| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,091,131 | T→C | intergenic (‑31578/‑40972) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,091,131 | 0 | T | C | 100.0% | 175.4 / NA | 61 | intergenic (‑31578/‑40972) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (30/31); total (30/31) | |||||||||||
CTCATATTGCATAATCACTTTCTCTACCGTTAACGCCTGTTCAGACGAAGCGAATAGCGATTTTACGTAACTATTGGCAGGCTGTTGCTGGATTTCGTTTGGTGTACCTACTTGTACCAGCTTCCCATTCTGCATGACGCCAATGCGACAAGCAAGTTTTAAGGCTTCTTGCATGTCATGAGTAACGAACACGATAGTTGTGCCGAATTTTTTATGGATCAACGAAATTTGATCTTGTAAGGCAGCCCGCACCAGTGGATCAAGTGCAGAAAATGGTTCATCCATGAGCAATAAATGGGGATTAGCAGCAATAGCCCGTAAAATGCCTATCCGTTGTTGTTCTCCACCGGAAAGTTCGCGCGGATAGCGATCCTGATATTGCGCAGGTGGCAAATTCACTAATTCAAGTAATGTATTCACACGGGATTTTCGCTCATTTTTGTGCCACCCAAGAAT > 1/1090897‑1091352 | cTCATATTGCATAATCACTTTCTCTACCGTTAACGCCTGTTCAGACGAAGCGAATAGCGATTTTACGTAACTATTGGCAGGCTGTTGCTGGATTTCGTTTGGTGTACCTACTTGTACCAGCTTCCCATTCTGCATGACGCCAATGCGACAAGCAAGTTTTAAGGCTTCTTGCATGTCATGAGTAACGAACACGATAGTTGTGCCGAATTTTTTATGGATCAACGAAATTTGATCCTGTAAGGCAg > 1:255151/1‑245 (MQ=255) atatTGCATAATCACTTTCTCTACCGTTAACGCCTGTTCAGACGAAGCGAATAGCGATTTTACGTAACTATTGGCAGGCTGTTGCTGGATTTCGTTTGGTGTACCTACTTGTACCAGCTTCCCATTCTGCATGACGCCAATGCGACAAGCAAGTTTTAAGGCTTCTTGCATGTCATGAGTAACGAACACGATAGTTGTGCCGAATTTTTTATGGATCAACGAAATTTGATCCTGTAAGGc > 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1:556438/202‑1 (MQ=255) | CTCATATTGCATAATCACTTTCTCTACCGTTAACGCCTGTTCAGACGAAGCGAATAGCGATTTTACGTAACTATTGGCAGGCTGTTGCTGGATTTCGTTTGGTGTACCTACTTGTACCAGCTTCCCATTCTGCATGACGCCAATGCGACAAGCAAGTTTTAAGGCTTCTTGCATGTCATGAGTAACGAACACGATAGTTGTGCCGAATTTTTTATGGATCAACGAAATTTGATCTTGTAAGGCAGCCCGCACCAGTGGATCAAGTGCAGAAAATGGTTCATCCATGAGCAATAAATGGGGATTAGCAGCAATAGCCCGTAAAATGCCTATCCGTTGTTGTTCTCCACCGGAAAGTTCGCGCGGATAGCGATCCTGATATTGCGCAGGTGGCAAATTCACTAATTCAAGTAATGTATTCACACGGGATTTTCGCTCATTTTTGTGCCACCCAAGAAT > 1/1090897‑1091352 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |