| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 862,924 | G→C | intergenic (‑13267/‑59294) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 862,924 | 0 | G | C | 100.0% | 104.6 / NA | 39 | intergenic (‑13267/‑59294) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base C (26/13); total (26/13) | |||||||||||
CTTTGTCGATCCGTATCTGAGCGAGAAGTAAGAAAAATTCGGAATGCGT‑AAACTATTTCGGAAAATCAGGGTCAAACGGGCATTCTTGCTTCAGTCGCCATTTATATTAAAGCCATATCATATATAGTTACACGTAATTCGGACTTTTAAGGTTGCTGCAGCGAGGCAATGATTCATCTATTTTCAACCT‑AAGGAATATCATGTTAAAAAAATACTTACTTGTTTTACCGATTTCTATTTTAACCGCCTGCGCGGGTTATTATCCTTATCCGCAATTTGAGCCCAGTTATCC‑GTCCTTTTCCGTGCAGCATAATGACGATGAAGAACATGCCGTTTTCAGCATCCGCCGCACGCATGAACCGAAATATCAGGATCCAAGATACAAAATTTCCACGGAAGACATGGAAAAATTCATTTTAGCCAAAAATAACCTGGAATATTGTTTGTTACCGGAATTGGGCAAGCAATCGGATAAACGTGTTACCGCCCTTGAAA > 1/862671‑863165 | cttTGTCGATCCGTATCTGAGCGAGAAGTAAGAAAAAGTCGGAAAGTGTAAAACTATTTCGAAAAAACAGGGTCAAACGGGCTTTCTTGCTTCAGTTGCCAT‑‑‑TA‑‑AAAGC‑‑‑‑‑CATATATGGTTATACGTAATTCAGGCTTTTAAGGTTGCTGCAGCGGGACAATAATTAATCTATTTCCACCCTGAAGAAATATCATGTAAAAAAAATCCTTACTTATTTTACCGATTTCTATTTTAACCGCCTGTGCCGGtt < 1:189979/250‑1 (MQ=255) 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CTTTGTCGATCCGTATCTGAGCGAGAAGTAAGAAAAATTCGGAATGCGT‑AAACTATTTCGGAAAATCAGGGTCAAACGGGCATTCTTGCTTCAGTCGCCATTTATATTAAAGCCATATCATATATAGTTACACGTAATTCGGACTTTTAAGGTTGCTGCAGCGAGGCAATGATTCATCTATTTTCAACCT‑AAGGAATATCATGTTAAAAAAATACTTACTTGTTTTACCGATTTCTATTTTAACCGCCTGCGCGGGTTATTATCCTTATCCGCAATTTGAGCCCAGTTATCC‑GTCCTTTTCCGTGCAGCATAATGACGATGAAGAACATGCCGTTTTCAGCATCCGCCGCACGCATGAACCGAAATATCAGGATCCAAGATACAAAATTTCCACGGAAGACATGGAAAAATTCATTTTAGCCAAAAATAACCTGGAATATTGTTTGTTACCGGAATTGGGCAAGCAATCGGATAAACGTGTTACCGCCCTTGAAA > 1/862671‑863165 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |