| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 853,899 | T→C | intergenic (‑4242/‑68319) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 853,899 | 0 | T | C | 100.0% | 112.9 / NA | 40 | intergenic (‑4242/‑68319) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (11/29); total (11/29) | |||||||||||
GCGTACCAAGCTTTTCTTCTATAGCTAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGTTGAATTAATTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTCAGACTTTGCTGCATTACAGTGCAAAACATCCTGATTTCCGTTGTTGGTAAAGACACAGAGAGATCCTGTAATGCTTGTGACATACCAGTAATTTCAGATTTACGAATAATACGTAACATAACATAAGTTAGATCAGGATTTAATGTTTTAAAGTCAGTTGCAACCTGTTTTAGTGCGGCCTCAATACTTATCCCTGTTTGTACATTAACAGCTACTAAATCAATGAATCCGGCTAAATCATTCATGATTTTTTTAATTTTAGCTTTCAAAATAGAACCAATTAAAACCCCAGGAATGACAATAGTTATTATTAATATAGTTAGAAAGCCAAGTAACAGAGATGAACTGTCGGTAGTTTCATCAGTAAA > 1/853676‑854138 | gtgTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTAAGGCTTTGTTGCATTACAGTACAAAACATTCGGATTTCTGCTGTTGGTAAAGACACAGAGAGATCCTGCAATGCCTGCGACATACCGGTAATCTCGGATTTACGAATAATACGTAACATAACATAAGTCAGATc < 1:575591/227‑1 (MQ=255)gtgTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTAAGGCTTTGTTGCATTACAGTACAAAACATTCGGATTTCTGCTGTTGGTAAAGACACAGAGAGATCCTGCAATGCCTGCGACATACCGGTAATCTCGGATTTACGAATAATACGTAACATAACATAAGTCAGATCAGGGTTTAAtat < 1:748897/239‑3 (MQ=255) gTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTAAGGCTTTGTTGCATTACAGTACAAAACATTCGGATTTCTGCTGTTGGTAAAGACACAGAGATATCCTGCAATGCCTGCGACATACCGGTAATCTCGGATTTACGAATAATACGTAACATAACATAAGTCAGATCAGGGTTTAAtat < 1:344678/239‑3 (MQ=255) gTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTAAGGCTTTGTTGCATTACAGTACAAAACATTCGGATTTCTGCTGTTGGTAAAGACACAGAGAGATCCTGCAATGCCTGCGACATACCGGTAATCTCGGATTTACGAATAATACGTAACATAACATAAGTCAGATCAGGGTTTAAt > 1:644185/1‑237 (MQ=255) aCCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTAAGGCTTTGTTGCATTACAGTACAAAACATTCGGATTTCTGCTGTTGGTAAAGACACAGAGAGATCCTGCAATGCCTGCGACATACCGGTAATCTCGGATTTACGAATAATACGTAACATAACATAAGTCAGATCAGGGTTTAATATTTTAAAg < 1:566096/244‑1 (MQ=255) 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1:272310/1‑93 (MQ=255) gACACAGAGAGATCCTGCAATGCCTGCGACATACCGGTAATCTCGGATTTACGAATAATACGTAACATAACATAAGTCAGATCAGGGTTTAATATTTTAAAGTCAGTTGCAACGTGCTTTAGCGCAGCTTCAATACCCATTCCCGTTTGTAAATTAACAGCTACTAAATCAATGAAACCTGCTAAATCATTCATGATTTTTTTAATTTTGGATTTTAAAAt < 1:665696/221‑1 (MQ=255) gagagaTCCTGCAATGCCTGCGACATACCGGTAATCTCGGATTTACGAATAATACGTAACATAACATAAGTCAGATCAGGGTTTAATATTTTAAAGTCAGTTGCAACGTGCTTTAGCGCAGCTTCAATAc < 1:449317/130‑1 (MQ=255) gagagaTCCTGCAATGCCTGCGACATACCGGTAATCTCGGATTTACGAATAATACGTAACATAACATAAGTCAGATCAGGGTTTAATATTTTAAAGTCAGTTGCAACGTGCTTTAGCGCAGCTTCAATACCCATTCCCGTTTGTAAATTAACAGCTACTAAATCAATGAAACCTGCTAAATCATTCATGATTTTTTTAATTTTGGATTTTAAAATAGAACCAATTAAAATTCCTGGAATAACAATAGtta < 1:795950/250‑1 (MQ=255) gagaTCCTGCAATGCCTGCGACATACCGGTAATCTCGGATTTACGAATAATACGTAACATAACATAAGTCAGATCAGGGTTTAATATTTTAAAGTCAGTTGCAACGTGCTTTAGCGCAGCTTCAATACCCATTCCCGTTTGTAAATTAACAGCTACTAAATCAATGAAACCTGCTAAAt < 1:251250/179‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) taacataaGTCAGATCAGGGTTTAATATTTTAAAGTCAGTTGCAACGTGCTTTAGCGCAGCTTCAATACCCATTCCCGTTTGTAAATTAACAGCTACTAAATCAATGAAACCTGCTAAATCATTCATGATTTTTTTAATTTTGGATTTTAAAATAGAACCAATTAAAATTCCTGGAATAACAATAg < 1:320163/186‑1 (MQ=255) acataaGTCAGATCAGGGTTTAATATTTTAAAGTCAGTTGCAACGTGCTTTAGCGCAGCTTCAATACCCATTCCCGTTTGTAAATTAACAGCTACTAAATCAATGAAACCTGCTAAATCATTCATGATTTTTTTAATTTTGGATTTTAAAATAGAACCAATTAAAATTCCTGGAATAACAATAGTTACTATTAata > 1:341250/1‑196 (MQ=255) | GCGTACCAAGCTTTTCTTCTATAGCTAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGTTGAATTAATTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTCAGACTTTGCTGCATTACAGTGCAAAACATCCTGATTTCCGTTGTTGGTAAAGACACAGAGAGATCCTGTAATGCTTGTGACATACCAGTAATTTCAGATTTACGAATAATACGTAACATAACATAAGTTAGATCAGGATTTAATGTTTTAAAGTCAGTTGCAACCTGTTTTAGTGCGGCCTCAATACTTATCCCTGTTTGTACATTAACAGCTACTAAATCAATGAATCCGGCTAAATCATTCATGATTTTTTTAATTTTAGCTTTCAAAATAGAACCAATTAAAACCCCAGGAATGACAATAGTTATTATTAATATAGTTAGAAAGCCAAGTAACAGAGATGAACTGTCGGTAGTTTCATCAGTAAA > 1/853676‑854138 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |