| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 857,681 | C→T | intergenic (‑8024/‑64537) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 857,681 | 0 | C | T | 100.0% | 163.1 / NA | 60 | intergenic (‑8024/‑64537) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (24/36); total (24/36) | |||||||||||
TATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTATACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATGTTAGTCTCATGTGTGATATCAATAATAACCCCTACAGTGTCTTCTGCTGAAAATGAAATTTCATCAGATGAGGTGAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAATTTGTGCAACTTCACCTTGGATATCATCACGGCTTGACACTATAGTAATAGTGCGAGCACTGTCTGCCGTGATTGTTTCTTGATCTAGTAATAACATAAAAAATACCTTCTATTAATACTTCAATTGAACACGCTGATTACTTTTAAGTGCACAAGAAGTCTCATTAGAATTCCAAAAAACTACTTCTCCGGTACGATATGCACAAGGTGCCGGTTTGGGCGCAATTTGAGCTACTTCAATATAGATTGGATATGTTTT > 1/857446‑857902 | tATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAGTTTGTGCAACTTCACCTTGAATATCATCACGGCTTGATACTACAGTAATAGta < 1:791165/251‑2 (MQ=255) aTCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAGTTTGTGCAACTTCACCTTGAATATCATCACGGCTTGATACTACAGTAATAg > 1:820219/1‑248 (MQ=255) aTCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAGTTTGTGCAACTTCACCTTGAATATCATCACGGCTTGATACTACAGTAATAGta < 1:560341/250‑2 (MQ=255) aTAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAGTTTGTGCAACTTCACCTTGAATATCATCACGGCTTGATACTACAGTAATAg < 1:728572/241‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |