| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,107,907 | G→A | intergenic (‑48354/‑24196) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,107,907 | 0 | G | A | 100.0% | 132.8 / NA | 50 | intergenic (‑48354/‑24196) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (24/26); total (24/26) | |||||||||||
GCTCATTAATGCCGGGTTGGTGGCGACCACAGCAGCATTGTCTGCGATGGCGGCTTCACCGGCATAGGCACGACCTAAACCGGAGGTGGAAATTTCTGCTAATTGGAATGCCGCGGCGGACGCACCTCCGGCAGCAGTTAATAACAGCGTGGATAGAAGGGTTTGAGTAAATTTGCGGGTTGTCATTTTTGTACCTTTTATTGAATTGGTTATCGTTTCTTAGGAAAACGTATCGTTCTAAAAAACAGGGGAATGTGGAGCAATCCTCTTTTCATATTTTGCGTAGTGTTCAGACCAGTGGACAAAGAAAAGTGCGGTCGGATTTTGTATTAAATTTGAATAATGCTAAAATAGTTGAAAATTTCAATTCTTTTTACAAGGAGATATTATGAGCACATTGAAATGTCAGGCGGAAGAAGCAAAAGTTTGCTGTTGTGTCGAGGTGGGTACGGTGATTG > 1/1107673‑1108130 | gCTCATTAATGCCGGGTTGGTGGCGACCACAGCAGCATTGTCTGCGATGGCGGCTTCACCGGCATAGGCACGACCTAAACCGGAGGTGGAAATTTCTGCTAATTGGAATGCCGCGGCGGACGCACCTCCGGCAGCAGTTAATAACAGCGTGGATAGAAGGGTTTGAGTAAATTTGCGGGTTGTCATTTTTGTACCTTTTATTGAATTGGTTATCGTTTCTTAGGAAAACGTATCATTCTAAAAAACAg < 1:258149/248‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) | GCTCATTAATGCCGGGTTGGTGGCGACCACAGCAGCATTGTCTGCGATGGCGGCTTCACCGGCATAGGCACGACCTAAACCGGAGGTGGAAATTTCTGCTAATTGGAATGCCGCGGCGGACGCACCTCCGGCAGCAGTTAATAACAGCGTGGATAGAAGGGTTTGAGTAAATTTGCGGGTTGTCATTTTTGTACCTTTTATTGAATTGGTTATCGTTTCTTAGGAAAACGTATCGTTCTAAAAAACAGGGGAATGTGGAGCAATCCTCTTTTCATATTTTGCGTAGTGTTCAGACCAGTGGACAAAGAAAAGTGCGGTCGGATTTTGTATTAAATTTGAATAATGCTAAAATAGTTGAAAATTTCAATTCTTTTTACAAGGAGATATTATGAGCACATTGAAATGTCAGGCGGAAGAAGCAAAAGTTTGCTGTTGTGTCGAGGTGGGTACGGTGATTG > 1/1107673‑1108130 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |