| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 857,336 | G→T | intergenic (‑7679/‑64882) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 857,336 | 0 | G | T | 100.0% | 253.1 / NA | 95 | intergenic (‑7679/‑64882) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (49/46); total (49/46) | |||||||||||
CAAATAGACTCCCGTTAAATATGTCTAAATTCGGAGTATATTCAATAACATTACCTGATAGCTTTTTATCAAATAATAAATCTAAATCTTGAGAACCATTAGGGCCTTGGGCTAATAGCACTGGAATTTTTTTACTTGACACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCACCTTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAGCGAGGGATATCAGCACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAACTGAGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATGCCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATGGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTATACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATGTTAGTCTCATGTGTGATATCAATAATAACCCCTACAGTGTCTTCTGCTGAAAATGAA > 1/857101‑857573 | caaataagcTCCCGTTAAATATATCTAAATTAGGAGCATATTCAATAACATTACCTGATAGCTTTTTATCAAATAATAAATCTAAATCCTGGGAACCATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTaaa > 1:21137/9‑251 (MQ=255) gcTCCCGTTAAATATATCTAAATTAGGAGCATATTCAATAACATTACCTGATAGCTTTTTATCAAATAATAAATCTAAATCCTGGGAACCATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTGAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGAttt > 1:117216/2‑251 (MQ=255) tatCTAAATTAGGAGCATATTCAATAACATTACCTGATAGCTTTTTATCAAATAATAAATCTAAATCCTGGGAACCATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATc < 1:732294/218‑1 (MQ=255) cTAAATTAGGAGCATATTCAATAACATTACCTGATAGCTTTTTATCAAATAATAAATCTAAATCCTGGGAACCATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACtt > 1:589932/1‑251 (MQ=255) cTAAATTAGGAGCATATTCAATAACATTACCTGATAGCTTTTTATCAAATAATAAATCTAAATCCTGGGAACCATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACtt > 1:749870/1‑251 (MQ=255) gagcatatTCAATAACATTACCTGATAGCTTTTTATCAAATAATAAATCTAAATCCTGGGAACCATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTaattgggta > 1:594035/5‑244 (MQ=255) aCATTACCTGATAGCTTTTTATCAAATAATAAATCTAAATCCTGGGAACCATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATc > 1:878548/1‑194 (MQ=255) cATTACCTGATAGCTTTTTATCAAATAATAAATCTAAATCCTGGGAACCATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATtaaagtaa > 1:151701/1‑251 (MQ=255) ttACCTGATAGCTTTTTATCAAATAATAAATCTAAATCCTGGGAACCATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCa < 1:155930/192‑1 (MQ=255) ccTGATAGCTTTTTATCAAATAATAAATCTAAATCCTGGGAACCATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGAt > 1:596392/1‑251 (MQ=255) ttttATCAAATAATAAATCTAAATCCTGGGAACCATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCt < 1:56234/251‑1 (MQ=255) aTCAAATAATAAATCTAAATCCTGGGAACCATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCtagta < 1:36051/251‑1 (MQ=255) taataaATCTAAATCCTGGGAACCATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACt < 1:890194/201‑1 (MQ=255) taataaATCTAAATCCTGGGAACCATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGttttt > 1:401956/1‑251 (MQ=255) taataaATCTAAATCCTGGGAACCATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGttttt > 1:329567/1‑251 (MQ=255) atctaaatccTGGGAACCATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATa > 1:252126/1‑251 (MQ=255) tctaaatccTGGGAACCATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACtt > 1:661253/1‑195 (MQ=255) ccATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATg < 1:315162/159‑1 (MQ=255) ccATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCa > 1:316874/1‑249 (MQ=255) cATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATg > 1:405455/1‑158 (MQ=255) cATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCt < 1:633212/218‑1 (MQ=255) cATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTa < 1:812155/251‑1 (MQ=255) cATTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTa > 1:310795/1‑251 (MQ=255) aTTAGGACCTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTAt > 1:667072/1‑251 (MQ=255) accTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCt < 1:618416/210‑1 (MQ=255) accTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCg < 1:666915/249‑1 (MQ=255) cTTGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTc > 1:633530/1‑238 (MQ=255) ttGGGCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATaa > 1:330246/1‑251 (MQ=255) gggCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATaaca > 1:522171/1‑251 (MQ=255) ggCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACAcc > 1:821264/1‑138 (MQ=255) ggCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGAt < 1:577487/195‑1 (MQ=255) ggCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATaaca > 1:57832/1‑250 (MQ=255) ggCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATaaca > 1:359564/1‑250 (MQ=255) gCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTa < 1:381331/237‑1 (MQ=255) gCTAATAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATaacac < 1:223679/250‑1 (MQ=255) aaTAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACTGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAag > 1:710296/1‑220 (MQ=255) aTAGCACCGGAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATaacacaacac < 1:811641/251‑1 (MQ=255) gAATTTTTTTACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCAc > 1:274370/1‑228 (MQ=255) ttACTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGtac < 1:66289/251‑1 (MQ=255) aCTTGATACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCt > 1:591778/1‑176 (MQ=255) tgatacaATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGtactacac < 1:790356/247‑4 (MQ=255) gatacaATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATAccc > 1:303892/4‑171 (MQ=255) atacaATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTc > 1:98394/3‑172 (MQ=255) atacaATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGAt < 1:149835/215‑1 (MQ=255) atacaATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGtactacacta > 1:870742/3‑251 (MQ=255) ctcATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATaacacaacac > 1:460155/1‑220 (MQ=255) cATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCtagtag > 1:176713/1‑172 (MQ=255) cATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTtgtg > 1:385486/1‑180 (MQ=255) aGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACAt > 1:58556/1‑221 (MQ=255) atatGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAAt < 1:729575/251‑1 (MQ=255) atGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCAc < 1:12163/194‑1 (MQ=255) aaTTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACAt < 1:874657/206‑1 (MQ=255) aaTTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTAtat > 1:589530/1‑249 (MQ=255) aTTAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTAtatt < 1:634745/251‑4 (MQ=255) tAAACTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAg < 1:230379/251‑1 (MQ=255) aCTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGAt < 1:897776/165‑1 (MQ=255) aCTTGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGttt < 1:170454/251‑3 (MQ=255) ttGCGCCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCa < 1:606354/251‑1 (MQ=255) cgcCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCt < 1:699376/137‑1 (MQ=255) cgcCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAag > 1:244326/1‑156 (MQ=255) cgcCAATACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCAtg < 1:307409/250‑1 (MQ=255) aaTACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCt < 1:5782/133‑1 (MQ=255) aTACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTaat < 1:277112/96‑2 (MQ=255) aTACCGCCCTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTAta < 1:582757/234‑2 (MQ=255) ccgcccttACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACt < 1:645203/204‑1 (MQ=255) cgcccttACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCt < 1:363262/123‑1 (MQ=255) cccttACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTAt > 1:81576/4‑160 (MQ=255) cccttACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACAt > 1:253421/4‑184 (MQ=255) aCTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGAt < 1:168233/108‑1 (MQ=255) aCTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAag < 1:293578/137‑1 (MQ=255) aCTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATAc > 1:783710/1‑174 (MQ=255) aCTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACAt > 1:63494/1‑176 (MQ=255) aCTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCttt < 1:552469/217‑1 (MQ=255) aCTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAACTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTc > 1:631815/1‑200 (MQ=255) gCAATTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCt < 1:641241/108‑1 (MQ=255) aTTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGa > 1:686365/1‑80 (MQ=255) aTTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATaacacaacac < 1:898310/156‑1 (MQ=255) aTTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACTCCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGTCAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTAtcttc < 1:272846/251‑1 (MQ=255) aTTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTAtcttc < 1:293829/251‑1 (MQ=255) aTTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTAtct > 1:569257/1‑249 (MQ=255) aTTTTAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGATACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCaataat > 1:456535/1‑233 (MQ=255) ttttAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTaaaaa < 1:334762/183‑1 (MQ=255) ttttAACAGTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTAtctt > 1:494435/1‑249 (MQ=255) gTATCTCTTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCttt < 1:19207/195‑1 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCAc < 1:742276/129‑1 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATaacacaacac > 1:176126/1‑143 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACt > 1:824016/1‑173 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGttt > 1:778527/1‑199 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGttt < 1:770961/201‑3 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGatat < 1:103839/213‑1 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATc < 1:586589/214‑1 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGaa > 1:809055/1‑251 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGaa > 1:368818/1‑251 (MQ=255) ctctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAGTATCTTCTGCTGAAAATGaa > 1:497566/1‑251 (MQ=255) ctTAAACGAGGTATATCAACACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAATTGGGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATACCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATTGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTACACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATATTAGTTTCATGTGTGATATCAATAATAATCCCTACAgtat < 1:484173/232‑3 (MQ=255) | CAAATAGACTCCCGTTAAATATGTCTAAATTCGGAGTATATTCAATAACATTACCTGATAGCTTTTTATCAAATAATAAATCTAAATCTTGAGAACCATTAGGGCCTTGGGCTAATAGCACTGGAATTTTTTTACTTGACACAATCTCATTAGCAATATGTGAACTAATTAAACTTGCGCCAATACCACCTTTACAACTTAATACAGCAATTTTAACAGTATCTCTTAAGCGAGGGATATCAGCACCTAAAATGATTTTCTCAACCATCTGACTTAACTGAGTATGCGAATTAAAGTAAAGGATGCCCTCATCTAGTAGTTTTTGTGATAAAGAGATGGAGTCACTATCACCGATAACACAACACCATACATTTTGTGGTACTATACTAAAAACTCGTTCGACAATAGTCTTTATGTTAGTCTCATGTGTGATATCAATAATAACCCCTACAGTGTCTTCTGCTGAAAATGAA > 1/857101‑857573 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |