| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,089,761 | G→A | intergenic (‑30208/‑42342) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,089,761 | 0 | G | A | 100.0% | 194.2 / NA | 72 | intergenic (‑30208/‑42342) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (32/40); total (32/40) | |||||||||||
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cacaTACTGGATACTGTCATGGCACATGGATTCAGCGTGGATAATGTGAATTTCGGTATGGGAGGCGGCTTGTTGCAACAGGTTAACCGTGACATGATGGGCTGGGCGATGAAGGCAAGTGCGGTGAGTGTTGCAGGCAAATGGCGTGATGTATATAAAGATCCCGTTACCGGTGCGGAAAAACGTTCGAAAAAAGGACGGCTTGCCTTAGTCagaag < 1:592012/218‑1 (MQ=255) caTACTGGATACTGTCATGGCACATGGATTCAGCGTGGATAATGTGAATTTCGGTATGGGAGGCGGCTTGTTGCAACAGGTTAACCGTGACATGATGGGCTGGGCGATGAAGGCAAGTGCGGTGAGTGTTGCAGGc < 1:404934/136‑1 (MQ=255) caTACTGGATACTGTCATGGCACATGGATTCAGCGTGGATAATGTGAATTTCGGTATGGGAGGCGGCTTGTTGCAACAGGTTAACCGTGACATGATGGGCTGGGCGATGAAGGCAAGTGCGGTGAGTGTTGCAGGCAAATGGCGTGATGTATATAAAGATCCCGTTACCGGTGCGGAAAAACGTTCGAAAAAAGGACGGCTTGCCTTAGTCAGAAGAAATGGCGAATATCTAACtt > 1:278716/1‑236 (MQ=255) caTACTGGATACTGTCATGGCACATGGATTCAGCGTGGATAATGTGAATTTCGGTATGGGAGGCGGCTTGTTGCAACAGGTTAACCGTGACATGATGGGCTGGGCGATGAAGGCAAGTGCGGTGAGTGTTGCAGGCAAATGGCGTGATGTATATAAAGATCCCGTTACCGGTGCGGAAAAACGTTCGAAAAAAGGACGGCTTGCCTTAGTCAGAAGAAATGGCGAATATCTAACTTTGCGCGaagaagaag > 1:893053/1‑251 (MQ=255) caTACTGGATACTGTCATGGCACATGGATTCAGCGTGGATAATGTGAATTTCGGTATGGGAGGCGGCTTGTTGCAACAGGTTAACCGTGACATGATGGGCTCGGCGATGAAGGCAAGTGCGGTGAGTATTGCAGGAAAATGGCGTGATGTATATAAAGATCCCGTTACCGGTGCGGAAAAACGTTCGAAAAAAGGACGGCTTGCCTTAGTCAGAAGAAATGGCGAATATCTAACTTTGCGCGaagaagaag < 1:579623/251‑1 (MQ=255) aTACTGGATACTGTCATGGCACATGGATTCAGCGTGGATAATGTGAATTTCGGTATGGGAGGCGGCTTGTTGCAACAGGTTAACCGTGACATGATGGGCTGGGCGATGAAGGCAAGTGCGGTGAGTGTTGCAGGCAAATGGCGTGATGTATATAAAGa > 1:337303/1‑158 (MQ=255) aTACTGGATACTGTCATGGCACATGGATTCAGCGTGGATAATGTGAATTTCGGTATGGGAGGCGGCTTGTTGCAACAGGTTAACCGTGACATGATGGGCTGGGCGATGAAGGCAAGTGCGGTGAGTGTTGCAGGCAAATGGCGTGATGTATATAAAGATCCCGTTACCGGTGCGGAAAAACGTTCGAAAAAAGGACGGCTTGCCTTAGTCAGAAGAAATGGCGAATATCTAACTTTGCGCGAAGAAGAAGt > 1:279909/1‑251 (MQ=255) tACTGGATACTGTCATGGCACATGGATTCAGCGTGGATAATGTGAATTTCGGTATGGGAGGCGGCTTGTTGCAACAGGTTAACCGTGACATGATGGGCTGGGCGATGAAGGCAAGTGCGGTGAGTGTTGCAGGCAAATGGCGTGATGTATATAAAGATCCCGTTACCGGTGCGGAAAAACGTTCGAAAAAAGGACGGCTTGCCTTAGTCAGAAGAAATGGCGAATATCTAACTTTGCGCGAAGAAGAAGTg > 1:60606/1‑251 (MQ=255) aCTGGATACTGTCATGGCACATGGATTCAGCGTGGATAATGTGAATTTCGGTATGGGAGGCGGCTTGTTGCAACAGGTTAACCGTGACATGATGGGCTGGGCGATGAAGGCAAGTGCGGTGAGTGTTGCAGGCAAATGGCGTGATGTATATAAAg > 1:732400/1‑155 (MQ=255) ggATACTGTCATGGCACATGGATTCAGCGTGGATAATGTGAATTTCGGTATGGGAGGCGGCTTGTTGCAACAGGTTAACCg < 1:456228/81‑1 (MQ=255) | CAGGTGGTTAATGAAGTTTGGGGGGAACGATTTAAGCAGCAGATTTCACAAATGTCGGGAACTTTGATAATTCGTCCTGACAGCGGTGAACCGGGCACGGTAATTTGTCGCGTACTGGATATTTTGGCTGAAAAGTTCGGAACAAGAATAAATAGTAAGGGTTATAAAGTATTGCCGGATTGCATTCGTGTCATTCAGGGGGATGGAATTAATTATACTTCATTGACACACATACTGGATGCTGTCATGGCACATGGATTCAGCGTGGATAATGTGAATTTCGGTATGGGAGGCGGCTTGTTGCAACAGGTTAACCGTGACATGATGGGCTGGGCGATGAAGGCAAGTGCGGTGAGTGTTGCAGGCAAATGGCGTGATGTATATAAAGATCCCGTTACCGGTGCGGAAAAACGTTCGAAAAAAGGACGGCTTGCCTTAGTCAGAAGAAATGGCGAATATCTAACTTTGCGCGAAGAAGAAGTG > 1/1089521‑1090003 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |