| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 862,404 | T→C | intergenic (‑12747/‑59814) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 862,404 | 0 | T | C | 100.0% | 222.9 / NA | 77 | intergenic (‑12747/‑59814) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (45/32); total (45/32) | |||||||||||
GGGTGAAAATCATCCTGTATACTGCTGTAAACTCGTGCAAAATGCGGTCGGAAATGGCGATGAATTTAGGGGAGCAACATGGGTAAGATGATTATTGATTTACAAATCGCCTGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCAGCGCAAATTGAACAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGCGGGGAAGTTGAGATGACTGTACGCATTGTGGATGAGACGGAAAGCCACGCATTAAATCTTAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAGCTGCTGCTATTGGGCGATTTGGTGATTTGCCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAAGCCCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACTTGGTTATGATCATATTGAAGATGACGAAGCGGAGGAAATGGAA > 1/862159‑862638 | gggTGAAAATCATCCTATATATTGCTGGAACGTCGTGCAAAGTGCGGTTGGAAATGGCAATGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTa > 1:4973/1‑251 (MQ=255)gggTGAAAATCATCCTATATATTGCTGGAACGTCGTGCAAAGTGCGGTTGGAAATGGCAATGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTa > 1:458737/1‑251 (MQ=255) gTGAAAATCATCCTATATATTGCTGGAACGTCGTGCAAAGTGCGGTTGGAAATGGCAATGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTAt > 1:823374/1‑250 (MQ=255) atcCTATATATTGCTGGAACGTCGTGCAAAGTGCGGTTGGAAATGGCAATGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAg > 1:526905/1‑251 (MQ=255) cctatatattgctggaacgtCGTGCAAAGTGCGGTTGGAAATGGCAATGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAGAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGAt > 1:430183/20‑251 (MQ=255) atatattgctggaacgtCGTGCAAAGTGCGGTTGGAAATGGCAATGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTa > 1:231436/17‑235 (MQ=255) atatattgctggaacgtCGTGCAAAGTGCGGTTGGAAATGGCAATGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCg > 1:514291/17‑250 (MQ=255) atatattgctggaacgtCGTGCAAAGTGCGGTTGGAAATGGCAATGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCg > 1:210651/17‑250 (MQ=255) ttgctggaacgtCGTGCAAAGTGCGGTTGGAAATGGCAATGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCa > 1:583102/12‑250 (MQ=255) ctggaacgtCGTGCAAAGTGCGGTTGGAAATGGCAATGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTaa < 1:866114/243‑1 (MQ=255) gaacgtCGTGCAAAGTGCGGTTGGAAATGGCAATGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAAtg < 1:533243/245‑1 (MQ=255) gaacgtCGTGCAAAGTGCGGTTGGAAATGGCAATGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAAtg < 1:310007/245‑1 (MQ=255) gtCGTGCAAAGTGCGGTTGGAAATGGCAATGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCg > 1:549858/2‑223 (MQ=255) gtCGTGCAAAGTGCGGTTGGAAATGGCAATGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGAt > 1:896642/2‑233 (MQ=255) gtCGTGCAAAGTGCGGTTGGAAATGGCAATGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAAtg > 1:851079/2‑246 (MQ=255) gCAAAGTGCGGTTGGAAATGGCAATGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCttt > 1:897207/1‑251 (MQ=255) cGGTTGGAAATGGCAATGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTg < 1:164981/251‑1 (MQ=255) aTGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAg < 1:888932/251‑1 (MQ=255) aTGAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAg < 1:545251/251‑1 (MQ=255) gAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAAtg > 1:195714/1‑216 (MQ=255) gAATTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGt < 1:382044/250‑1 (MQ=255) aaTTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATCCCCTGATGAAGTgg > 1:770484/1‑251 (MQ=255) aTTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTg < 1:127274/249‑1 (MQ=255) aTTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGa > 1:462168/1‑251 (MQ=255) aTTTATGGGAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGa > 1:643511/1‑251 (MQ=255) tatgggAGCAACATGGGTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGaa > 1:764983/4‑248 (MQ=255) gggTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGc > 1:121083/1‑250 (MQ=255) gggTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCg > 1:282504/1‑251 (MQ=255) ggTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCtgatga > 1:80159/1‑227 (MQ=255) ggTAAAATGATTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGa > 1:2257/1‑251 (MQ=255) aaaatgatTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGAttt < 1:843914/248‑1 (MQ=255) gatTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTaa < 1:884109/186‑1 (MQ=255) gatTATTGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGa > 1:275563/1‑251 (MQ=255) attattGATTTACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGAt > 1:190239/1‑251 (MQ=255) tttACAAATCGCCAGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTgtcgtc < 1:546676/251‑1 (MQ=255) gATGAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAg < 1:166424/235‑1 (MQ=255) gAAAATGGCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGc > 1:279376/1‑180 (MQ=255) ggCTTGCCGACGGCGGAGCAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTccc < 1:673872/164‑1 (MQ=255) acggcggagcAAATTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAAcc < 1:395898/243‑1 (MQ=255) aaaTTGAGCAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTccc < 1:405567/145‑1 (MQ=255) gcAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTggg > 1:174269/2‑251 (MQ=255) aTGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGca > 1:797760/1‑250 (MQ=255) ggCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAg < 1:313794/202‑1 (MQ=255) cAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTACCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATCTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACAtg > 1:216902/1‑251 (MQ=255) gcggcAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACAtggtgg < 1:141467/250‑1 (MQ=255) cAGTGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTcaagagcaagag > 1:691261/1‑212 (MQ=255) tGCAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCAc < 1:876441/248‑1 (MQ=255) cAACCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGccc > 1:275061/1‑128 (MQ=255) aCCGCAAAGTGATGAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGtt > 1:67083/1‑251 (MQ=255) gtgatgAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTaa > 1:625758/6‑91 (MQ=255) gatgAAGTGGAAATGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACAt > 1:674036/4‑224 (MQ=255) aagtggaaaTGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTggg < 1:761752/205‑1 (MQ=255) gtggaaaTGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGACCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACTCGGTTa > 1:782267/7‑251 (MQ=255) gtggaaaTGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAACGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACtc > 1:576827/7‑245 (MQ=255) tggaaaTGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACAtggtgg < 1:147480/217‑1 (MQ=255) ggaaaTGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTcaagagcaagag < 1:384011/183‑1 (MQ=255) ggaaaTGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACAt < 1:863527/212‑1 (MQ=255) ggaaaTGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACTCGGTTATg > 1:769070/5‑251 (MQ=255) aaaTGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACTCGGTTATGAt > 1:141228/3‑251 (MQ=255) aaTGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACTCGGTTATGATc < 1:662514/250‑1 (MQ=255) aaTGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACTCGGTTATGATc < 1:318178/250‑1 (MQ=255) aaTGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACTCGGTTATGATc < 1:646851/250‑1 (MQ=255) tGACTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACTCGGTTATGATCat > 1:726057/1‑251 (MQ=255) aCTGTGCGCATTGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGtggtgg < 1:328432/157‑1 (MQ=255) ttGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTcaagag > 1:533413/1‑164 (MQ=255) ttGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACAtggtgg > 1:349286/1‑204 (MQ=255) ttGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACTCGGTTATGATCATATTGAAGATGa > 1:196969/1‑250 (MQ=255) ttGTGGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCACCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGtggtgg < 1:644194/147‑1 (MQ=255) gtgGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACTCGGTTATGATc > 1:760957/1‑235 (MQ=255) tgGACGAGATGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACTCGGTTATGATCATATTGAAGATGACGa < 1:440046/250‑1 (MQ=255) ggacgagaTGGAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACTCGGTTATGATCATATTGAAGATGACGAAg > 1:676804/5‑251 (MQ=255) gatggAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACtc < 1:778042/214‑2 (MQ=255) atggAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACAtggtgg < 1:298273/191‑1 (MQ=255) atggAAAGCCACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACTCGGTTATGATCATATTGAAGATGACGAAGCggagga > 1:894455/3‑251 (MQ=255) ccACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACTCGGTTATGATCATATTGAAGATGACGAAGCGGAGGAAATGGaa < 1:588389/250‑1 (MQ=255) ccACGCATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACTCGGTTATGATCATATTGAAGATGACGAAGCGGAGGAAATGGaa < 1:189549/250‑1 (MQ=255) cATTAAATCTCAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAACTGCCGTTATTGGGCGATTTGGTGATTTGTCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAGGCTCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACTCGGTTATGATc > 1:365236/1‑213 (MQ=255) | GGGTGAAAATCATCCTGTATACTGCTGTAAACTCGTGCAAAATGCGGTCGGAAATGGCGATGAATTTAGGGGAGCAACATGGGTAAGATGATTATTGATTTACAAATCGCCTGCGCAGATGAAAATGGCTTGCCGACGGCAGCGCAAATTGAACAATGGGCAACGGCGGCAGTGCAACCGCAAAGCGGGGAAGTTGAGATGACTGTACGCATTGTGGATGAGACGGAAAGCCACGCATTAAATCTTAATTATCGTGGCAAAGATCGCCCCACTAATGTGCTGTCTTTCCCTTTTGAATGCCCTGATGAAGTGGAGCTGCTGCTATTGGGCGATTTGGTGATTTGCCGTCAAGTGGTGGAGCGCGAAGCCCAAGAGCAAGAGAAACCGCTCATGGCGCATTGGGCACACATGGTGGTGCACGGCAGTTTGCATTTACTTGGTTATGATCATATTGAAGATGACGAAGCGGAGGAAATGGAA > 1/862159‑862638 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |