| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,143,864 | T→C | intergenic (+6815/‑15640) | unknown → / → unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,143,864 | 0 | T | C | 100.0% | 151.7 / NA | 53 | intergenic (+6815/‑15640) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (21/32); total (21/32) | |||||||||||
GGGAAGAACCAAAGAATACAGATAAAGCCGAACCTCAGCAGCCGAAAGCTGAAGAGCCAAAAATGGCAGATGATGCGCAGGGCGTGGAAACACAAAGTGCGGTGGAAAAAAATGATGATTCCAAATCTTTTAATAGCTAAAAAAGAGGCTTTTTGAGCTAGTTGCAAAGACTTTATGATTACAACCCGCTTTGTTAAGCGGGTTTATTTTTAGGCGTCAGTTTTTCGGGAGTCGATATGGAACATAAAATCGAAGATTTAATCCATATTTTTAATCAATGTTTTGAACAGGAATACAACACCAAATTAGTCAAGGGTGGCGATGAGCCTTTGTACGTGCCGGCAAATGAAGATTGTCCTTACAACGCTATCTATTTTGCCCGCGGATTCTACAGCAGTGGATTACATGAAATCGCCCATTGGCTGGTTGCAGGCAAAGAGCGTCGCAAACTGGAAGATTTTGGTTATTGGTATGAACCCGACGGGCGAT > 1/1143620‑1144108 | gggAAGAACCAAAGAATACAGATAAAGCTGAACCTCAGCAGCCGAAAGCTGAAGAGCCAAAAATGGCAGATGATGCGCAGGGCGTGGAAACACAAAGTGCGGTGGAAAAAAATGATGATTCCAAATCTTTTAATAGCTAAAAAAGAGGCTTTTTGAGCTAGTTGCAAAGACTTTATGATTACAACCCGCTTTGTTAAGCGGGTTTATTTTTAGGCGTCAGTTTTTCGGGAGTCGATATGGAACACAAAAt > 1:629362/1‑250 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |