| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,066,757 | T→C | intergenic (‑7204/‑65346) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,066,757 | 0 | T | C | 100.0% | 289.3 / NA | 99 | intergenic (‑7204/‑65346) | unknown/unknown | tRNA‑Ser‑GGA/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (55/44); total (55/44) | |||||||||||
ATACCATAATCCAGTAATTGCTGTTTTACATTTGTTTTCCACCAATTGACAGTATCCATATTAGTAAAATCTAAATGTGAACCTTCATCATCCCAAAACATGGATCTTTCAGGGCTATCAGATTCAGAATCTTTAATAAATAGTCCTAATTTTTCCACTTCTTGATAGCGTGGATGGTCTTGTAATAAACAAGGTTTAATATTTGCAGCTAATTTCATTCCAGCATGGTGGAAATGTTTTGTTATTTCTTTTGGTTGTGGAACTTTGTCATAATTCCAGTTAAAGACATAACGTTTCCCATTAATAGATGTATAACCTGATGAGAGCTGGAATGAATCACAGGGAATGTTATGTTCATCGCATAAATCTACGAATTTTTTAAGTTGCTCTTGTGCATCAGGTGCATCGGTGTAATACATTGTAGAACCGCTATAACCCAAGCTCCATTTGGGGCCGAAGATAGTGCCACCGGTTAATTGGCAATA > 1/1066515‑1066999 | aTACCATAATCCAGTAATTGCTGTTCTACATTTGTTTTCCACCAATTGACAGTATCCATATTAGTAAAATCTAAATGTGAACCTTCATCATCCCAAAACATGGATCTTTCAGGGCTATCAGATTCAGAATCTTTAATAAATAGTCCTAATTTTTCCACTTCTTGATAGCGTGGATGGTCTTGTAATAAACAAGGTTTAATATTTGCAGCTAATTTCATTCCAGCATGGTGGAAATGTTTTGTCATTTCttt < 1:42113/251‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |