| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 145,752 | C→A | intergenic (+12441/+116479) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 145,752 | 0 | C | A | 100.0% | 239.7 / NA | 89 | intergenic (+12441/+116479) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (40/49); total (40/49) | |||||||||||
CGCCACAGGTGCTGGAAAGTAAAATCGGCAAAGATAAATTCATCGAACAAATCGCCGTCATCGCCGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAACAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTCATCATAAAAGTGCGGTGGAAAAATAATGTGTTTTTTCACCGCACTTTTTATATTAATTTCTCTTTATTATTCGTCTTTCAAG > 1/145510‑145972 | cgcCACAGGTGCTGGAAAGTAAAATCGGCAAAGATAAATTCATCGAACAAATCGCCGTCATCGCCGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTaaa > 1:98172/1‑251 (MQ=255) ccACAGGTGCTGGAAAGTAAAATCGGCAAAGATAAATTCATCGAACAAATCGCCGTCATCGCCGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAAc < 1:599593/250‑1 (MQ=255) ccACAGGTGCTGGAAAGTAAAATCGGCAAAGATAAATTCATCGAACAAATCGCCGTCATCGCCGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAAc < 1:343797/250‑1 (MQ=255) ccACAGGTGCTGGAAAGTAAAATCGGCAAAGATAAATTCATCGAACAAATCGCCGTCATCGCCGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACg > 1:214181/1‑251 (MQ=255) tAAAATCGGCAAAGATAAATTCATCGAACAAATCGCCGTCATCGCCGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGccc < 1:463266/250‑1 (MQ=255) tAAAATCGGCAAAGATAAATTCATCGAACAAATCGCCGTCATCGCCGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGcc < 1:781407/249‑1 (MQ=255) aaGATAAATTCATCGAACAAATCGCCGTCATCGCCGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGc < 1:205520/251‑1 (MQ=255) aGATAAATTCATCGAACAAATCGCCGTCATCGCCGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGc > 1:121641/1‑250 (MQ=255) gATAAATTCATCGAACAAATCGCCGTCATCGCCGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAg > 1:387142/1‑248 (MQ=255) gATAAATTCATCGAACAAATCGCCGTCATCGCCGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAg < 1:149917/248‑1 (MQ=255) cGAACAAATCGCCGTCATCGCCGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGgaag < 1:873602/251‑1 (MQ=255) cGAACAAATCGCCGTCATCGCCGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGgaag < 1:227974/251‑1 (MQ=255) cGAACAAATCGCCGTCATCGCCGACGCGAAAAAACACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGgaag < 1:243691/251‑1 (MQ=255) aaaTCGCCGTCATCGCCGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATc < 1:817008/251‑1 (MQ=255) aaaTCGCCGTCATCGCCGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATc < 1:786628/251‑1 (MQ=255) ccGTCATCGCCGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCGTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACAcc < 1:161087/250‑1 (MQ=255) cGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAAt < 1:66586/251‑1 (MQ=255) aaaaaaTACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTacgacg > 1:528942/1‑251 (MQ=255) aaaTACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGaaa > 1:465452/1‑251 (MQ=255) aTACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTACAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAg < 1:12480/251‑1 (MQ=255) tctcCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGAtt > 1:180752/1‑251 (MQ=255) ctcCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGAttt < 1:536169/251‑1 (MQ=255) cGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTAc < 1:657090/251‑1 (MQ=255) gCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGgaaga > 1:473609/1‑209 (MQ=255) cccTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAGACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGaa < 1:195943/226‑1 (MQ=255) cccTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAg > 1:808290/1‑251 (MQ=255) ccTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGc < 1:269503/251‑1 (MQ=255) ttATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGt > 1:804337/1‑251 (MQ=255) tGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATaa < 1:385702/250‑1 (MQ=255) ccTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAag < 1:730541/250‑1 (MQ=255) ttGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCacac > 1:797575/1‑203 (MQ=255) tGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAagag > 1:215034/1‑249 (MQ=255) gCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATGACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAagag > 1:883279/1‑248 (MQ=255) tATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGAt < 1:239650/251‑1 (MQ=255) aTGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGAtt > 1:290313/1‑251 (MQ=255) gCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGa > 1:366034/1‑251 (MQ=255) gCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGa > 1:192582/1‑251 (MQ=255) tCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAGTTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGc < 1:596571/251‑1 (MQ=255) cTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATaa > 1:314110/1‑233 (MQ=255) aTTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAAc < 1:499372/251‑1 (MQ=255) aTGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTTGGAAAAAATTAAACGTCTCACCCTTTTGCCCCAAGc > 1:431249/1‑151 (MQ=255) aTGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTAc < 1:729923/213‑1 (MQ=255) aTGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGta > 1:723099/1‑244 (MQ=255) ccAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAAt < 1:121333/250‑1 (MQ=255) aaGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGa > 1:748601/1‑178 (MQ=255) aaGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATaa < 1:162192/218‑1 (MQ=255) cAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCacac < 1:80042/172‑1 (MQ=255) ggTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGc < 1:562149/141‑1 (MQ=255) ggTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTAc < 1:511845/203‑1 (MQ=255) aCATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTg < 1:524241/173‑1 (MQ=255) aCATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAag > 1:541024/1‑210 (MQ=255) cATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGa > 1:469083/1‑219 (MQ=255) aTCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTCATCATAAAAg < 1:461893/251‑1 (MQ=255) aTCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTCATCATAAAAg < 1:457263/251‑1 (MQ=255) aTCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTCATCATAAAAg < 1:885876/251‑1 (MQ=255) tCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAag > 1:21223/1‑207 (MQ=255) tCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTCATCATAAAAg < 1:327180/250‑1 (MQ=255) aaTATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATaa < 1:789963/202‑1 (MQ=255) tatCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAAt < 1:656307/101‑1 (MQ=255) tatCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAAc < 1:196870/106‑1 (MQ=255) tatCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGaaa > 1:276203/1‑168 (MQ=255) tatCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATaa < 1:897989/200‑1 (MQ=255) tatCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGc < 1:42659/215‑1 (MQ=255) tatCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGtat < 1:680287/222‑1 (MQ=255) tatCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAAc < 1:217693/225‑1 (MQ=255) tatCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAAc > 1:402436/1‑225 (MQ=255) tatCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTa > 1:632289/1‑227 (MQ=255) tatCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTCATCATAAAAGTGCGGt > 1:874850/1‑251 (MQ=255) tCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTCATCATAAAAGTGCGGTGGAAAaat < 1:581544/251‑1 (MQ=255) cGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTa > 1:283186/1‑218 (MQ=255) gTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCacac > 1:336881/1‑147 (MQ=255) gTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTa < 1:119374/217‑1 (MQ=255) ttGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAag > 1:240399/1‑190 (MQ=255) ttGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTCATCATAAAAGTGCGGTGGAAAAATAAtg < 1:888973/251‑1 (MQ=255) gTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAag < 1:820188/182‑1 (MQ=255) gTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAAt > 1:497004/1‑210 (MQ=255) gTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTCATCATAAAAGTGCGGTGGAAAAATAAtg > 1:735028/1‑243 (MQ=255) aTTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGAt > 1:461882/1‑205 (MQ=255) aTTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTCATCATAAAAGTGCGGTGGAAAaataa > 1:429301/1‑233 (MQ=255) attCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGc < 1:802672/166‑1 (MQ=255) attCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGtat > 1:36204/1‑183 (MQ=255) attCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTcatcat < 1:786218/201‑1 (MQ=255) tGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGgaag > 1:16775/1‑102 (MQ=255) tGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTCATCATAAAAg < 1:694493/199‑1 (MQ=255) tGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTCATCATAAAAGTGCGGTGGAAAAATAATGTGTTTTTTCACCGCACTTTTTATATTAATTtct > 1:871968/1‑250 (MQ=255) tGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTCATCATAAAAGTGCGGTGGAAAAATAATGTGTTTTTTCACCGCACTTTTTATATTAATTtct > 1:868288/1‑250 (MQ=255) tGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTCATCATAAAAGTGCGGTGGAAAAATAATGTGTTTTTTCACCGCACTTTTTATATTAATTtct > 1:263194/1‑250 (MQ=255) aaTGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTCATCATAAAAGTGCGGTGGAAAAATAATGTGTTTTTTc > 1:659823/1‑209 (MQ=255) aaTTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAAAAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTCATCATAAAAGTGCGGTGGAAAAATAATGTGTTTTTTCACCGCACTTTTTATATTAATTTCTCTTTATTATTCGTCTTTCAAg < 1:144288/250‑1 (MQ=255) | CGCCACAGGTGCTGGAAAGTAAAATCGGCAAAGATAAATTCATCGAACAAATCGCCGTCATCGCCGACGCGAAAAAATACGTCTCCGCCCTTATCGTGCCTTGCTATGCGTCACTGGAAGATTATGCCAAGCAGGTCAACATCAAATATCAGGATCGTTTGGAATTGTTAAGAAATTCGGAGATTATTCAAATGTTAGAACGCCGAATTAATGAATTGCAAAAAGAATTGGCGGGCTGGGAACAAATTAAACGTTTCACCCTTTTGCCCCAAGCCTTCAGCACACAATTGGAAGAAATCACACCGACGTTGAAATTACGACGAAAAGTGATTTTACAGCGTTATAAAGAGCTGATTGAGGCGATGTATAACTAAATGATTCATCATAAAAGTGCGGTGGAAAAATAATGTGTTTTTTCACCGCACTTTTTATATTAATTTCTCTTTATTATTCGTCTTTCAAG > 1/145510‑145972 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |