| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,086,922 | A→G | intergenic (‑27369/‑45181) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,086,922 | 0 | A | G | 100.0% | 141.9 / NA | 53 | intergenic (‑27369/‑45181) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (19/34); total (19/34) | |||||||||||
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1:8451/1‑251 (MQ=255) tCACCACATGATGCAATTTAATGAAAGAGAGCAGTACGTCGAAATCCGACGGTTGGGTGGCGTTTTCTAAGTCCGTTTGCCAATGATCTAAATTTAAGCCGTTTTCATTGAGCAACATTTTGTTGGAATTCGCGAGGGCGCAAACGCGAATTTCAATGTCTTTCTTTGCTAAATACTCTTTTTGGTGTTTGATTTGCTCAATTAATTCGCCGCCGACACCGCCGACACCCACAAGAAACACTTCAACGAt > 1:692739/1‑250 (MQ=255) caTGATGCAATTTAATGAAAGAGAGCAGTACGTCGAAATCCGACGGTTGGGTGGCGTTTTCTAAGTCCGTTTGCCAATGATCTAAATTTAAGCCGTTTTCATTGAGCAACATTTTGTTGGAATTCGCGAGGGCGCAAACGCGAATTTCAATGTCTTTCTTTGCTAAATACTCTTTTTGGTGTTTGATTTGCTCAATTAATTCGCCGCCGACACCGCCGACACCCACAAg < 1:394612/229‑1 (MQ=255) caTGATGCAATTTAATGAAAGAGAGCAGTACGTCGAAATCCGACGGTTGGGTGGCGTTTTCTAAGTCCGTTTGCCAATGATCTAAATTTAAGCCGTTTTCATTGAGCAACATTTTGTTGGAATTCGCGAGGGCGCAAACGCGAATTTCAATGTCTTTCTTTGCTAAATACTCTTTTTGGTGTTTGATTTGCTCAATTAATTCGCCGCCGACACCGCCGACACCCACAAGAAACACTTCAACGATCTTTTTg < 1:361825/251‑1 (MQ=255) 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CAATCCACGAAAACCGGGTTCACCACATGATGCAATTTAATGAAAGAGAGCAGTACGTCGAAATCCGATGGTTGGGTGGCGTTTTCTAAGTCCGTTTGCCAATGATCTAAATTTAAGCCGTTTTCATTGAGCAACATTTTGTTGGAATTCGCGAGGGCGCAAACGCGAATTTCAATGTCTTTCTTTGCTAAATACTCTTTTTGGTGTTTGATTTGCTCAATTAATTCGCCACCGACACCGCCGACACCCACAAGAAACACTTCAACGATCTTTTTGTTATTAAATAACGCTTGGTGCGTTGCTTTTACGGCCTCAATGGCTTTATTTTGCGCCACCACGGCGGAAATTGAACGTTCGGAAGAACCTTGGGCAATGGCGTTAATGCTGATGTTTGCCTGTGCCAGCGCAGAGAAGAAGCGCGCGGCAATGCCTTTAGCTTGGCGCATACC > 1/1086692‑1087140 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |