| Predicted mutation | ||||||
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| RA | 1 | 134,747 | A→C | intergenic (+1436/+127484) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 134,747 | 0 | A | C | 100.0% | 366.3 / NA | 130 | intergenic (+1436/+127484) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑TAC/LSU rRNA ## 23S rRNA, large subunit ribosomal RNA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (70/60); total (70/60) | |||||||||||
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
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aaTTATTAGTTGAAGTGCGGTCAAATCCGCAAGCGATTTTACAAGATGACGCGGAAGACATCCACAGCTGGGTGGAAAGTAAGCTCATTGATAAGGTAGGCAATTTAGGCAAAAAACTGCACACAGGGCGCAGCCGCAACGACCAAGTGGCACTCGACATCAAAATGTGGTGTAAACAACGGGTTGCCGAATTGCAGCATTCTATCCGTGACTTACAGCGTAAATTGGTGCTCACCGCAGAAAACAATCAg > 1:119169/1‑251 (MQ=255) taGTTGAAGTGCGGTCAAATCCGCAAGCGATTTTACAAGATGACGCGGAAGACATCCACAGCTGGGTGGAAAGTAAGCTCATTGATAAGGTAGGCAATTTAGGCAAAAAACTGCACACAGGGCGCAGCCGCAACGACCAAGTGGCACTCGACATCAAAATGTGGTGTAAACAACGGGTTGCCGAATTGCAGCATTCTATCCGTGACTTACAGCGTAAATTGGTGCTCACCGCAGAAAACAATCAGGATGc > 1:110269/1‑250 (MQ=255) gTTGAAGTGCGGTCAAATCCGCAAGCGATTTTACAAGATGACGCGGAAGACATCCACAGCTGGGTGGAAAGTAAGCTCATTGATAAGGTAGGCAATTTAGGCAAAAAACTGCACACAGGGCGCAGCCGCAACGACCAAGTGGCACTCGACATCAAAATGTGGTGTAAACAACGGGTTGCCGAATTGCAGCATTCTATCCGTGACTTACAGCGTAAATTGGTGCTCACCGCAGAAAACAATCAGGATGCCGt > 1:525624/1‑251 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |