| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,010,615 | G→A | intergenic (‑4159/‑24604) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,010,615 | 0 | G | A | 100.0% | 179.0 / NA | 66 | intergenic (‑4159/‑24604) | unknown/unknown | tRNA‑Gly‑GCC/SSU rRNA ## 16S rRNA, small subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (39/27); total (39/27) | |||||||||||
GCCCCAAACGTTTTAATCAATATGGATTAATTTTAGTCTGCCCGATCACGCAAGGTGAAGCCTCAATTTCTAGAAAAGGTGGCTTTTATGTGAGTTTAATGGGATATGGTTTGGATACATTAGGTGGCGTTGTAGCCAATCAATCCAGAACATTAGATTGGCGTAATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACGGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTGGAGGATTTCGGACGTTGCTTGGTTTGTCCTTCCAGGCTTTCCTCCAGTTTGCGTAATAATTCTTTTTGCTCCTCGTTTAATTTAACCGGGG > 1/1010383‑1010850 | aaatgatacgttgaggtgaggtaatgaatacaagactagaaattaaacaatggggaaatagcaaggcaattcgcttaccgaaagattttattcatacactaaatcttgatacgggtgattttttagaattaaaccaagtggataataaatttattttaacggttaATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGa > 1:92083‑M2/166‑251 (MQ=255) 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(MQ=255) ccAAGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTGGAGGATTTCGGACGTTGCTTGGTTTGTCCTTCCAGGCTTTCCTCCAGTTTGCGTAATAATTCTTTTTGCTCCTCGTTTAATTTAACCgggg > 1:793584/1‑251 (MQ=255) aGATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTGGAGGATTTCGGACGTTGCTTGGTTTGTCCTTCCAGGCTTTCCTCCAGTTTGCGTAATAATTc > 1:302368/1‑219 (MQ=255) gATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGc < 1:111945/142‑1 (MQ=255) gATATTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTGGAGGATTTCGGACGTTGCTTGGTTTGTCCTTCCAGGCTTTCCTCCAg > 1:683898/1‑203 (MQ=255) atatTATCACAGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTAc > 1:412259/1‑139 (MQ=255) | GCCCCAAACGTTTTAATCAATATGGATTAATTTTAGTCTGCCCGATCACGCAAGGTGAAGCCTCAATTTCTAGAAAAGGTGGCTTTTATGTGAGTTTAATGGGATATGGTTTGGATACATTAGGTGGCGTTGTAGCCAATCAATCCAGAACATTAGATTGGCGTAATCGAGCGATTAAGAAAGTGGAAACTGCACCCATTGAGTTAGTGCAGGAAGTCCAAGATATTATCACGGCAATCGTTAATGATTGAGGGCGAAGATAATGCGAATAAAAAGTACGGTAGAAACACCAAAAATTTCTACCGCACTTTTCTGTTTTTAAACTGGTTTACTTCGTCAGATCATCAAAGAAACGTTTTACGCCATCTAAGAAGCTGGAGGATTTCGGACGTTGCTTGGTTTGTCCTTCCAGGCTTTCCTCCAGTTTGCGTAATAATTCTTTTTGCTCCTCGTTTAATTTAACCGGGG > 1/1010383‑1010850 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |