| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,029,085 | C→T | intergenic (‑22629/‑6134) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,029,085 | 0 | C | T | 100.0% | 182.4 / NA | 68 | intergenic (‑22629/‑6134) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (39/29); total (39/29) | |||||||||||
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gCCATAATAACATTTGGTCTTTAATCGACCGAAAAAGCGCTCCATTGCACGATTATCAAGGCAGTTACCTTTTCCCGACATACTTTGCCTAATGGCCTTTTCCTTCAATAAACGCTGATAACCTTGCATTTGATATTGCCATCCTTGGTCTGAATGAAGAATTGGCGTAGTGCCGTCCAACTTTAACATCGTCTGTTCCATCATTCTTGTTATCTGTTCAAAATTCGGACTTGGCGACAAGTCATAGGCGa > 1:652036/1‑251 (MQ=255) ataataACATTTGGTCTTTAATCGACCGAAAAAGCGCTCCATTGCACGATTATCAAGGCAGTTACCTTTTCCCGACATACTTTGCCTAATGGCCTTTTCCTTCAATAAACGCTGATAACCTTGCATTTGATATTGCCATCCTTGGTCTGAATGAAGAATTGGCGTAGTGCCGTCCAACTTTAACATCGTCTGTTCCATCATTCTTGTTATCTGTTCAAAATTCGGACTTGGCGACAAGTCATAGGCGATaa > 1:693369/1‑251 (MQ=255) taataaCATTTGGTCTTTAATCGACCGAAAAAGCGCTCCATTGCACGATTATCAAGGCAGTTACCTTTTCCCGACATACTTTGCCTAATGGCCTTTTCCTTCAATAAACGCTGATAACCTTGCATTTGATATTGCCATCCTTGGTCTGAATGAAGAATTGGCGTAGTGc < 1:302747/169‑1 (MQ=255) taataaCATTTGGTCTTTAATCGACCGAAAAAGCGCTCCATTGCACGATTATCAAGGCAGTTACCTTTTCCCGACATACTTTGCCTAATGGCCTTTTCCTTCAATAAACGCTGATAACCTTGCATTTGATATTGCCATCCTTGGTCTGAATGAAGAATTGGCGTAGTGCCGTCCAACTTTAACATCGTCTGTTCCATCATTCTTGTTATCTGTTCAAAATTCGGACTTGGCGACAAGTCATAGGCGATAAt > 1:565646/1‑251 (MQ=255) cATTTGGTCTTTAATCGACCGAAAAAGCGCTCCATTGCACGATTATCAAGGCAGTTACCTTTTCCCGACATACTTTGCCTAATGGCCTTTTCCTTCAATAAACGCTGATAACCTTGCATTTGATATTGCCATCCTTGGTCTGAATGAAGAATTGGCGTAGTGCCGTCCAACTTTAACATCGTCTGTTCCATCATTCTTGTTATCTGTTCAAAATTCGGACTTGGCGACAAGTCATAGGCGATAATTTCGc > 1:334562/1‑250 (MQ=255) | TGAATAATTTTTCTGGGTTTGCGCGTAGTCCTTTTAATTTTACTTGAATACATTCATGGTTGTAGTAATGAACGTATTCGTGGAGCGTTTTCTCAAGTTGCGCGAAGGTTTCAAACCGCTTGCCATAATAACATTCGGTCTTTAATCGACCGAAAAAGCGCTCCATTGCACGATTATCAAGGCAGTTACCTTTTCCCGACATACTTTGCCTAATGGCCTTTTCCTTCAATAAACGCTGATAACCTTGCATTTGATATTGCCATCCTTGGTCTGAATGAAGAATTGGCGTAGTGCCGTCCAACTTTAACATCGTCTGTTCCATCATTCTTGTTATCTGTTCAAAATTCGGACTTGGCGACAAGTCATAGGCGATAATTTCGC > 1/1028950‑1029330 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |