGCACTCAATCCGATTTCCATTCCGTTAAACGCCATCAGTCTTATTGAAGCCTCTGCAGGGACGGGCAAAACCTACACCATGGGTTCTCTTTATTTGCGTCTGTTGTTGCAGGCGGGGGAAAATGCCTTTCCTCATGTGTTAAATGTGGAGCAAATTTTGGTGGTGACCTTTACCGAAATgg > 1:172490/1‑251 (MQ=255) 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cccTTTTTTTATTCAATATTTTATTTTTATTCACCGGTAACCATGCAAGCACTCAATCCGATTTCCATTCCGTTAAACGCCATCAGTCTTATTGAAGCCTCTGCAGGGACGGGCAAAACCTACACCATGGGTTCTCTTTATTTGCGTCTGTTGTTGCAGGCGGGGGAAAATGCCTTTCCTCATGTGTTAAATGTGGAGCAAATTTTGGTGGTGACCTTTACCGAAATGGCAACGGAGGAACTGAAACGTaa < 1:16782/251‑1 (MQ=255) | GTCTTGCCGGTCAAAATCCGAACGAGGGATCCAATGTGCAACAATTAATGGATATTTTGATTGCACAGGGCGCAGAAGTGAAACTTTGCACCAGTTGCGTAAAAGCACGCGGGTTATTGGATGCCAAATTAATTGACGGCGTCACCCTCGGCACCTTGGCTGATGTATCAGACTGGACCTTATGGGCTGATAAAGTCATCAGTCTCTAATGAGGATATTGGGCGGAGCGGGTTTCCGCCCTTGTTTTATTCAATATTTTATTTTTATTCACCGGTAACCATGCAAGCACTCAATCCGATTTCCATTCCGTTAAACGCCATCAGTCTTATTGAAGCCTCTGCAGGGACGGGCAAAACCTACACCATGGGTTCTCTTTATTTGCGTCTGTTGTTGCAGGCGGGGGAAAATGCCTTTCCTCATGTGTTAAATGTGGAGCAAATTTTAGCGGTGACCTTTACCGAAATGGCAACGGAGGAACTGAAACGTAA > 1/1159893‑1160380 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |