| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,155,851 | A→C | intergenic (+18802/‑3653) | unknown → / → unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,155,851 | 0 | A | C | 100.0% | 148.3 / NA | 52 | intergenic (+18802/‑3653) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (28/24); total (28/24) | |||||||||||
TTTTTGTATAAATAATAAAGGAAATGCAATGTTAGATAACGATTTATTACATTTAACCCATGAACAGCAGCAACTTGCCGTGGAAAAAATTCAGGAATTAATGGCGCAAGGCGTGGGCAGCGGCGAGGCTATCGCTTTAGTGGCAAAAAAGTTACGGGAACAAAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTATGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAGGTTTGAATTATGGAAGTTGGTGTTGTTAAATGGTTTAATAATGCAAAAGGATTTGGCTTTATTTCCGTTGAAGGCAGTGATACCGATATCTTTGCACATTATTCAGTG > 1/1155612‑1156093 | cactttttgtataaataataaaggaaatgcaatgttagataacgatttattacatttaacccatgaacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGAtttt > 1:76911‑M2/164‑251 (MQ=255) aaataataaaggaaatgcaatgttagataacgatttattacatttaacccatgaacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACttttttt > 1:133408‑M2/152‑251 (MQ=255) taataaaggaaatgcaatgttagataacgatttattacatttaacccatgaacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTAtt > 1:125763‑M2/149‑251 (MQ=255) aataaaggaaatgcaatgttagataacgatttattacatttaacccatgaacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTg < 1:392411‑M2/104‑1 (MQ=255) gttagataacgatttattacatttaacccatgaacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTa > 1:819660‑M2/131‑251 (MQ=255) agataacgatttattacatttaacccatgaacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACtt > 1:876175‑M2/128‑251 (MQ=255) acgatttattacatttaacccatgaacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAatat < 1:174228‑M2/129‑1 (MQ=255) cgatttattacatttaacccatgaacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAAtata > 1:237219‑M2/122‑251 (MQ=255) catttaacccatgaacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACaaa < 1:432763‑M2/117‑1 (MQ=255) catttaacccatgaacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAAtata < 1:658445‑M2/130‑1 (MQ=255) catttaacccatgaacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCa > 1:163457‑M2/112‑251 (MQ=255) aacccatgaacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCa > 1:848925‑M2/107‑251 (MQ=255) cccatgaacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAg > 1:179503‑M2/105‑251 (MQ=255) catgaacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGcaaccaac < 1:404973‑M2/114‑1 (MQ=255) gaacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGAt > 1:79001‑M2/100‑251 (MQ=255) aacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGAt < 1:677597‑M2/152‑1 (MQ=255) aacagcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGAt < 1:538528‑M2/152‑1 (MQ=255) gcagcaacttgccgtggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTAt > 1:381972‑M2/95‑196 (MQ=255) tggaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTg < 1:675460‑M2/171‑1 (MQ=255) gaaaaaattcaggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGaa > 1:344183‑M2/79‑251 (MQ=255) ggaattaatggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGt > 1:91546‑M2/68‑251 (MQ=255) atggcgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATaa < 1:352984‑M2/191‑1 (MQ=255) cgcaaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGa < 1:899589‑M2/194‑1 (MQ=255) caaggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACt < 1:398983‑M2/196‑1 (MQ=255) ggcgtgggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTAt < 1:427521‑M2/102‑1 (MQ=255) gggcagcggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGAc < 1:609506‑M2/195‑1 (MQ=255) ggcgaggctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAgg > 1:330388‑M2/40‑251 (MQ=255) gctatcgctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACaaa < 1:350320‑M2/117‑1 (MQ=255) ctttagtggcaaaaaagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAGGTTTGAATTATGGa > 1:196537‑M2/27‑251 (MQ=255) aagttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAGGTTTGAATTATGGAAGTTGGTGTTGTTa < 1:653766‑M2/239‑1 (MQ=255) ttacgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAGGTTTGAATTATGGAAGTTGGTGTTGTTaaa < 1:341403‑M2/241‑1 (MQ=255) acgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAGGTTTGAATTATGGAAGTTGGTGTTGTTAAATgg < 1:161955‑M2/244‑1 (MQ=255) acgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAGGTTTGAATTATGGAAGTTGGTGTTGTTAAATgg < 1:167335‑M2/244‑1 (MQ=255) acgggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAGGTTTGAATTATGGAAGTTGGTGTTGTTAAATgg < 1:726622‑M2/244‑1 (MQ=255) ggaaAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAGGTTTGAATTATGGAAGTTGGTGTTGTTAAATGGttt > 1:64235‑M2/5‑251 (MQ=255) aTCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAGGTTTGAATTATGGAAGTTGGTGTTGTTAAATGGTTtaataa < 1:827461/251‑1 (MQ=255) ggCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTaaaa > 1:535599/1‑195 (MQ=255) gATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATaa > 1:45823/1‑182 (MQ=255) gATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAGGTTTGAATTATgg < 1:506981/215‑1 (MQ=255) gATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAGGTTTGAATTATGGAAGTTGGTGTTGTTAAATGGTTTAATAATGCAAAAg > 1:622456/1‑251 (MQ=255) aaGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAGGTTTGAATTATGGAAGTTGGTGTTGTTAAATGGTTTAATAATGCAAAAGGATTTGGCTTTAttt > 1:664926/1‑251 (MQ=255) aGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAGGTTTGAATTATGGAAGTTGGTGTTGTTAAAt > 1:169286/1‑217 (MQ=255) aaTTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTg > 1:740127/1‑106 (MQ=255) gCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAgg < 1:514000/116‑1 (MQ=255) gCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAag > 1:831702/1‑177 (MQ=255) gtgtTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATaa > 1:560754/1‑153 (MQ=255) gtgtTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGAc > 1:212478/1‑157 (MQ=255) gtgtTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAAcc > 1:156602/1‑166 (MQ=255) tttttGTGATCTCTGTTTGATTTGGAGACTGTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTc < 1:878208/101‑1 (MQ=255) tgtgATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAGGTTTGAATTATGGAAGTTGGTGTTGTTAAATGGTTTAATAATGCAAAAGGATTTGGCTTTATTTCCGTTGAAGGCAGTGATACCGATATCTTTGCACATTATTCAGTg > 1:221456/1‑251 (MQ=255) gATCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAAc > 1:287952/1‑132 (MQ=255) aTCTCTGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATaa < 1:869024/119‑1 (MQ=255) | TTTTTGTATAAATAATAAAGGAAATGCAATGTTAGATAACGATTTATTACATTTAACCCATGAACAGCAGCAACTTGCCGTGGAAAAAATTCAGGAATTAATGGCGCAAGGCGTGGGCAGCGGCGAGGCTATCGCTTTAGTGGCAAAAAAGTTACGGGAACAAAATCGGGCAGATAAAGCAAAAGAGAAGTAATTGCTGAAGTGTTTTTGCAGCAAAATTTTAATAATTTTTGTGATCTATGTTTGATTTTGAGACTTTTTTTATTGCGCAACCAACAAATTTACTTAATATAACTGCCAGCAAATCAAGGTGATAGGGCATTTTGTCTTATTGAAGTAAATGTAGTTCTATAAGGACTAAAAAACCATAAGAGGTTTGAATTATGGAAGTTGGTGTTGTTAAATGGTTTAATAATGCAAAAGGATTTGGCTTTATTTCCGTTGAAGGCAGTGATACCGATATCTTTGCACATTATTCAGTG > 1/1155612‑1156093 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |