| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 860,389 | T→C | intergenic (‑10732/‑61829) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 860,389 | 0 | T | C | 100.0% | 152.8 / NA | 54 | intergenic (‑10732/‑61829) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (23/31); total (23/31) | |||||||||||
AGCCTTGTAATCCCTGAATACCATTTTTAGTCGTAGCCTCTCTTAGGTCATTGTCGACTAGTGCACTGTCTTCAGGGACAGAAATCTCATTTAAAATATAATCATCTGCCTGTAATAAATGACCTTTGCTTACGTCATTCTTTAACTCGGCAGTTAAAATTAGCTTTTCCGGTTTTTTCTCAGCTTCCGGAACCTGCTGATTATTTATTATTGTTTGTTGATTTTCAGTATTGTCAAATGTTGGCATAAACATAATGCCACCAATGCCAACCGCTAGCGTAAGCACTGAAATGATCAAGAGCGTTCTGTAATTCATTTTTTACCCTTAATTAAATTTTAACAAAGTAAAGTCTCCGCTCAATCAAAATTAATTTGATAGAGCCATGTTTATCATAAAGCCAAGGCTTATTGCTACGCCATAAGGCAATCCGTTTTCTTTAATTGATTCACGGAAAAATAACCAACCGATAATAATTAGTCCCA > 1/860149‑860631 | cttgtaatccctgaataccatttttagtcgtagcctctcttaggtcattgtcgaccagtgcactgtcttcagggacagaaatctcatttaaaatgtaatcatctgcctgtaataaatgacctttgctcacgtcattctttaattcggcagttaaaattagcttttccggctttttctcagtttccggaaccgactgattatttaTTATTATTGTTTGTTGATTTTCAGTATTGTCAAATGCTGGCATAAAc < 1:150762‑M2/47‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |