| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,130,181 | T→G | intergenic (‑70628/‑1922) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,130,181 | 0 | T | G | 100.0% | 161.1 / NA | 57 | intergenic (‑70628/‑1922) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (27/30); total (27/30) | |||||||||||
TACCGCACTTACGCATCGGCTTGGTACACGGGCGAATGAAACCGAATGAAAAACAAGCGGTAATGGCGCAGTTTAAGCTTGCCGAATTAGATTTACTGGTCGCTACGACCGTGATTGAAGTGGGCGTGGATGTGCCGAATGCCAGTTTGATGATTATTGAAAACGCTGAGCGCCTTGGCTTGTCCCAGCTTCACCAGTTACGTGGGCGGGTCGGGCGTGGCAGTACAGCTTCGTTTTGTGTGTTAATTTACAAACCGCCGCTCGGTAAAATTTCGCAAAAACGCTTACAAGTCATGCGCGACACGCAGGATGGTTTCGTGATTTCGGAAAAAGATCTGGAAATTCGTGGTCCGGGGGAAGTGCTTGGCACGAAACAAACAGGAATTACCGAATTTAAAGTGGCGAACCTCATGCGCGATCGCAAAATGCTGCCGACAGTGCAGTTTTATGCAAAACAACTAGTACAGAAATATCCGCAAACGGCGGACTTGTT > 1/1129934‑1130426 | tACCGCACTTACGCATCGGCTTGGTACACGGGCGAATGAAACCGAATGAAAAACAAGCGGTAATGGCGCAGTTTAAGCTTGCCGAATTAGATTTACTGGTCGCTACGACCGTGATTGAAGTGGGCGTGGATGTGCCGAATGCCAGTTTGATGATTATTGAAAACGCTGAGCGCCTTGGCTTGTCCCAGCTTCACCAGTTACGTGGGCGGGTCGGGCGTGGCAGTACAGCTTCGTTTTGTGTGTTAATGTAc < 1:839378/251‑1 (MQ=255) 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gtTAATGTACAAACCGCCGCTCGGTAAAATTTCGCAAAAACGCTTACAAGTCATGCGCGACACGCAGGATGGTTTCGTGATTTCGGAAAAAGATCTGGAAATTCGTGGTCCGGGGGAAGTGCTTGGCACGAAACAAACAGGAATTACCGAATTTAAAGTGGCGAACCTCATGCGCGATCGCAAAATGCTGCCGACAGTGCAGTTTTATGCAAAACAACTAGTACAGAAATATc < 1:406116/233‑1 (MQ=255) ttAATGTACAAACCGCCGCTCGGTAAAATTTCGCAAAAACGCTTACAAGTCATGCGCGACACGCAGGATGGTTTCGTGATTTCGGAAAAAGATCTGGAAATTCGTGGTCCGGGGGAAGTGCTTGGCACGAAACAAACAGGAATTACCGAATTTAAAGTGGCGAACCTCATGCGCGATCGCAAAATGCTGCCGACAGTGCAGTTTTATGCAAAACAACTAGTACAGaaa > 1:482929/1‑228 (MQ=255) ttAATGTACAAACCGCCGCTCGGTAAAATTTCGCAAAAACGCTTACAAGTCATGCGCGACACGCAGGATGGTTTCGTGATTTCGGAAAAAGATCTGGAAATTCGTGGTCCGGGGGAAGTGCTTGGCACGAAACAAACAGGAATTACCGAATTTAAAGTGGCGAACCTCATGCGCGATCGCAAAATGCTGCCGACAGTGCAGTTTTATGCAAAACAACTAGTACAGAAATATCCGCAAACGGCGGACttgtt > 1:256716/1‑251 (MQ=255) | TACCGCACTTACGCATCGGCTTGGTACACGGGCGAATGAAACCGAATGAAAAACAAGCGGTAATGGCGCAGTTTAAGCTTGCCGAATTAGATTTACTGGTCGCTACGACCGTGATTGAAGTGGGCGTGGATGTGCCGAATGCCAGTTTGATGATTATTGAAAACGCTGAGCGCCTTGGCTTGTCCCAGCTTCACCAGTTACGTGGGCGGGTCGGGCGTGGCAGTACAGCTTCGTTTTGTGTGTTAATTTACAAACCGCCGCTCGGTAAAATTTCGCAAAAACGCTTACAAGTCATGCGCGACACGCAGGATGGTTTCGTGATTTCGGAAAAAGATCTGGAAATTCGTGGTCCGGGGGAAGTGCTTGGCACGAAACAAACAGGAATTACCGAATTTAAAGTGGCGAACCTCATGCGCGATCGCAAAATGCTGCCGACAGTGCAGTTTTATGCAAAACAACTAGTACAGAAATATCCGCAAACGGCGGACTTGTT > 1/1129934‑1130426 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |