| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | 1 | 854,433 | C→T | intergenic (‑4776/‑67785) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 854,433 | 0 | C | T | 100.0% | 158.7 / NA | 59 | intergenic (‑4776/‑67785) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (33/26); total (33/26) | |||||||||||
TTTAAGATAGGATTATTATTAATTAGTAATAGTTCAAGTTCAATTTGCTGTTTGCTCTTATTTTTAGCTACTTCGTCACTATCTTGATCCTTAGGTCTTTCTCCAGTAATAACTTCCTTTCTATATTGGAATTTTTTTCTGGCTGAAAGTGCGGCAAACAATACAATAATACCAAAAATCGTTAATAGCGCATAAGATAATAATAGTTTAATCATCATGTTGACTTCCTCATCAACCACCAAATGATTCCCATACCGAAAAGTTCACTGCCAAAAACATAATAAAGCACGTATCTACCGGTAGGGTCATTAATTAAGAAATCAAAGTTTTCCGGCATAGCAAATTGCATAAAGAAAAAGAAACCGACAGGAAAACACGCTACAATTATAGCTGACATTCTAGCCTCTGATGTCATTGCTTTCTTTTTCTTCTCCATTTTATTGCTATCGGCAATTACAC > 1/854221‑854679 | tttaaaacgggATTATTGTTAATCAGTAACAGCTCAAGTTCAATTTGCTGCTTGCTTTTACCTTTGGCTATTTCATCATTACTTTGATCCTTAGGTCTTTCTCCAGTAATAGTTTCTTTCCTATGCTGGAATTTTCTTCTAGCTGAAAGTGCCAAAAATAATACAAACACACCAAAAATGGTTAATAATGCATAAGACAGTAATAGCTTAATTATCATGTTGACTTCCTCATCAACCACCAAATAATTccc < 1:889899/242‑1 (MQ=255) ggATTATTGTTAATCAGTAACAGCTCAAGTTCAATTTGCTGCTTGCTTTTACCTTTGGCTATTTCATCATTACTTTGATCCTTAGGTCTTTCTCCAGTAATAATTTCTTTCCTATGCTGGAATTTTCTTCTAGCTGAAAGTGCCAAAAATAATACAAACACACCAAAAATGGTTAATAATGCATAAGACAGTAATAGCTTAATTATCATGt < 1:318174/211‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |