| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 854,427 | T→C | intergenic (‑4770/‑67791) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 854,427 | 0 | T | C | 100.0% | 151.1 / NA | 53 | intergenic (‑4770/‑67791) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (30/23); total (30/23) | |||||||||||
TTTAAGATAGGATTATTATTAATTAGTAATAGTTCAAGTTCAATTTGCTGTTTGCTCTTATTTTTAGCTACTTCGTCACTATCTTGATCCTTAGGTCTTTCTCCAGTAATAACTTCCTTTCTATATTGGAATTTTTTTCTGGCTGAAAGTGCGGCAAACAATACAATAATACCAAAAATCGTTAATAGCGCATAAGATAATAATAGTTTAATCATCATGTTGACTTCCTCATCAACCACCAAATGATTCCCATACCGAAAAGTTCACTGCCAAAAACATAATAAAGCACGTATCTACCGGTAGGGTCATTAATTAAGAAATCAAAGTTTTCCGGCATAGCAAATTGCATAAAGAAAAAGAAACCGACAGGAAAACACGCTACAATTATAGCTGACATTCTAGCCTCTGATGTCATTGCTTTCTTTTTCTTCTCCATTTTATTGCTATCGGC > 1/854221‑854671 | tttaaaacgggATTATTGTTAATCAGTAACAGCTCAAGTTCAATTTGCTGCTTGCTTTTACCTTTGGCTATTTCATCATTACTTTGATCCTTAGGTCTTTCTCCAGTAATAGTTTCTTTCCTATGCTGGAATTTTCTTCTAGCTGAAAGTGCCAAAAATAATACAAACACACCAAAAATGGTTAATAATGCATAAGACAGTAATAGCTTAATTATCATGTTGACTTCCTCATCAACCACCAAATAATTccc < 1:889899/242‑1 (MQ=255) ggATTATTGTTAATCAGTAACAGCTCAAGTTCAATTTGCTGCTTGCTTTTACCTTTGGCTATTTCATCATTACTTTGATCCTTAGGTCTTTCTCCAGTAATAATTTCTTTCCTATGCTGGAATTTTCTTCTAGCTGAAAGTGCCAAAAATAATACAAACACACCAAAAATGGTTAATAATGCATAAGACAGTAATAGCTTAATTATCATGt < 1:318174/211‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gcATAAGACAGTAATAGCTTAATTATCATGTTGACTTCCTCATCAACCACCAAATAATTCCCATACCGAAAAGCTCACTACCAAAAACATAATAAAGCACGTATCTACCGGTAGGGTCATTAATTAAGAAATCAAAGTTTTCCGGCATAGCAAACTGCATAAAGAAAAAGAAACCGACCGGAAAACATGCTACGATTATAGCTGACATTCTGGCCTCTGATGTCATTGCTTTCTTTTTCTTTTCCATTTTa > 1:364426/1‑251 (MQ=255) gcATAAGACAGTAATAGCTTAATTATCATGTTGACTTCCTCATCAACCACCAAATAATTCCCATACCGAAAAGCTCACTACCAAAAACATAATAAAGCACGTATCTACCGGTAGGGTCATTAATTAAGAAATCAAAGTTTTCCGGCATAGCAAACTGCATAAAGAAAAAGAAACCGACCGGAAAACATGCTACGATTATAGCTGACATTCTGGCCTCTGATGTCATTGCTTTCTTTTTCTTTTCCATTTTa > 1:135023/1‑251 (MQ=255) gcATAAGACAGTAATAGCTTAATTATCATGTTGACTTCCTCATCAACCACCAAATAATTCCCATACCGAAAAGCTCACTACCAAAAACATAATAAAGCACGTATCTACCGGTAGGGTCATTAATTAAGAAATCAAAGTTTTCCGGCATAGCAAACTGCATAAAGAAAAAAAAACCGACCGGAAAACATGCTACGATTATAGCTGACATTCTGGCCTCTGATGTCATTGCTTTCTTTTTCTTTTCCATTTTa > 1:424744/1‑251 (MQ=255) 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gtaataGCTTAATTATCATGTTGACTTCCTCATCAACCACCAAATAATTCCCATACCGAAAAGCTCACTACCAAAAACATAATAAAGCACGTATCTACCGGTAGGGTCATTAATTAAGAAATCAAAGTTTTCCGGCATAGCAAACTGCATAAAGAAAAAGAAACCGACCGGAAAACATGCTACGATTATAGCTGACATTCTGGCCTCTGATGTCATTGCTTTCTTTTTCTTTTCCATTTTATTGCTATccg > 1:471884/2‑249 (MQ=255) taataGCTTAATTATCATGTTGACTTCCTCATCAACCACCAAATAATTCCCATACCGAAAAGCTCACTACCAAAAACATAATAAAGCACGTATCTACCGGTAGGGTCATTAATTAAGAAATCAAAGTTTTCCGGCATAGCAAACTGCATAAAGAAAAAGAAACCGACCGGAAAACATGCTACGATTATAGCTGACATTCTGGCCTCTGATGTCATTGCTTTCTTTTTCTTTTCCATTTTATTGCTATccgc < 1:744756/251‑4 (MQ=255) | TTTAAGATAGGATTATTATTAATTAGTAATAGTTCAAGTTCAATTTGCTGTTTGCTCTTATTTTTAGCTACTTCGTCACTATCTTGATCCTTAGGTCTTTCTCCAGTAATAACTTCCTTTCTATATTGGAATTTTTTTCTGGCTGAAAGTGCGGCAAACAATACAATAATACCAAAAATCGTTAATAGCGCATAAGATAATAATAGTTTAATCATCATGTTGACTTCCTCATCAACCACCAAATGATTCCCATACCGAAAAGTTCACTGCCAAAAACATAATAAAGCACGTATCTACCGGTAGGGTCATTAATTAAGAAATCAAAGTTTTCCGGCATAGCAAATTGCATAAAGAAAAAGAAACCGACAGGAAAACACGCTACAATTATAGCTGACATTCTAGCCTCTGATGTCATTGCTTTCTTTTTCTTCTCCATTTTATTGCTATCGGC > 1/854221‑854671 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |