| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 858,092 | G→A | intergenic (‑8435/‑64126) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 858,092 | 0 | G | A | 100.0% | 83.7 / NA | 33 | intergenic (‑8435/‑64126) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (14/19); total (14/19) | |||||||||||
TTCAATATAGATTGGATATGTTTTTGCTTTATGTGCTTTTTTCTCTAAGTAAATAGATTTAGAGGTAATACCATTTTTAATCAATTTTGTACGAATTTTCATTGCGGCTTTCTTTGCCGTAGCATCACGCCAAATTATATTGATTTGCTTTTGGTTGTTACTACCTATATCACGAATAACGGAATTAAATAAATTACTATAACTGACATTAGAGTAATCCGGTAATACATAACGATCGACTAACTGTGTACGATTAAATTCACTATTTTGTACCGGTTGTGCAACAGTCGTATCGTTAACAAATTCACTGATTGCAAATGTTGTTACCGGGGCGGTAATTGAGGCCAATGCAATGGAGGCCGTGATAACTAATTTTCTCATTGTATGAACCCACTATTTTTTAAGAAGTTAGATGTTAATGTTTTGTAATAAACATTCTTTAACGGAGTCGTATGGA > 1/857879‑858335 | ttCAATATAGATTGGATATATTTTTGCTTTATGTGCTTTTTTCTCTAAGTAAATGGATTTAGAGGCGATACCATTTTTAATCAATTTTGTACGAATTTCCATTGCGGCTTTCTTTGCCGTAGCATCACGCCAAATGATATTGATTTGTTTTTGGTTGTTACTACCTATATCACGAATGACAGAATTGAATAAATTACTATAACTGACATTAGAATAATCCGGTAATACATAACGATTGACTAACTGTGTAc < 1:530630/251‑1 (MQ=255) tCAATATAGATTGGATATATTTTTGCTTTATGTGCTTTTTTCTCTAAGTAAATGGATTTAGAGGCGATACCATTTTTAATCAATTTTGTACGAATTTCCATTGCGGCTTTCTTTGCCGTAGCATCACGCCAAATGATATTGATTTGTTTTTGGTTGTTACTACCTATATCACGAATGACAGAATTGAATAAATTACTATAACTGACATTAGAATAATCCGGTaa > 1:332138/1‑224 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TTCAATATAGATTGGATATGTTTTTGCTTTATGTGCTTTTTTCTCTAAGTAAATAGATTTAGAGGTAATACCATTTTTAATCAATTTTGTACGAATTTTCATTGCGGCTTTCTTTGCCGTAGCATCACGCCAAATTATATTGATTTGCTTTTGGTTGTTACTACCTATATCACGAATAACGGAATTAAATAAATTACTATAACTGACATTAGAGTAATCCGGTAATACATAACGATCGACTAACTGTGTACGATTAAATTCACTATTTTGTACCGGTTGTGCAACAGTCGTATCGTTAACAAATTCACTGATTGCAAATGTTGTTACCGGGGCGGTAATTGAGGCCAATGCAATGGAGGCCGTGATAACTAATTTTCTCATTGTATGAACCCACTATTTTTTAAGAAGTTAGATGTTAATGTTTTGTAATAAACATTCTTTAACGGAGTCGTATGGA > 1/857879‑858335 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |