| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 1,000,155 | G→A | intergenic (+49581/+6010) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Leu‑CAG/tRNA‑Lys‑TTT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 1,000,155 | 0 | G | A | 100.0% | 93.0 / NA | 36 | intergenic (+49581/+6010) | unknown/unknown | tRNA‑Leu‑CAG/tRNA‑Lys‑TTT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (19/17); total (19/17) | |||||||||||
GGGTAGAAATACCAAGGGATTCGGTATTACTTTTTTTACTTAGCATTTTATGAAAAATAGAAAACATTATAGTTGCTTCATGTTTTAGTAAGGGGAACTGTTTAATGTTGCAGAATACAAGTGATGGACATCAAAACAACAAATAAGTGATCATTAAAAACGAACAAATATAGTGAGTGTAGTTCCAGCCTTTTGAAAAGGCCTTTTGACCTTTTTAGGTAAGACCTTTCCCTTGGGAAGGTTATCCTTAAATTTTACCCTTAGCCCGATAGGGCTCCCTTGGGCCTTTTACCTTTTGGCAATTTTGTTGTATGATTCCAAGATAGATCATTATTACAATCCGCGCGCGTTGGAGAAAATATGTTAAATCAAGCTAAATCAAAAAATGGGCAAACTCATCT‑TCAAGAAAGAGTTTTATCAATGTTTGAGCAATCCTTAACAGAAGAGCAGCGCTTTTTACAAGGTGTCTTAAATG > 1/999919‑1000393 | ggatagtaaTATCAAAGGATTCGGTATTAGATTTTTTACTTAGGATTTTATGAAAAATGGAAAAC‑‑‑ATAGTTGCTTCATATCTTAGTAAGGGGTGTTATTTAATGTTGCAGAATACAAGTGATGAATATCAAAACAACAAATAAGTGATCATTAAAAACAGATAAATATGGTGCGGGTTGTTCCTGCCTTTTGAAAAAGCCTTTTGGCCTTTTCAGGTAAGACCTTTCCCTTGGAAAGGTTATCCTTAAAtt > 1:839919/8‑251 (MQ=255) 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1:223244/1‑134 (MQ=255) ttCCTGCCTTTTGAAAAAGCCTTTTGGCCTTTTCAGGTAAGACCTTTCCCTTGGAAAGGTTATCCTTAAATTTTACCCTTAGCCCGCTAGGGCTCCCTTGTTCCTTTTACCTTTTTGCGGTTTTGTTGTATGATTTCAAGGTA‑‑‑‑‑‑T‑GTA‑GATC‑‑‑‑CGTGTTGGAGAAAATATGTTAAATCAAGCTAAATTAAAAAATGAGCAAACTCACTT‑TCAAGAAAGAGTATTATCAGTGTTTGAACAGTCCTTAACtgaag < 1:150462/251‑1 (MQ=255) ttttcAGGTAAGACCTTTCCCTTGGAAAGGTTATCCTTAAATTTTACCCTTAGCCCGCTAGGGCTCCCTTGTTCCTTTTACCTTTTTGCGGTTTTGTTGTATGATTTCAAGGTA‑‑‑‑‑‑T‑GTA‑GATC‑‑‑‑CGTGTTGGAGAAAATATGTTAAATCAAGCTAAATTAAAAAATGAGCAAACTCACTT‑TCAAGAAAGAGtattat > 1:609691/1‑195 (MQ=255) tttcaGGTAAGACCTTTCCCTTGGAAAGGTTATCCTTAAATTTTACCCTTAGCCCGCTAGGGCTCCCTTGTTCCTTTTACCTTTTTGCGGTTTTGTTGTATGATTTCAAGGTA‑‑‑‑‑‑T‑GTA‑GATC‑‑‑‑CGTGTTGGAGAAAATATGTTAAATCAAGCTAAATTAAAAAATGAGCAAACTCACTT‑TCAAGAAAGAGTATTATc < 1:99293/191‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |