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aaTTTATTGGAACATTAAAATGAGCTTACCCCCTGAAATGCTTTGTGGCAAATCGCGTGAACATTTAGTAAACCTGCCGATACCCCATTCACCCAATCATTTCTTACAGGCGCAGGCAGCGAAAGCCTTTCAAGGCTTACAAAAAAGTGCGGTAAAAAATGGCTTTAATTTACAGCCGGCGAGCAGTTTTCGTGATTTTGCACGTCAGCAGCTGATTTGGAATGGCAAATTTAACGCTGAACGTAAAGTg < 1:86381/250‑1 (MQ=255) aTTTATTGGAACATTAAAATGAGCTTAACCCCTGAAATGCTTTGTGGCAAATCGCGTGAACATTTAGTAAACCTGCCGATACCCCATTCACCCAATCATTTCTTAc > 1:536488/1‑106 (MQ=255) aTTTATTGGAACATTAAAATGAGCTTAACCCCTGAAATGCTTTGTGGCAAATCGCGTGAACATTTAGTAAACCTGCCGATACCCCATTCACCCAATCATTTCTTACAGGCGCAGGCAGCGAAAGCCTTTCAAGGCTTACAAAAAAGTGCGGTAAAAAATGGCTTTAATTTACAGCCGGCGAGCAGTTTTCGTGATTTTGCACGTCAGCAGCTGATTTGGAATGGCAAATTTAACGCTGAACGTAAAGTGCa > 1:107803/1‑251 (MQ=255) cATTAAAATGAGCTTAACCCCTGAAATGCTTTGTGGCAAATCGCGTGAACATTTAGTAAACCTGCCGATACCCCATTCACCCAATCATTTCTTACAGGCGCAGGCAGCGAAAGCCTTTCAAGGCTTACAAAAAAGTGCGGTAAAAAATGGCTTTAATTTACAGCCGGCGAGCAGTTTTCGTGATTTTGCACGTCAGCAGCTGATTTGGAATGGCAAATTTAACGCTGAACGTAAAGTGCATGATGACGCAg > 1:484588/1‑251 (MQ=255) aTTAAAATGAGCTTAACCCCTGAAATGCTTTGTGGCAAATCGCGTGAACATTTAGTAAACCTGCCGATACCCCATTCACCCAATCATTTCTTACAGGCGCAGGCAGCGAAAGCCTTTCAAGGCTTACAAAAAAGTGCGGTAAAAAATGGCTTTAATTTACAGCCGGCGAGCAGTTTTCGTGATTTTGCACGTCAGCAGCTGATTTGGAATGGCAAATTTAACGCTGAACGTAAAGTGc > 1:3270/1‑238 (MQ=255) aTTAAAATGAGCTTAACCCCTGAAATGCTTTGTGGCAAATCGCGTGAACATTTAGTAAACCTGCCGATACCCCATTCACCCAATCATTTCTTACAGGCGCAGGCAGCGAAAGCCTTTCAAGGCTTACAAAAAAGTGCGGTAAAAAATGGCTTTAATTTACAGCCGGCGAGCAGTTTTCGTGATTTTGCACGTCAGCAGCTGATTTGGAATGGCAAATTTAACGCTGAACGTAAAGTGCATGATGACGc < 1:253674/248‑1 (MQ=255) aTTAAAATGAGCTTAACCCCTGAAATGCTTTGTGGCAAATCGCGTGAACATTTAGTAAACCTGCCGATACCCCATTCACCCAATCATTTCTTACAGGCGCAGGCAGCGAAAGCCTTTCAAGGCTTACAAAAAAGTGCGGTAAAAAATGGCTTTAATTTACAGCCGGCGAGCAGTTTTCGTGATTTTGCACGTCAGCAGCTGATTTGGAATGGCAAATTTAACGCTGAACGTAAAGTGCATGATGACGCAgg > 1:716023/1‑251 (MQ=255) aTTAAAATGAGCTTAACCCCTGAAATGCTTTGTGGCAAATCGCGTGAACATTTAGTAAACCTGCCGATACCCCATTCACCCAATCATTTCTTACAGGCGCAGGCAGCGAAAGCCTTTCAAGGCTTACAAAAAAGTGCGGTAAAAAATGGCTTTAATTTACAGCCGGCGAACAGTTTTCGTGATTTTGCACGTCAGCAGCTGATTTGGAATGGCAAATTTAACGCTGAACGTAAAGTGCATGATGACGCAgg > 1:456056/1‑251 (MQ=255) | AAACTGGTGAGTGCGTTGGTGGACAGCCTGCAACAAATCGCAGGCATTACGCCGAAATTGGAAACCGGTGGTGGCACCTCAGACGGACGTTTTATTGCCCTCATGGGCGCGGAAGTGGTGGAATTCGGACCGCTTAACGCCACCATTCATAAAGTAAACGAGTGCGTGAGCGTGGAAGATCTTGGCAAATGCGGTCAGATTTACCATCAAATGTTAGTGAATTTATTGGAACATTAGAATGAGCTTAACCCCTGAAATGCTTTGTGGCAAATCGCGTGAACATTTAGTAAACCTGCCGATACCCCATTCACCCAATCATTTCTTACAGGCGCAGGCAGCGAAAGCCTTTCAAGGCTTACAAAAAAGTGCGGTAAAAAATGGCTTTAATTTACAGCCGGCGAGCAGTTTTCGTGATTTTGCACGTCAGCAGCTGATTTGGAATGGCAAATTTAACGCTGAACGTAAAGTGCATGATGACGCAGG > 1/898614‑899096 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |