| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 860,294 | C→T | intergenic (‑10637/‑61924) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 860,294 | 0 | C | T | 100.0% | 161.8 / NA | 58 | intergenic (‑10637/‑61924) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (24/34); total (24/34) | |||||||||||
TTCGGATCTAGGCTGGATGTAAAGAATCTAGGATCGTTCGGAGAGATAATAGATTTGTTGGATAGAAAAGAACCAGCTCTGACATTTTCTGCCATTAAATAGCCTTGTAATCCCTGAATACCATTTTTAGTCGTAGCCTCTCTTAGGTCATTGTCGACTAGTGCACTGTCTTCAGGGACAGAAATCTCATTTAAAATATAATCATCTGCCTGTAATAAATGACCTTTGCTTACGTCATTCTTTAACTCGGCAGTTAAAATTAGCTTTTCCGGTTTTTTCTCAGCTTCCGGAACCTGCTGATTATTTATTATTGTTTGTTGATTTTCAGTATTGTCAAATGTTGGCATAAACATAATGCCACCAATGCCAACCGCTAGCGTAAGCACTGAAATGATCAAGAGCGTTCTGTAATTCATTTTTTACCCTTAATTAAATTTTAACAAAGTAAAGTCTCCGCTCAATCAAAATTAATTTGATAGAGCCATGTTTA > 1/860049‑860538 | cttggattcaagCTGGAAGTAAAGAATCTAGGATCATTCGGAGAGATAATAGATTTGTTGGATAGAAAAGAACCAGCTCTGACATTTTCTGCCATTAAATAGCCTTGTAATCCCTGAATACCATTTTTAGTCGTAGCCCCTCTTAGGTCATTGTCGACCAGTGCACTGTCTTCAGGGACAGAAATCTCATTTAAAATGTAATCATCTGCCTGTAATAAATGACCTTTGCTCACGTCATTCTTTAATTCGGc < 1:814100/240‑1 (MQ=255) 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1:504269‑M1/210‑13 (MQ=255) aTCCCTGAATACCATTTTTAGTCGTAGCCTCTCTTAGGTCATTGTCGACCAGTGCACTGTCTTCAGGGACAGAAATCTCATTTAAAATGTAATCATCTGCCTGTAATAAATGACCTTTGCTCACGTCATTCTTTAATTCGGCAGTTAAAATTAGCTTTTCCGGCTTTTTCTCAGTTTCCGGAACCGACTGATTATttattattattgtttgttgattttcagtattgtcaaatgctggcataaacataatg < 1:481173‑M1/251‑57 (MQ=255) ccTGAATACCATTTTTAGTCGTAGCCTCTCTTAGGTCATTGTCGACCAGTGCACTGTCTTCAGGGACAGAAATCTCATTTAAAATGTAATCATCTGCCTGTAATAAATGACCTTTGCTCACGTCATTCTTTAATTCGGCAGTTAAAATTAGCTTTTCCGGCTTTTTCTCAGTTTCCGGAACCGACTGATTATttattattattgtttgttgattttcag < 1:37633‑M1/219‑28 (MQ=255) ttttAGTCGTAGCCTCTCTTAGGTCATTGTCGACCAGTGCACTGTCTTCAGGGACAGAAATCTCATTTAAAATGTAATCATCTGCCTGTAATAAATGACCTTTGCTCACGTCATTCTTTAATTCGGCAGTTAAAATTAGCTTTTCCGGCTTTTTCTCAGTTTCCGGAACCGACTGATTATttattattattgtttgttgattttcagtattgtcaaatgctggcataaacataatgccaccaatgccaacc < 1:235054‑M1/251‑72 (MQ=255) 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1:750939‑M1/251‑173 (MQ=255) ttGCTCACGTCATTCTTTAATTCGGCAGTTAAAATTAGCTTTTCCGGCTTTTTCTCAGTTTCCGGAACCGACTGATTATttattattattgtttgttgattttcagtattgtcaaatgctggcataaacataatgccaccaatgccaaccgctagcgtaagcactgaaa > 1:460218‑M1/1‑79 (MQ=255) tCATTCTTTAATTCGGCAGTTAAAATTAGCTTTTCCGGCTTTTTCTCAGTTTCCGGAACCGACTGATTATttattattattgtttgttgattttcagtattgtcaaatgctggcataaacataatgccaccaatgccaaccgctagcgtaagcactgaaatgatcaagagcgttctgtaattcattttttacccttaattaaattttaacaaagtaaagtttccgctcaatcaaaattaatttgatagagc < 1:146274‑M1/251‑182 (MQ=255) aTTCTTTAATTCGGCAGTTAAAATTAGCTTTTCCGGCTTTTTCTCAGTTTCCGGAACCGACTGATTATttattattattgtttgttgattttcagtattgtcaaatgctggcataaacataatgccaccaatgccaaccgctagcgtaagcactgaaatgatcaagagcgttctgtaat > 1:378179‑M1/1‑68 (MQ=255) cTTTAATTCGGCAGTTAAAATTAGCTTTTCCGGCTTTTTCTCAGTTTCCGGAACCGACTGATTATttattattattgtttgttgattttcagtattgtcaaatgctggcataaacataatgccaccaatgccaaccgctagcgtaagcactgaaatgatcaagagcgttctgtaattcattttttacccttaattaaattttaacaaagtaaagtttccgctcaatcaaaattaatttgatagagccatgt < 1:369374‑M1/251‑187 (MQ=255) cTTTAATTCGGCAGTTAAAATTAGCTTTTCCGGCTTTTTCTCAGTTTCCGGAACCGACTGATTATttattattattgtttgttgattttcagtattgtcaaatgctggcataaacataatgccaccaatgccaaccgctagcgtaagc > 1:380861‑M1/1‑65 (MQ=255) | TTCGGATCTAGGCTGGATGTAAAGAATCTAGGATCGTTCGGAGAGATAATAGATTTGTTGGATAGAAAAGAACCAGCTCTGACATTTTCTGCCATTAAATAGCCTTGTAATCCCTGAATACCATTTTTAGTCGTAGCCTCTCTTAGGTCATTGTCGACTAGTGCACTGTCTTCAGGGACAGAAATCTCATTTAAAATATAATCATCTGCCTGTAATAAATGACCTTTGCTTACGTCATTCTTTAACTCGGCAGTTAAAATTAGCTTTTCCGGTTTTTTCTCAGCTTCCGGAACCTGCTGATTATTTATTATTGTTTGTTGATTTTCAGTATTGTCAAATGTTGGCATAAACATAATGCCACCAATGCCAACCGCTAGCGTAAGCACTGAAATGATCAAGAGCGTTCTGTAATTCATTTTTTACCCTTAATTAAATTTTAACAAAGTAAAGTCTCCGCTCAATCAAAATTAATTTGATAGAGCCATGTTTA > 1/860049‑860538 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |