| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 858,059 | G→A | intergenic (‑8402/‑64159) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 858,059 | 0 | G | A | 100.0% | 99.9 / NA | 38 | intergenic (‑8402/‑64159) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (17/21); total (17/21) | |||||||||||
ACTACTTCTCCGGTACGATATGCACAAGGTGCCGGTTTGGGCGCAATTTGAGCTACTTCAATATAGATTGGATATGTTTTTGCTTTATGTGCTTTTTTCTCTAAGTAAATAGATTTAGAGGTAATACCATTTTTAATCAATTTTGTACGAATTTTCATTGCGGCTTTCTTTGCCGTAGCATCACGCCAAATTATATTGATTTGCTTTTGGTTGTTACTACCTATATCACGAATAACGGAATTAAATAAATTACTATAACTGACATTAGAGTAATCCGGTAATACATAACGATCGACTAACTGTGTACGATTAAATTCACTATTTTGTACCGGTTGTGCAACAGTCGTATCGTTAACAAATTCACTGATTGCAAATGTTGTTACCGGGGCGGTAATTGAGGCCAATGCAATGGAGGCCGTGATAACTAATTTTCTCATTGTATGAACCCACTATTTTTTAAGAAG > 1/857823‑858286 | actactTCTCCGGTACGATATGCACAAGGCGCCGGTCTCTGCGCAATTTGAGCTACTTCAATATAGATTGGATATATTTTTGCTTTATGTGCTTTTTTCTCTAAGTAAATGGATTTAGAGGCGATACCATTTTTAATCAATTTTGTACGAATTTCCATTGCGGCTTTCTTTGCCGTAGCATCACGCCAAATGATATTGATTTGTTTTTGGTTGTTACTACCTATATCACGAATGACAGAATTGAATAAAtt < 1:696406/251‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gTAAATGGATTTAGAGGCGATACCATTTTTAATCAATTTTGTACGAATTTCCATTGCGGCTTTCTTTGCCGTAGCATCACGCCAAATGATATTGATTTGTTTTTGGTTGTTACTACCTATATCACGAATGACAGAATTGAATAAATTACTATAACTGACATTAGAATAATCCGGTAATACATAACGATTGACTAACTGTGTACGATTAAATTCACTATTTTGTACCGGTTGTGCAACAGTCGTATCg > 1:90780/1‑247 (MQ=255) aTTTAGAGGCGATACCATTTTTAATCAATTTTGTACGAATTTCCATTGCGGCTTTCTTTGCCGTAGCATCACGCCAAATGATATTGATTTGTTTTTGGTTGTTACTACCTATATCACGAATGACAGAATTGAATAAATTACTATAACTGACATTAGAATAATCCGGTAATACATAACGATTGACTAACtg > 1:868739/1‑190 (MQ=255) aTTTAGAGGCGATACCATTTTTAATCAATTTTGTACGAATTTCCATTGCGGCTTTCTTTGCCGTAGCATCACGCCAAATGATATTGATTTGTTTTTGGTTGTTACTACCTATATCACGAATGACAGAATTGAATAAATTACTATAACTGACATTAGAATAATCCGGTAATACATAACGATTGACTAACTGTGTACGATTAAATTCACTATTTTGTACCGGTTGTGCAACAGTCGTATCGTCAACAAATTCa > 1:467484/1‑251 (MQ=255) cGAATTTCCATTGCGGCTTTCTTTGCCGTAGCATCACGCCAAATGATATTGATTTGTTTTTGGTTGTTACTACCTATATCACGAATGACAGAATTGAATAAATTACTATAACTGACATTAGAATAATCCGGTAATACATAACGATTGACTAAc > 1:486569/1‑153 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |