| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,116,434 | G→A | intergenic (‑56881/‑15669) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,116,434 | 0 | G | A | 100.0% | 208.0 / NA | 81 | intergenic (‑56881/‑15669) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (38/43); total (38/43) | |||||||||||
GGCGAGCGCGGCACGACGCGCCATCCCGCCGGAAAGTTCGGAAGGCATTAAATCGGCGGCACCGCGCAAGCCCACCGCTTCGAGTTTCATTAATACTATTTTTCTAATCAACGACGGAGGCAGATTGGTGTGCTCTCGAATAGGAAATGCCACATTATCAAAGGTGGAAATATCGGTGAATAATGCGCCGGATTGAAACAGCATACCCATGCGTTTGCGCACATCATAAAGTTCACTGTTGGATAGTTTGCAAATATCTTGCCCGTCGAACAGAATTTCACCTTCGGAAGGCATCAGCTGACCGCCGATGAGTTTCAAAAGGGTGGTTTTACCAATCCCTGACGGTCCCATAATGGCGGTAATTTTGTCGCGGGGAACGCGCAAATTCAGATCGTGGTAAATAATCCGTTCACCGCGTTTAAACGTAAGGTGTTTTACTTCAATTAACGTTTCGTTCATAAAACTGCTAGGTTACGGCTTGAATTGCCT > 1/1116189‑1116677 | ggCGAGCGCGGCACGACGCGCCATCCCGCCGGAAAGTTCGGAAGGCATTAAATCGGCGGCACCGCGCAAGCCCACCGCTTCGAGTTTCATTAATACTATTTTTCTAATCAACGACGGAGGCAGATTGGTGTGCTCTCGAATAGGAAATGCCACATTATCAAAGGTGGAAATATCGGTGAATAATGCGCCGGATTGAAACAGCATACCCATGCGTTTGCGCACATCATAAAGTTCACTGTTGGATAATTTg > 1:554877/1‑250 (MQ=255) 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ggCATTAAATCGGCGGCACCGCGCAAGCCCACCGCTTCGAGTTTCATTAATACTATTTTTCTAATCAACGACGGAGGCAGATTGGTGTGCTCTCGAATAGGAAATGCCACATTATCAAAGGTGGAAATATCGGTGAATAATGCGCCGGATTGAAACAGCATACCCATGCGTTTGCGCACATCATAAAGTTCACTGTTGGATAATTTGCAAATATCTTGCCCGTCGAACAGAATTTCACCTTCGGAAGGCAt > 1:198771/1‑251 (MQ=255) cggcggCACCGCGCAAGCCCACCGCTTCGAGTTTCATTAATACTATTTTTCTAATCAACGACGGAGGCAGATTGGTGTGCTCTCGAATAGGAAATGCCACATTATCAAAGGTGGAAATATCGGTGAATAATGCGCCGGATTGAAACAGCATACCCATGCGTTTGCGCACATCATAAAGTTCACTGTTGGATAATTTGCAAATATCTTGCCCGTCGAACAGAATTTCACCTTCGGAAGGCATc < 1:178624/242‑1 (MQ=255) gCCCACCGCTTCGAGTTTCATTAATACTATTATGCTAATCAACGACGGAGGCAGATTGGTGTGCTCTCGAATAGGAAATGCCACATTATCAAAGGTGGAAATATCGGTGAATAATGCGCCGGATTGAAACAGCATACCCATGCGTTTGCGCACATCATAAAGTTCACTGTTGGATAATTTGCAAATATCt < 1:543924/190‑1 (MQ=255) 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cGTTTGCGCACATCATAAAGTTCACTGTTGGATAATTTGCAAATATCTTGCCCGTCGAACAGAATTTCACCTTCGGAAGGCATCAGCTGACCGCCGATGAGTTTCAAAAGGGTGGTTTTACCAATCCCTGACGGTCCCATAATGGCGGTAATTTTGTCGCGGGGAACGCGCAAATTCAGATCGTGGTAAATAATCCGTTCACCGCGTTTAAACGTAAGGTGTTTTACTTCAATTAACGTTTCGTTCATaaa < 1:555327/251‑1 (MQ=255) catcatAAAGTTCACTGTTGGATAATTTGCAAATATCTTGCCCGTCGAACAGAATTTCACCTTCGGAAGGCATCAGCTGACCGCCGATGAGTTTCAAAAGGGTGGTTTTACCAATCCCTGACGGTCCCATAATGGCGGTAATTTTGTCGCGGGGAACGCGCAAATTc > 1:683341/1‑167 (MQ=255) catcatAAAGTTCACTGTTGGATAATTTGCAAATATCTTGCCCGTCGAACAGAATTTCACCTTCGGAAGGCATCAGCTGACCGCCGATGAGTTTCAAAAGGGTGGTTTTACCAATCCCTGACGGTCCCATAATGGCGGTAATTTTGTCGCGGGGAACGCGCAAATTCAGATCGTGGGAAATAATCCGTTCACCCCGTTTAAACg > 1:860872/1‑204 (MQ=255) catcatAAAGTTCACTGTTGGATAATTTGCAAATATCTTGCCCGTCGAACAGAATTTCACCTTCGGAAGGCATCAGCTGACCGCCGATGAGTTTCAAAAGGGTGGTTTTACCAATCCCTGACGGTCCCATAATGGCGGTAATTTTGTCGCGGGGAACGCGCAAAATCAGATCGTGGGAAATAATCCGTTCACCGCGTTTAAACGTAAGGTGGTTTACTTCAATTAACGTTTCGTTCATAAAACTGCTAggg > 1:422377/1‑250 (MQ=255) tcatAAAGTTCACTGTTGGATAATTTGCAAATATCTTGCCCGTCGAACAGAATTTCCCCTTCGGAAGGCATCAGCTGACCGCCGATGAGTTTCAAAAGGGTGGTTTTACCAATCCCTGACGGTCCCATAATGGCGGTAATTTTGTCGCGGGGAACGCGCAAATTCAGATCGTGGTAAATAATCCGTTCACCGCGTTTAAACGTAAGGTGTTTTACTTCAATTAACGTTTCGTTCATAAAACTGCTAGGTTa < 1:176965/251‑1 (MQ=255) tcatAAAGTTCACTGTTGGATAATTTGCAAATATCTTGCCCGTCGAACAGAATTTCACCTTCGGAAGGCATCAGCTGACCGCCGATGAGTTTCAAAAGGGTGGTTTTACCAATCCCTGACGGTCCCATAATGGCGGTAATTTTGTCGCgggg < 1:694928/152‑1 (MQ=255) tcatAAAGTTCACTGTTGGATAATTTGCAAATATCTTGCCCGTCGAACAGAATTTCACCTTCGGAAGGCATCAGCTGACCGCCGATGAGTTTCAAAAGGGTGGTTTTACCAATCCCTGACGGTCCCATAATGGCGGTAATTTTGTCGCGGGGAACGCGCAAATTCAGATCGTGGTAaat > 1:719822/1‑179 (MQ=255) tcatAAAGTTCACTGTTGGATAATTTGCAAATATCTTGCCCGTCGAACAGAATTTCACCTTCGGAAGGCATCAGCTGACCGCCGATGAGTTTCAAAAGGGTGGTTTTACCAATCCCTGACGGTCCCATAATGGCGGTAATTTTGTCGCGGGGAACGCGCAAATTCAGATCGTGGTAaat < 1:221479/179‑1 (MQ=255) 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GGCGAGCGCGGCACGACGCGCCATCCCGCCGGAAAGTTCGGAAGGCATTAAATCGGCGGCACCGCGCAAGCCCACCGCTTCGAGTTTCATTAATACTATTTTTCTAATCAACGACGGAGGCAGATTGGTGTGCTCTCGAATAGGAAATGCCACATTATCAAAGGTGGAAATATCGGTGAATAATGCGCCGGATTGAAACAGCATACCCATGCGTTTGCGCACATCATAAAGTTCACTGTTGGATAGTTTGCAAATATCTTGCCCGTCGAACAGAATTTCACCTTCGGAAGGCATCAGCTGACCGCCGATGAGTTTCAAAAGGGTGGTTTTACCAATCCCTGACGGTCCCATAATGGCGGTAATTTTGTCGCGGGGAACGCGCAAATTCAGATCGTGGTAAATAATCCGTTCACCGCGTTTAAACGTAAGGTGTTTTACTTCAATTAACGTTTCGTTCATAAAACTGCTAGGTTACGGCTTGAATTGCCT > 1/1116189‑1116677 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |