| Predicted mutation | ||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | 1 | 1,020,427 | 0 | G | A | 100.0% | 202.6 / NA | 76 | intergenic (‑13971/‑14792) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (32/44); total (32/44) | |||||||||||
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aGCTTAACGGCTCGTTCATTTTTTAACAATGAACTACCAA‑CAATGGCTGCAACAGGCCATACAAGCGTTAAATCAGGCGAAACCCTCGGAAAATGGCAAAACCGATGCACAGGGGTTATTGCAATTTTTGACGCAAAAGTCTCGCGCTTTTATTC‑GGCTTTCGGTGAAACGGCATTGGATGAAAAAACGCTGGAAAAACTGACCGCACTTTTAGCCTGCCGTTTGCAGGGCGAACCCATCGCTTATAtt > 1:237154/1‑249 (MQ=255) gCTTAACGGCTCGTTCATTTTTTAACAATGAACTACCAA‑CAATGGCTGCAACAGGGCATACAAGCGGTAAATCAGGCGAATCCCTCGGGAAATGGCAAAAACGATGCACAGGGGTTATTGCAATTTTTGACGCAAAAGTCTCGCGCTTTTATTCTGGCTTTCGGTGAAACGGCATTGGATGAAAAAACGCTgcgaattttg > 1:535897/1‑192 (MQ=255) gCTTAACGGCTCGTTCATTTTTTAACAATGAACTACCAA‑CAATGGCTGCAACAGGCCATACAAGCGTTAAATCAGGCGAATCCCTCGGAAAATGGCAAAACCGATGCACAGGTGTTATTGCAATTTGTGACGCAAAAGTCTCGCGCTTTTATTCTGGCTTTCGGTGAAACGGCATTGGATGAAAAAACGCTGGAAAAACTGACCGCACTTTTAGCCTGCCGTTTGCAGGGCGAACCCATCGCt < 1:836905/243‑1 (MQ=255) 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cTTAACGGCTCGTTCATTTTTTAACAATGAACTACCAA‑CAATGGCTGCAACAGGCCATACAAGCGTTAAATCAGGCGAATCCCTCGGAAAATGGCAAAACCGATGCACAGGTGTTATTGCAATTTGTGACGCAAAAGTCTCGCGCTTTTATTCTGGCTTTCGGTGAAACGGCATTGGATGAAAAAACGCTGGAAAAACTGACCGCACTTTTAGCCTGCCGTTTGCAGGGCGAACCCATCGCTTATATtc < 1:561415/249‑1 (MQ=255) ggCTCGTTCATTTTTTAACAATGAACTACCAA‑CAATGGCTGCAACAGGCCATACAAGCGTTAAATCAGGCGAATCCCTCGGAAAATGGCAAAACCGATGCACAGGTGTTATTGCAATTTGTGACGCAAAAGTCTCGCGCTTTTATTCTGGCTTTCGGTGAAACGGCATTGGATGaaaaa > 1:517502/1‑179 (MQ=255) cTCGTTCATTTTTTAACAATGAACTACCAA‑CAATGGCTGCAACAGGCCATACAAGCGTTAAATCAGGCGAATCCCTCGGAAAATGGCAAAACCGATGCACAGGTGTTATTGCAATTTGTGACGCAAAAGTCTCGCGCTTTTATTCTGGCTTTCGGTGAAACGGCATTGGATGAAAAAACGCTGGAAAAACTGACCGCACTTTTAGCCTGCCGTTTGCAGGGCGAACCCATCGCTTATATTCTCGGTGaaaa < 1:582942/251‑1 (MQ=255) ttttttAACAATGAACTACCAA‑CAATGGCTGCAACAGGCCATACAAGCGTTAAATCAGGCGAATCCCTCGGAAAATGGCAAAACCGATGCACAGGTGTTATTGCAATTTGTGACGCAAAAGTCTCGCGCTTTTATTCTGGCTTTCGGTGAAACGGCa < 1:139276/157‑1 (MQ=255) ttttttAACAATGAACTACCAA‑CAATGGCTGCAACAGGCCATACAAGCGTTAAATCAGGCGAATCCCTCGGAAAATGGCAAAACCGATGCACAGGTGTTATTGCAATTTGTGACGCAAAAGTCTCGCGCTTTTATTCTGGCTTTCGGTGAAACGGCATTGGATGAAAAAACGCTGGAAAAACTGACCGCACTTTTAGCCTGCCGTTTGCAGGGCGAACCCATCGCTTATATtcctgtctctttatacacat > 1:533333/1‑233 (MQ=255) ttttAACAATGAACTACCAA‑CAATGGCTGCAACAGGCCATACAAGCGTTAAATCAGGCGAATCCCTCGGAAAATGGCAAAACCGATGCACAGGTGTTATTGCAATTTGTGACGCAAAAGTCTCGCGCTTTTATTCTGGCTTTCGGTGAAACGGCATTGGATGAAAAAACGCTGGAAAAACTGACCGCACTTTTAGCCTGCCGTTTGCAGGGCGAACCCATCGCTTATATtc < 1:57471/231‑1 (MQ=255) ttttAACAATGAACTACCAA‑CAATGGCTGCAACAGGCCATACAAGCGTTAAATCAGGCGAATCCCTCGGAAAATGGCAAAACCGATGCACAGGTGTTATTGCAATTTGTGACGCAAAAGTCTCGCGCTTTTATTCTGGCTTTCGGTGAAACGGCATTGGATGAAAAAACGCTGGAAAAACTGACCGCACTTTTAGCCTGCCGTTTGCAGGGCGAACCCATCGCTTATATtc > 1:233139/1‑231 (MQ=255) tttAACAATGAACTACCAA‑CAATGGCTGCAACAGGCCATACAAGCGTTAAATCAGGCGAATCCCTCGGAAAATGGCAAAACCGATGCACAGGTGTTATTGCAATTTGTGACGCAAAAGTCTCGCGCTTTTATTCTGGCTTTCGGTGAAACGGCATTGGATGAAAAAACGCTGGAAAAACTGACCGCACTTTTAGCCTGCCGTTTGCAGGGCGAACCCATCGCTTATATTCTCGGTGAAAAAGAGTTTTGGt < 1:645523/251‑1 (MQ=255) | CGTCGTAATTTATTGGGTTCCGGCGATCGTTCCGATAAAATCCGCACTTACAATTACCCGCAAGGGCGCGTTACCGATCACCGTATTAACCTGACGATTTACCGCTTAGACGAAGTGATGAACGGCAAAATTGATGACTTGATTCAACCGATTATCACCGAATATCAAGCGGATCAGTTGGCGGCGTTGTCGGAGCAGAATTAACCATGAGAACGAGCTTAACGGCTCGTTCATTTTTTAACGATGAACTACCAA‑CAATGGCTGCAACAGGCCATACAAGCGTTAAATCAGGCGAATCCCTCGGAAAATGGCAAAACCGATGCACAGGTGTTATTGCAATTTGTGACGCAAAAGTCTCGCGCTTTTATTCTGGCTTTCGGTGAAACGGCATTGGATGAAAAAACGCTGGAAAAACTGACCGCACTTTTAGCCCGCCGTTTGCAGGGCGAACCCATCGCTTATATTCTCGGTGAAAAAGAGTTTTGGT > 1/1020185‑1020671 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |