| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 858,115 | C→T | intergenic (‑8458/‑64103) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 858,115 | 0 | C | T | 100.0% | 132.7 / NA | 50 | intergenic (‑8458/‑64103) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (22/28); total (22/28) | |||||||||||
TTCAATATAGATTGGATATGTTTTTGCTTTATGTGCTTTTTTCTCTAAGTAAATAGATTTAGAGGTAATACCATTTTTAATCAATTTTGTACGAATTTTCATTGCGGCTTTCTTTGCCGTAGCATCACGCCAAATTATATTGATTTGCTTTTGGTTGTTACTACCTATATCACGAATAACGGAATTAAATAAATTACTATAACTGACATTAGAGTAATCCGGTAATACATAACGATCGACTAACTGTGTACGATTAAATTCACTATTTTGTACCGGTTGTGCAACAGTCGTATCGTTAACAAATTCACTGATTGCAAATGTTGTTACCGGGGCGGTAATTGAGGCCAATGCAATGGAGGCCGTGATAACTAATTTTCTCATTGTATGAACCCACTATTTTTTAAGAAGTTAGATGTTAATGTTTTGTAATAAACATTCTTTAACGGAGTCGTATGGAAGAATCTTTCCATTGTTCCGGTTTT > 1/857879‑858360 | ttCAATATAGATTGGATATATTTTTGCTTTATGTGCTTTTTTCTCTAAGTAAATGGATTTAGAGGCGATACCATTTTTAATCAATTTTGTACGAATTTCCATTGCGGCTTTCTTTGCCGTAGCATCACGCCAAATGATATTGATTTGTTTTTGGTTGTTACTACCTATATCACGAATGACAGAATTGAATAAATTACTATAACTGACATTAGAATAATCCGGTAATACATAACGATTGACTAACTGTGTAc < 1:530630/251‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) tAACGATTGACTAACTGTGTACGATTAAATTCACTATTTTGTACCGGTTGTGCAACAGTCGTATCGTCAACAAATTCATTGATTGCAAATGTTTTTGCCGGAACGATAATTGAGACCAATGCAATGGAGGCCGTAATAACTAATTTTCTCATTGTATGAACCCACTATTCTTTAAGAAGTTAGATGTTAATGTCTTGTAATAAACATTCTTTAACGGAGTCGTATGGAAGAATCTTTCCATTGTTCCGGtt < 1:676821/251‑1 (MQ=255) aCGATTGACTAACTGTGTACGATTAAATTCACTATTTTGTACCGGTTGTGCAACAGTCGTATCGTCAACAAATTCATTGATTGCAAATGTTTTTGCCGGAACGATAATTGAGGCCAATGCAATGGAGGCCGTAATAACTAATTTTCTCATTGTATGAACCCACTATTCTTTAAGAAGTTAGATGTTAATGTCTTGTAATAAACATTCTTTAACGGAGTCGTATGGAAGAATCTTTCCATTGTTCCGGtttt > 1:480649/1‑251 (MQ=255) cGATTGACTAACTGTGTACGATTAAATTCACTATTTTGTACCGGTTGTGCAACAGTCGTATCGTCAACAAATTCATTGATTGCAAATGTTTTTGCCGGAACGATAATTGAGGCCAATGCAATGGAGGCCGTAATAACTAATTTTCTCATTGTATGAACCCACTATTCTTTAAGAAGTTAGATGTTAATGTCTTGTAATAAACATTCTTTAACGGAGTCGTATGGAAGAATCTTTCCATTGTTCCGGtt < 1:424317/248‑1 (MQ=255) | TTCAATATAGATTGGATATGTTTTTGCTTTATGTGCTTTTTTCTCTAAGTAAATAGATTTAGAGGTAATACCATTTTTAATCAATTTTGTACGAATTTTCATTGCGGCTTTCTTTGCCGTAGCATCACGCCAAATTATATTGATTTGCTTTTGGTTGTTACTACCTATATCACGAATAACGGAATTAAATAAATTACTATAACTGACATTAGAGTAATCCGGTAATACATAACGATCGACTAACTGTGTACGATTAAATTCACTATTTTGTACCGGTTGTGCAACAGTCGTATCGTTAACAAATTCACTGATTGCAAATGTTGTTACCGGGGCGGTAATTGAGGCCAATGCAATGGAGGCCGTGATAACTAATTTTCTCATTGTATGAACCCACTATTTTTTAAGAAGTTAGATGTTAATGTTTTGTAATAAACATTCTTTAACGGAGTCGTATGGAAGAATCTTTCCATTGTTCCGGTTTT > 1/857879‑858360 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |