| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,107,152 | A→C | intergenic (‑47599/‑24951) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,107,152 | 0 | A | C | 100.0% | 186.1 / NA | 65 | intergenic (‑47599/‑24951) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (32/33); total (32/33) | |||||||||||
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(MQ=255) attGATAGTTCTTTGTGCTAAACCGTCAGCAATAGCCTGCGGAATTGTCGGATTTTTGGCTCTTATTCTCGCGCTTAATAATCTTTTTACAt > 1:433647/1‑92 (MQ=255) attGATAGTTCTTTGTGCTAAACCGTCAGCAATAGCCTGCGGAATTGTCGGATTTTTGGCTCTTATTCTCGCGCTTAATAATCTTTTCACATTGTCCTCACCCATAGAATTCAGTGCATTTTTGACACCGGTAATGGCGATACCGGCAGTGCGATCAAGTTCTGCTTTCGCATAGACACCATTTAAACCGAAACCGGCAGTTAAATTATTAGTAATACGGTATGACCCACTAAGATTCAGACTAATGGCgg > 1:556570/1‑251 (MQ=255) tGATAGTTCTTTGTGCTAAACCGTCAGCAATAGCCTGCGGAATTGTCGGATTTTTGGCTCTTATTCTCGCGCTTAATAATCTTTTTACATTGTCCTCACCCATAGAATTCAGTGCATTTTTGACACCGGTAATGGCGATACCGGCAGTGCGATCAAGTTCTGCTTTCGCATAGACACCATTTAAACCGAAACCGGCAGTTAAATTATTAGTAATACGGTATGACCCACTAAGATTCAGAc < 1:882190/240‑1 (MQ=255) tAGTTCTTTGTGCTAAACCGTCAGCAATAGCCTGCGGAATTGTCGGATTTTTGGCTCTTATTCTCGCGCTTAATAATCTTTTTACATTGTCCTCACCCATAGAATTCAGTGCATTTTTGACACCGGTAATGGCGATACCGGCAGTGCGATCAAGTTc < 1:253072/157‑1 (MQ=255) | GTAATTTTAAGGTTAAACTGCCTTTACCGATATAAGGACCTAGTACACCATTATGTTGTTGTAAACTGAGTGCATTGCGATCTTTAAAATCAATATCGACTTTGGAATGGTAGGCGAGACCAAGACGATTATCTTGATCAAACTCGTAAACCAAACCTGTATTCCAACCGAATCCCCAAGCATTGTCTCTTAGGTGTACAAGCGAATCTGCTTTATCCAGATTTTTTAAATTATTGATAGTTATTTGTGCTAAACCGTCAGCAATAGCCTGCGGAATTGTCGGATTTTTGGCTCTTATTCTCGCGCTTAATAATCTTTTTACATTGTCCTCACCCATAGAATTCAGTGCATTTTTGACGCCGGTAATGGCGATACCGGCAGTGCGATCAAGTTCTGCTTTCGCATAGACACCATTTAAACCGAAACCGGCAGTTAAATTATTAGTAATACGGTATGACCCACTAAGATTCAGACTAATGGCGG > 1/1106910‑1107392 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |