| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,141,574 | T→G | intergenic (+4525/‑17930) | unknown → / → unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,141,574 | 0 | T | G | 100.0% | 145.8 / NA | 53 | intergenic (+4525/‑17930) | unknown/unknown | LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA/tRNA‑Val‑GAC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (23/30); total (23/30) | |||||||||||
AAATGGATCCTATTGTAGGCGTGGATTTTCTACAAGGCGATTTCCGTGATGAAAATGTGTTAAACATTTTATTGGAGCGGGTCGGTGAAGGCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGTGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACACTAATCAAATTAAGTTACCAATAAGCTCAATTGATTTGATAACTTTAATTTTTGAGATAAATATAGTAACCTTACAACACGTTGTTAACTTATAAATAA > 1/1141327‑1141795 | aaaTGGATCCTATTGTAGGCGTGGATTTTCTACAAGGCGATTTCCGTGATGAAAATGTGTTAAACATTTTATTGGAGCGGGTCGGTGAAGGCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGaa > 1:208771/1‑251 (MQ=255) aTCCTATTGTAGGCGTGGATTTTCTACAAGGCGATTTCCGTGATGAAAATGTGTTAAACATTTTATTGGAGCGGGTCGGTGAAGGCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGtttt > 1:158368/1‑251 (MQ=255) tATTGTAGGCGTGGATTTTCTACAAGGCGATTTCCGTGATGAAAATGTGTTAAACATTTTATTGGAGCGGGTCGGTGAAGGCAATGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGCTTtgatg < 1:29512/251‑1 (MQ=255) aTTGTAGGCGTGGATTTTCTACAAGGCGATTTCCGTGATGAAAATGTGTTAAACATTTTATTGGAGCGGGTCGGTGAAGGCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTtgatga > 1:723381/1‑251 (MQ=255) gtgtTAAACATTTTATTGGAGCGGGTCGGTGAAGGCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTtctc > 1:80036/1‑229 (MQ=255) gtgtTAAACATTTTATTGGAGCGGGTCGGTGAAGGCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCg > 1:427641/1‑251 (MQ=255) gtTAAACATTTTATTGGAGCGGGTCGGTGAAGGCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTtgatg > 1:731128/1‑203 (MQ=255) aCATTTTATTGGAGCGGGTCGGTGAAGGCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAAc > 1:704214/1‑249 (MQ=255) cATTTTATTGGAGCGGGTCGGTGAAGGCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAAc > 1:183060/1‑248 (MQ=255) ttttATTGGAGCGGGTCGGTGAAGGCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCa > 1:667389/1‑234 (MQ=255) ttATTGGAGCGGGTCGGTGAAGGCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATAc < 1:50758/198‑1 (MQ=255) tATTGGAGCGGGTCGGTGAAGGCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGcc < 1:745144/251‑1 (MQ=255) gAGCGGGTCGGTGAAGGCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATc < 1:47779/204‑1 (MQ=255) gTCGGTGAAGGCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGAc > 1:718253/1‑249 (MQ=255) ggTGAAGGCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGAt > 1:119221/1‑250 (MQ=255) ggCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAgtgt < 1:262149/206‑1 (MQ=255) gCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGa < 1:309759/250‑1 (MQ=255) aTGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTatat < 1:265244/250‑1 (MQ=255) aTGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTatat < 1:830860/250‑1 (MQ=255) aTGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATAtt < 1:748731/251‑1 (MQ=255) aTGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATAtt < 1:827980/251‑1 (MQ=255) gtggtgATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATAttgt > 1:270936/1‑251 (MQ=255) gtgATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATAttgttg < 1:108459/250‑1 (MQ=255) aTGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAag < 1:580865/166‑1 (MQ=255) aTGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAg > 1:472917/1‑251 (MQ=255) gTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGc < 1:807607/250‑1 (MQ=255) aGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAGAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGtt > 1:797965/1‑251 (MQ=255) gATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATAttg > 1:493942/1‑238 (MQ=255) tGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACACTAATCAAAtt < 1:70633/248‑1 (MQ=255) ccATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACGCTAATCAAATTAAGTTACCaa < 1:209633/251‑1 (MQ=255) cAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAgtgt > 1:518924/1‑151 (MQ=255) ggATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACACTAATCAAATTAAGTTACCAATAAGCTCa > 1:810746/1‑251 (MQ=255) gATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACACTAATCAAATTAAGTTACCAATAAGCTc < 1:403417/249‑1 (MQ=255) cGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAgtgt > 1:146238/1‑133 (MQ=255) aTGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACACTAATCAAATTAAGTTACCAATAAGCTCAAt < 1:209854/237‑1 (MQ=255) aTGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACACTAATCAAATTAAGTTACCAATAAGCTCAATTGATTTGATAACtt > 1:175258/1‑251 (MQ=255) gTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAgtgt < 1:497245/129‑1 (MQ=255) gTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGc < 1:427545/193‑1 (MQ=255) gTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAac < 1:834695/203‑1 (MQ=255) aaCTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATaa > 1:450649/1‑190 (MQ=255) cgcTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTtgatg < 1:485670/78‑1 (MQ=255) cgcTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACACTAATCAAATTAAGTTACCAATAAGCTCAATTGATTTGATAACTTTAATTTTTGAGATAAatat > 1:572209/1‑251 (MQ=255) cgcTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACACTAATCAAATTAAGTTACCAATAAGCTCAATTGATTTGATAACTTTAATTTTTGAGATAAatat < 1:181882/251‑1 (MQ=255) cTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACACTAATCAAATTAAGTTACCAATAAGCTCAATTGATTTGATAACTTTAATTTTTGAGATAAATATAg < 1:54343/251‑1 (MQ=255) ttGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACACTAATCAAATTAAGTTACCAATAAGCTCAATTGATTTGATAACTTTAATTTTTGAGATAAATATAGt < 1:131694/251‑1 (MQ=255) atatGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACACTAATCAAATTAAGTTACCAATAAGCTCAATTGATTTGATAACTTTAATTTTTGAGATAAATATAGTAAc < 1:363999/251‑1 (MQ=255) gtgCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTatat > 1:6827/1‑156 (MQ=255) cAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAGGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACACTAATCAAATTAAGTTACCAATAAGCTCAATTGATTTGATAACTTTAATTTTTGAGATAAATATAGTAACCTTacaa < 1:800168/251‑1 (MQ=255) aaGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCTGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACACTAATCAAATTAAGTTACCAATAAGCTCAATTGATTTGATAACTTTAATTTTTGAGATAAATATAGTAACCTTacaac < 1:432192/251‑1 (MQ=255) aaGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACACTAATCAAATTAAGTTACCAATAAGCTCAATTGATTTGATAACTTTAATTTTTGAGATAAATATAGTAACCTTacaac < 1:217439/251‑1 (MQ=255) cAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTaaa < 1:597807/71‑1 (MQ=255) aaaGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACACTAATCAAATTAAGTTACCAATAAGCTCAATTGATTTGATAACTTTAATTTTTGAGATAAATATAGTAACCTTACAACATGTTGTTAACTTataaa > 1:89218/1‑251 (MQ=255) tttCAGGGGGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACACTAATCAAATTAAGTTACCAATAAGCTCAATTGATTTGATAACTTTAATTTTTGAGATAAATATAGTAACCTTACAACATGTTGTTAACTTataaatac < 1:230954/230‑2 (MQ=255) | AAATGGATCCTATTGTAGGCGTGGATTTTCTACAAGGCGATTTCCGTGATGAAAATGTGTTAAACATTTTATTGGAGCGGGTCGGTGAAGGCAAAGTAGATGTGGTGATGTCAGATATGGCACCGAATTTCAGTGGGATGCCATCAGTGGATATTCCGCGTGCGATGTATTTGGTAGAACTTGCGCTTGATATGTGCAAGCAGATTCTCGCTAATAAAGGAAGTTTTGTAGTAAAAGTTTTTCAGGGTGAAGGTTTTGATGAATACTTAAAAGAGATCCGTTCTCTGTTTAGTGTAGTCAAAGTTCGTAAACCTGAAGCCTCCCGAGACCGATCTCGGGAAGTTTATATTGTTGCAAGCGGTTATAAACACTAATCAAATTAAGTTACCAATAAGCTCAATTGATTTGATAACTTTAATTTTTGAGATAAATATAGTAACCTTACAACACGTTGTTAACTTATAAATAA > 1/1141327‑1141795 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |