| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 1,073,517 | G→A | intergenic (‑13964/‑58586) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,073,517 | 0 | G | A | 100.0% | 168.5 / NA | 63 | intergenic (‑13964/‑58586) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (34/29); total (34/29) | |||||||||||
ATATTTTACCTCTGGCAGACACCTTGGCGCAAAATGGTTTGCCGGTGGCGGAAATCACCTTTCGCTCCCCTGCCGCCGCAGAAGCCATTCGTTTATTACGTCAACAGCGCCCGGAATTTCTGATTGCGGCGGGAACCGTATTGACCGCCGAACAGGTCGTCGCCGCTAAAAACAGCGGTGCAGATGTGGTCGTCACACCGGGATTTAATCCTAAAATCGTGCAATTATGTCAGGATTTAGCGTTGCCCATCACACCGGGGGTAAACAATCCGATGGCAATTGAAGCCGCGTTGGACGTCGGTATTGAAACCGTGAAATTCTTCCCGGCGGAAGCCTCTGGTGGCGTGAAAATGATTAAAGCCTTGTTAGGCCCTTACGCACAGTTGCAAATTATGCCGACCGGCGGTATCGGTATGCAGAATATTAAAGACTATCTGGCAATTCCCAATGTGGTGGCATGTGGCGGTTCTTGGTTTGTAGAAA > 1/1073273‑1073755 | atatTTTACCTCTGGCAGACACCTTGGCGCAAAATGGTTTGCCGGTGGCGGAAATCACCTTTCGCTCCCCTGCCGCCGCAGAAGCCATTCGTTTATTACGTCAACAGCGCCCGGAATTTCTGATTGCGGCGGGAACCGTATTGACCGCCGAACAGGTCGTCGCCGCTAAAAAAAGCGGGGCAGATGTGGTCGTCACACCGGGATTTAATCCTAAAATCGTGCAATTATGTCAGGATTTAGCGTTACCCAt > 1:51953/1‑250 (MQ=255) 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tttACCTCTGGCAGACACCTTGGCGCAAAATGGTTTGCCGGTGGCGGAAATCACCTTTCGCTCCCCTGCCGCCGCAGAAGCCATTCGTTTATTACGTCAACAGCGCCCGGAATTTCTGATTGCGGCGGGAACCGTATTGACCGCCGAACAGGTCGTCGCCGCTAAAAACAGCGGTGCAGATGTGGTCGTCACACCGGGATTTAATCCTAAAATCGTGCAATTATGTCAGGATTTAGCGTTACCCATCacac < 1:821097/251‑1 (MQ=255) ttACCTCTGGCAGACACCTTGGCGCAAAATGGTTTGCCGGTGGCGGAAATCACCTTTCGCTCCCCTGCCGCCGCAGAAGCCATTCGTTTATTACGTCAACAGCGCCCGGAATTTCTGATTGCGGCGGGAACCGTATTGACCGCCGAACAGGTCGTCGCCGCTAAAAACAGCGGTGCAGATGTGGTCGTCACACCGGGATTTAATCCTAAAATCGTGCAATTATGTCAGGATTTAGCGTTACCCATCACAcc < 1:221183/251‑1 (MQ=255) aCCTCTGGCAGACACCTTGGCGCAAAATGGTTTGCCGGTGGCGGAAATCACCTTTCGCTCCCCTGCCGCCGCAGAAGCCATTCGTTTATTACGTCAACAGCGCCCGGAATTTCTGATTGCGGCGGGAACCGTATTGAACGCCCAACAGGACGTCGCCGCCAAAAACAGCGGGGCAGATGTGGTCGTCACACCCGGATTTAATTCTAAAATCGTGCAAATATGTCAGGATTTATCGGTACCCATCACAcccg > 1:234711/1‑249 (MQ=255) 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ccTAAAATCGTGCAATTATGTCAGGATTTAGCGTTACCCATCACACCGGGGGTAAACAATCCGATGGCAATTGAAGCCGCGTTGGACGTCGGTATTGAAACCGTGAAATTCTTCCCGGCGGAAGCCTCTGGTGGCGTGAAAATGATTAAAGCCTTGTTAGGCCCTTACGCACAGTTGCAAATTATGCCGACCGGCGGTATCGGTATGCAGAATATTAAAg < 1:819062/220‑1 (MQ=255) ttATGTCAGGATTTAGCGTTACCCATCACACCGGGGGTAAACAATCCGATGGCAATTGAAGCCGCGTTGGACGTCGGTATTGAAACCGTGAAATTCTTCCCGGCGGAAGCCTCTGGTGGCGTGAAAATGATTAAAGCCTTGTTAGGCCCTTACGcac < 1:526051/157‑1 (MQ=255) aTGTCAGGATTTAGCGTTACCCATCACACCGGGGGTAAACAATCCGATGGCAATTGAAGCCGCGTTGGACGTCGGTATTGAAACCGTGAAATTCTTCCCGGCGGAAGCCTCTGGTGGCGTGAAAATGATTAAAGCCTTGTTAGGCCCTTACGCACAGTTGCAAATTATGCCGACCGGCGGTATCGGTATGCAGAATATTAAAGACTATCTGGCAATTCCCAATGTGGTGGCATGTGGCgggttttgggttt > 1:416721/1‑240 (MQ=255) tGTCAGGATTTAGCGTTACCCATCACACCGGGGGTAAACAATCCGATGGCAATTGAAGCCGCGTTGGACGTCGGTATTg < 1:462973/79‑1 (MQ=255) gATTTAGCGTTACCCATCACACCGGGGGTAAACAATCCGATGGCAATTGAAGCCGCGTTGGACGTCGGTATTGAAACCGTGAAATTCTTCCCGGCGGAAGCCTCTGGTGGCGTGAAAATGATTAAAGCCTTGTTAGGCCCTTACGCACAGTTGCAAATTATGCCGACCGGCGGTATCGGTATGCAGAATATTaa > 1:585613/1‑194 (MQ=255) gATTTAGCGTTACCCATCACACCGGGGGTAAACAATCCGATGGCAATTGAAGCCGCGTTGGACGTCGGTATTGAAACCGTGAAATTCTTCCCGGCGGAAGCCTCTGGTGGCGTGAAAATGATTAAAGCCTTGTTAGGCCCTTACGCACAGTTGCAAATTATGCCGACCGGCGGTATCGGTATGCAGAATATTAAAGACTATCTGGCAATTCCCAATGTGGTGGCATGTGGCGGTTCTTGGTTTGTagaaa < 1:506129/250‑1 (MQ=255) gCGTTACCCATCACACCGGGGGTAAACAATCCGATGGCAATTGAAGCCGCGTTGGACGTCGGTATTGAAACCGTGAAATTCTTCCCGGCGGAAGCCTCTGGTGGCGTGAAAATGATTAAAGCCTTGTTAGGCCCTTACGcac > 1:864720/1‑142 (MQ=255) gCGTTACCCATCACACCGGGGGTAAACAATCCGATGGCAATTGAAGCCGCGTTGGACGTCGGTATTGAAACCGTGAAATTCTTCCCGGCGGAAGCCTCTGGTGGCGTGAAAATGATTAAAGCCTTGTTAGGCCCTTACGCACAGTTGCAAATTATGCCGACCGGCGGTATCGGTATGCAg < 1:143394/180‑1 (MQ=255) | ATATTTTACCTCTGGCAGACACCTTGGCGCAAAATGGTTTGCCGGTGGCGGAAATCACCTTTCGCTCCCCTGCCGCCGCAGAAGCCATTCGTTTATTACGTCAACAGCGCCCGGAATTTCTGATTGCGGCGGGAACCGTATTGACCGCCGAACAGGTCGTCGCCGCTAAAAACAGCGGTGCAGATGTGGTCGTCACACCGGGATTTAATCCTAAAATCGTGCAATTATGTCAGGATTTAGCGTTGCCCATCACACCGGGGGTAAACAATCCGATGGCAATTGAAGCCGCGTTGGACGTCGGTATTGAAACCGTGAAATTCTTCCCGGCGGAAGCCTCTGGTGGCGTGAAAATGATTAAAGCCTTGTTAGGCCCTTACGCACAGTTGCAAATTATGCCGACCGGCGGTATCGGTATGCAGAATATTAAAGACTATCTGGCAATTCCCAATGTGGTGGCATGTGGCGGTTCTTGGTTTGTAGAAA > 1/1073273‑1073755 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |