| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,149,442 | G→A | intergenic (+12393/‑10062) | unknown → / → unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,149,442 | 0 | G | A | 100.0% | 232.2 / NA | 85 | intergenic (+12393/‑10062) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (37/48); total (37/48) | |||||||||||
CCGTTAGCCAAATCCCATCCGCTATATGCAACTCAACAATTTTTATTTTCCCAACCGACGATTGATTATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAGGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAGCGCGTTGTTTTGCCTGTTTATCGGTGCCGTCGGTTTATATACATGGCATCAGCAACGGATAGAAATTGATC > 1/1149197‑1149685 | ccGTTAGCCAAATCCCATCCGCTATATGCAACTCAACAATTTTTATTTTCCCAACCGACGATTGATTATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTa > 1:321140/1‑250 (MQ=255) aGCCAAATCCCATCCGCTATATGCAACTCAACAATTTTTATTTTCCCAACCGACGATTGATTATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACg > 1:213129/1‑251 (MQ=255) aGCCAAATCCCATCCGCTATATGCAACTCAACAATTTTTATTTTCCCAACCGACGATTGATTATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACg > 1:584546/1‑251 (MQ=255) gCCAAATCCCATCCGCTATATGCAACTCAACAATTTTTATTTTCCCAACCGACGATTGATTATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGa > 1:156704/1‑251 (MQ=255) tCCCATCCGCTATATGCAACTCAACAATTTTTATTTTCCCAACCGACGATTGATTATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAatta > 1:279005/1‑251 (MQ=255) ccGCTATATGCAACTCAACAATTTTTATTTTCCCAACCGACGATTGATTATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGAACATCCCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTgg > 1:452619/1‑251 (MQ=255) gCTATATGCAACTCAACAATTTTTATTTTCCCAACCGACGATTGATTATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAat < 1:623447/241‑1 (MQ=255) tatGCAACTCAACAATTTTTATTTTCCCAACCGACGATTGATTATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGtt > 1:788264/1‑251 (MQ=255) atGCAACTCAACAATTTTTATTTTCCCAACCGACGATTGATTATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGttt > 1:279224/1‑251 (MQ=255) atGCAACTCAACAATTTTTATTTTCCCAACCGACGATTGATTATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGCTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACgctt > 1:896612/1‑248 (MQ=255) aTTTTTATTTTCCCAACCGACGATTGATTATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAgg > 1:369420/1‑251 (MQ=255) aTTTTTATTTTCCCAACCGACGATTGATTATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAgg > 1:1053/1‑251 (MQ=255) cccAACCGACGATTGATTATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCAt < 1:235738/251‑1 (MQ=255) cccAAACGACGATTGATTATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCAACAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTAACAAAAGGAACCACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCAt < 1:336404/251‑1 (MQ=255) ccGACGATTGATTATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCa < 1:512580/251‑1 (MQ=255) gattATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACttttt > 1:733435/1‑251 (MQ=255) attATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACttttt > 1:537171/1‑250 (MQ=255) attATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTc < 1:288537/251‑1 (MQ=255) aTCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCAt < 1:883392/233‑1 (MQ=255) tCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGt < 1:556563/251‑1 (MQ=255) tgctgTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAg < 1:772573/251‑1 (MQ=255) ctgTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCa < 1:391972/251‑1 (MQ=255) gTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTg < 1:110872/220‑1 (MQ=255) tAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATg < 1:138279/251‑1 (MQ=255) cGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGAtt < 1:811054/251‑1 (MQ=255) tggtTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATAc < 1:592689/250‑1 (MQ=255) tggtTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATAc < 1:73075/250‑1 (MQ=255) ggtTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAg > 1:853831/1‑251 (MQ=255) gtTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAg < 1:82604/250‑1 (MQ=255) tAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTgg < 1:29889/251‑1 (MQ=255) aaaCTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGa > 1:811662/1‑251 (MQ=255) gTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAg > 1:586356/1‑217 (MQ=255) gCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAg < 1:339103/166‑1 (MQ=255) gCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAg < 1:291169/233‑1 (MQ=255) gCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGaaaaa > 1:217313/1‑251 (MQ=255) cATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCAt < 1:738393/203‑1 (MQ=255) tCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATg > 1:123136/1‑251 (MQ=255) cAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTc < 1:517626/222‑1 (MQ=255) ttcatCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAAt > 1:876494/1‑242 (MQ=255) tcatCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAgg < 1:837929/155‑1 (MQ=255) tcatCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACg < 1:277012/251‑1 (MQ=255) ggTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTgg > 1:423777/1‑251 (MQ=255) ttAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGat < 1:60095/251‑1 (MQ=255) cAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGcac < 1:868125/247‑1 (MQ=255) cAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGt < 1:722201/251‑1 (MQ=255) gAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGaa > 1:815018/1‑214 (MQ=255) aaCTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACaa < 1:854660/251‑1 (MQ=255) aaCTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACaa < 1:442602/251‑1 (MQ=255) aCTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAAc < 1:296617/251‑1 (MQ=255) cTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGaaaaa < 1:48985/202‑1 (MQ=255) ggAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGcac < 1:593202/237‑1 (MQ=255) ttCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACtta > 1:136547/1‑251 (MQ=255) tATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATc < 1:95324/251‑1 (MQ=255) tATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATc < 1:636308/251‑1 (MQ=255) tATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATc < 1:102827/251‑1 (MQ=255) tATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATc < 1:581026/251‑1 (MQ=255) aTCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTgg < 1:615686/183‑1 (MQ=255) aaaaGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAgcg > 1:609599/1‑251 (MQ=255) aaaGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAgcgc < 1:795257/251‑1 (MQ=255) acaacaAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAAc < 1:628461/226‑1 (MQ=255) aaGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACttat > 1:310775/1‑231 (MQ=255) cAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAGCGCGTTGTTTTGc > 1:595661/1‑247 (MQ=255) ggACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCAt < 1:294010/114‑1 (MQ=255) ccATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAGCGCGTTGTTTTGCCTGTTTATCGGt > 1:30091/1‑251 (MQ=255) ttGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAGCGCGTTGTTTTGcc > 1:66645/1‑237 (MQ=255) gCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGc > 1:698272/1‑128 (MQ=255) ccGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGat > 1:529412/1‑185 (MQ=255) cGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAGCGCGTTGTTTTGCCTGTTTATCGGTGCCGTCGGTTtatat < 1:880640/251‑1 (MQ=255) ggAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAGCGCGTTGTTTTGCCTGTTTATCGGTGCCGTCGGTTtatata < 1:350094/250‑1 (MQ=255) gAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAGCGCGTTGTTTTGCCTGTTTATCGGTGCCGTCGGTTTATATAc < 1:118209/250‑1 (MQ=255) aaaTTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAgg > 1:498079/1‑69 (MQ=255) aaaTTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATc < 1:820590/205‑1 (MQ=255) aaTTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAGCGCGTTGTTTTGCCTGTTTATCGGTGCCGTCGGTTTATATACATg > 1:232972/1‑251 (MQ=255) cACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATAc < 1:551237/121‑1 (MQ=255) cACTTCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCAc < 1:315349/185‑1 (MQ=255) tCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATc > 1:842337/1‑189 (MQ=255) tCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAGCGCGTTGTTTTGCCTGTTTATCGGTGCCGTCGGTTtatata < 1:458152/232‑1 (MQ=255) tCCTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAGCGCGTTGTTTTGCCTGTTTATCGGTGCCGTCGGTTTATATACATGGCATCAGCAACGGAt > 1:815364/1‑251 (MQ=255) cTATAACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAGCGCGTTGTTTTGCCTGTTTATCGGTGCCGTCGGTTTATATAc > 1:769673/1‑231 (MQ=255) taACGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAGCGCGTTGTTTTGCCTGTTTATCGGTGCCGTCGGTTTATATAc > 1:469452/1‑228 (MQ=255) aCGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCa < 1:125853/82‑1 (MQ=255) aCGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAGCGCGTTGTTTTGCCTGTTTATCGGTGCCGTCGGTTTATATACATg > 1:589462/1‑229 (MQ=255) cGGAAAAGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAGCGCGTTGTTTTGCCTGTTTATCGGTGCCGTCGGTTTATATAc > 1:557050/1‑225 (MQ=255) aaaaGCAAGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAGCGCGTTGTTTTGCCTGTTTATCGGTGCCGTCGGTTTATATACATGGCATCAGCAACGGATAGAAATTGAt < 1:41333/250‑1 (MQ=255) aaaaGCAAGCTACTGAAGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAGCGCGTTGTTTTGCCTGTTTATCGGTGCCGTCGGTTTATATACATGGCATCAGCAACGGATAGAAATTGATc < 1:362587/251‑1 (MQ=255) | CCGTTAGCCAAATCCCATCCGCTATATGCAACTCAACAATTTTTATTTTCCCAACCGACGATTGATTATCAGCTGCTGTTAAAACGTCAGGAGGTGGTTAAACTGATGTTTGAGCATCAGATCATTCATCGGTTAGCTCAAATTCAAGAAAACTGGAAAATTCTTTATCAAAAGGAACAACAAGCAGGACAT‑CCATTGCCGGAATTGCGGGAAATTTTGACCGCACTTCCTATAACGGAAAAGCAGGCTACTGACGAAAATTATTTGGAAACGTTTAAGGCAAATGAGGCGTTACTGCATTGGCAACACTTTTTCATGTTACAGCAAATGCGATTTGTCGATACAGTGGAAAAATTATGAAAAAATGGCTTAAACGCTTGGATATTAGCACAAGTTTACAACTATCACTTATTATCAGCGCGTTGTTTTGCCTGTTTATCGGTGCCGTCGGTTTATATACATGGCATCAGCAACGGATAGAAATTGATC > 1/1149197‑1149685 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |