| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 1,016,238 | G→T | intergenic (‑9782/‑18981) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,016,238 | 0 | G | T | 100.0% | 263.4 / NA | 98 | intergenic (‑9782/‑18981) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (55/43); total (55/43) | |||||||||||
AGTTAAGGTAAATTTTTTGTAAAACAGTAGGTTATGTCACATTTATTCGCAATAATGGTTTGCCTTCCAGTCATTAATTGAGTATCCTTAGCCGCAACAAAAACAAGTGCTATATAAATAGCCAAACATATTTTGCTTTCCGAGTAGTGCCTCCTGTGAGGCACTTTTTTTATCCGATTTTTTCTCAATAACCTAGCAAGTTCCAAAATAAAAAATCCCGCGCTGAACGAACGGGATCTTTTGGAATTGGATGAAACTACATTCTCTCGACGGTTTTAATGCCCAGTAAATCTAATCCTTGTTTTAAGGTTCTTTCTGTTAATAACGCCAGTTTTAAACGGCTGAGTTTTACCTGTTGGTCTTCGTTATTGAGAATCGGGCAGTGCTCGTAGAAAGAAGAGAACACGCCTGCCAATTCATATAAATAGGCACAAAGAATGTGTGGCGTACCGTCTTTTGCCACGAGTTGAATGG > 1/1015996‑1016469 | aGTTAAGGTAAATTTTTTGTAAAACAGTAGGTTATGTCACATTTATTCGCAATAATGGTTTGCCTTCCAGTCATTAATTGAGTATCCTTAGCCGCAACAAAAACAAGTGCTATATAAATAGCCAAACATATTTTGCTTTCCGAGTAGTGCCTCCTGTGAGGCACTTTTTTTATCCTATTTTTTCTCAATAACCTAGCAAGTTCCAAAATAAAAAATCCCGCGCTGAACGAACGGGATCTTTTTGAATTGGa > 1:267050/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |