| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 857,485 | T→C | intergenic (‑7828/‑64733) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 857,485 | 0 | T | C | 100.0% | 224.6 / NA | 78 | intergenic (‑7828/‑64733) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (37/41); total (37/41) | |||||||||||
ACACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCACCTTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAGCGAGGGATATCAGCACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAACTGAGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATGCCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATGGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTATACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATGTTAGTCTCATGTGTGATATCAATAATAACCCCTACAGTGTCTTCTGCTGAAAATGAAATTTCATCAGATGAGGTGAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAATTTGTGCAACTTCACCTTGGATATCATCACGGCTTGACACTATAGTAATAGTGCGAGCACTGTCTGCCGTGATTGTTTCTTGA > 1/857239‑857726 | atacaATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGtactacacta > 1:870742/3‑251 (MQ=255) atatGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAAt < 1:729575/251‑1 (MQ=255) aaTTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTAtat > 1:589530/1‑249 (MQ=255) aTTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTAtatt < 1:634745/251‑4 (MQ=255) tAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAg < 1:230379/251‑1 (MQ=255) aCTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGttt < 1:170454/251‑3 (MQ=255) ttGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCa < 1:606354/251‑1 (MQ=255) cgcCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCAtg < 1:307409/250‑1 (MQ=255) aTACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTAta < 1:582757/234‑2 (MQ=255) ccgcccttACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACt < 1:645203/204‑1 (MQ=255) aCTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCttt < 1:552469/217‑1 (MQ=255) aCTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAACTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTc > 1:631815/1‑200 (MQ=255) aTTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACTCCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGTCAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTAtcttc < 1:272846/251‑1 (MQ=255) aTTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTAtcttc < 1:293829/251‑1 (MQ=255) aTTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTAtct > 1:569257/1‑249 (MQ=255) aTTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGATACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCaataat > 1:456535/1‑233 (MQ=255) ttttAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTaaaaa < 1:334762/183‑1 (MQ=255) ttttAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTAtctt > 1:494435/1‑249 (MQ=255) gTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCttt < 1:19207/195‑1 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACt > 1:824016/1‑173 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGttt < 1:770961/201‑3 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGttt > 1:778527/1‑199 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGatat < 1:103839/213‑1 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATc < 1:586589/214‑1 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGaa > 1:497566/1‑251 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGaa > 1:809055/1‑251 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGaa > 1:368818/1‑251 (MQ=255) ctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAgtat < 1:484173/232‑3 (MQ=255) aggtatatCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACTCAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAg > 1:232166/5‑251 (MQ=255) aggtatatCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCAtg > 1:807484/5‑195 (MQ=255) gtatatCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGt > 1:641805/3‑187 (MQ=255) gtatatCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAgt < 1:654308/218‑1 (MQ=255) gtatatCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGa > 1:223233/3‑250 (MQ=255) gtatatCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGa > 1:642527/3‑250 (MQ=255) gtatatCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGa > 1:894702/3‑250 (MQ=255) tatatCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGacg < 1:294837/250‑3 (MQ=255) aaaaTGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGata < 1:295976/186‑1 (MQ=255) aTGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAg > 1:648091/1‑202 (MQ=255) tctcAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAAc > 1:331546/1‑250 (MQ=255) cAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAAtc < 1:81503/251‑1 (MQ=255) aCTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATAtttt > 1:498609/1‑251 (MQ=255) taattgggTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGatat > 1:271883/8‑161 (MQ=255) aattgggTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAg < 1:305685/245‑1 (MQ=255) gTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGatat > 1:878003/1‑154 (MQ=255) tGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGt < 1:834043/251‑1 (MQ=255) aaTTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACt > 1:306363/1‑107 (MQ=255) ttAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAg < 1:547299/251‑1 (MQ=255) aagtaaagGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAAtccc < 1:310216/155‑1 (MQ=255) aagtaaagGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGagt > 1:42275/1‑249 (MQ=255) aagtaaagGATACCCTCATCTAGTAG‑TTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGa > 1:773383/1‑138 (MQ=255) gtaaagGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCttt < 1:360554/118‑1 (MQ=255) aagGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACGCAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAGTTtgtg < 1:619879/251‑1 (MQ=255) ggATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCaat > 1:659086/1‑139 (MQ=255) cATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGagtt > 1:594277/1‑233 (MQ=255) cATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAGTTTGTGCAACTTCAc > 1:58988/1‑249 (MQ=255) aTCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTAtct < 1:370620/148‑1 (MQ=255) tCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAAtaataatc > 1:327238/1‑133 (MQ=255) gtTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAGTTTGTGCAACTTCACCTTGAATatca > 1:101743/1‑251 (MQ=255) gtgATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAaaaa < 1:711300/171‑1 (MQ=255) aaaGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAAc < 1:534043/179‑1 (MQ=255) aaGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAAc < 1:133029/178‑1 (MQ=255) aGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAg > 1:892275/1‑81 (MQ=255) aGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGag < 1:551800/204‑2 (MQ=255) cTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAGTTTGTGCAACTTCACCTTGAATATCATCACGGCTTGatac < 1:303041/239‑4 (MQ=255) tATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAGTTTGTGCAACTTCACCTTGAATATCATCACGGCTTGATACTACAGTAATAGta < 1:791165/251‑2 (MQ=255) aTCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAg > 1:105799/1‑195 (MQ=255) aTCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAGTTTGTGCAACTTCACCTTGAATATCATCACGGCTTGATACTACAGTAATAg > 1:820219/1‑248 (MQ=255) aTCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAGTTTGTGCAACTTCACCTTGAATATCATCACGGCTTGATACTACAGTAATAGta < 1:560341/250‑2 (MQ=255) aTAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAGTTTGTGCAACTTCACCTTGAATATCATCACGGCTTGATACTACAGTAATAg < 1:728572/241‑1 (MQ=255) acacaacacCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAGTTTGTGCAACTTCACCTTGAATATCATCACGGCTTGATACTACAGTAATAGtacgtgca > 1:780066/1‑239 (MQ=255) acCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAg < 1:246077/57‑1 (MQ=255) ccATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCaataat > 1:51721/1‑78 (MQ=255) ccATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAAc < 1:406740/144‑1 (MQ=255) ttGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTAtcttc < 1:811510/87‑1 (MQ=255) ttGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAGTTTGTGCAACTTCACCTTGAATATCATCACGGCtt < 1:498813/205‑1 (MQ=255) ttGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAGTTTGTGCAACTTCACCTTGAATATCATCACGGCTTGATACTACAGTAATAGtacgtgc > 1:278232/1‑222 (MQ=255) gtgGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAGTTTGTGCAACTTCACCTTGAATATCATCACGGCTTGATACTACAGTAATAGTACGTGCACTGTCTGCCGTGATTGTTTCTTGa > 1:78445/1‑251 (MQ=255) gTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGttt < 1:853849/45‑3 (MQ=255) gTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGAAATCTCATCAGACGAGGTAAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAGTTTGTGCAACTTCACCTTGAATATCATCACGGCTTGATACtacag > 1:566742/1‑207 (MQ=255) | ACACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCACCTTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAGCGAGGGATATCAGCACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAACTGAGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATGCCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATGGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTATACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATGTTAGTCTCATGTGTGATATCAATAATAACCCCTACAGTGTCTTCTGCTGAAAATGAAATTTCATCAGATGAGGTGAAAAAATCCTTTTTAACAATCTCAATATTTTCAAGACCGCGAGTACGTAGAATTTGTGCAACTTCACCTTGGATATCATCACGGCTTGACACTATAGTAATAGTGCGAGCACTGTCTGCCGTGATTGTTTCTTGA > 1/857239‑857726 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |