| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,019,166 | G→A | intergenic (‑12710/‑16053) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,019,166 | 0 | G | A | 100.0% | 151.8 / NA | 55 | intergenic (‑12710/‑16053) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (28/27); total (28/27) | |||||||||||
ATCTGCAATCGGTGGTGGTACAGGTAGAGCGCTTGCAACGGCTGTTGGAGCAATTGCCGGTGCAGTTACCGGCAGTAAGGTTGAAGAAAAAGTCAGCCAAGTTAGCGCCTTGGAAATGGTAATCAAAAAAGATGACGGAAAAGAAATTGTTGTAGTGCAAAAAGCCGAACCTAACTTAGTGCCGGGTGCGCGGGTACGTATCGTCGGCGGTTCACGTTTGAACGTTTCTGCACTTTAGGTGCTACCTATTCCTAAAAGGCTTTTGGCGAAATCCGAAAGCCTTTTTTACAGCCTAAACTTCAACAACATTTTCATTCTGTGCTAGAATGCTCCGATTTTTTTATTTCCTTTTCTATTTTCCTTCTGAAGGTCAAATAATGAAACCCTCTATTATCAATAAATTAGATAGCTTAAAAGAACGTTATGAAGAGCTGGAAGCCTTGTTAGGCGATGCTTCCGTGATTAGCGATCAGGA > 1/1018929‑1019403 | aTCTGCAATCGGTGGTGGTACAGGTAGAGCGCTTGCAACGGCTGTTGGAGCAATTGCCGGTGCAGTTACCGGCAGTAAGGTTGAAGAAAAAGTCAGCCAAGTTAGCGCCTTGGAAATGGTAATCAAAAAAGATGACGGAAAAGAAATTGTTGTAGTGCAAAAAGCCGAACCTAACTTAGTGCCGGGTGCGCGGGTACGTATCGTCGGCGGTTCACGTTTGAACGTTTCTGCACTTTAAGT‑CTACCTATTc < 1:347780/250‑1 (MQ=255) 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tttCTGCACTTTAAGT‑CTACCTATTCCTAAAAGGCTTTTGGCGAAATCCGAAAGCCTTTTTTACAGCCTAAACTTCAACAACATTTTCATTCTGTGCTAGAATGCTCCGATTTTTTTATTTCCTTTTCTATTTTCCTTCTGAAGGTCAaataa > 1:77479/1‑153 (MQ=255) tttCTGCACTTTAAGT‑CTACCTATTCCTAAAAGGCTTTTGGCGAAATCCGAAAGCCTTTTTTACAGCCTAAACTTCAACAACATTTTCATTCTGTGCTAGAATGCTCCGATTTTTTTATTTCCTTTTCTATTTTCCTTCTGAAGGTCAAATAATGAAACCCTCTATTATCAATAAATTAGATAGCTTAAAAGAACGTTATGAAGAGCTGGAAGCCTTGTTAGGCGATGCTTCCGTGATTAGCGATCAGGa > 1:232685/1‑250 (MQ=255) | ATCTGCAATCGGTGGTGGTACAGGTAGAGCGCTTGCAACGGCTGTTGGAGCAATTGCCGGTGCAGTTACCGGCAGTAAGGTTGAAGAAAAAGTCAGCCAAGTTAGCGCCTTGGAAATGGTAATCAAAAAAGATGACGGAAAAGAAATTGTTGTAGTGCAAAAAGCCGAACCTAACTTAGTGCCGGGTGCGCGGGTACGTATCGTCGGCGGTTCACGTTTGAACGTTTCTGCACTTTAGGTGCTACCTATTCCTAAAAGGCTTTTGGCGAAATCCGAAAGCCTTTTTTACAGCCTAAACTTCAACAACATTTTCATTCTGTGCTAGAATGCTCCGATTTTTTTATTTCCTTTTCTATTTTCCTTCTGAAGGTCAAATAATGAAACCCTCTATTATCAATAAATTAGATAGCTTAAAAGAACGTTATGAAGAGCTGGAAGCCTTGTTAGGCGATGCTTCCGTGATTAGCGATCAGGA > 1/1018929‑1019403 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |