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| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (30/45); total (30/45) | |||||||||||
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acaCTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTAAGGCTTTGTTGCATTACAGTACAAAACATTCGGATTTCTGCTGTTGGTAAAGACACAGAGAGATCCTGCAATGCCTGCGACATACCGGTAATCTCGGATTTACGa < 1:599371/217‑1 (MQ=255) cATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTAAGGCTTTGTTGCATTACAGTACAAAACATTCGGATTTCTGCTGTTGGTAAAGACACagagag < 1:149011/171‑1 (MQ=255) aCAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTAAGGCTTTGTTGCATTACAGTACAAAACATTCGGATTTCTGCTGTTGGTAAAGACACAGAGAGATCCTGCAATGCCTGCGACATACCGGTAATCTCGGATTTACGAATAATACGTaacataacat > 1:33746/1‑222 (MQ=255) agtgTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATag > 1:220015/4‑82 (MQ=255) gtgTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTAAGGCTTTGTTGCATTACAGTACAAAACATTCGGATTTCTGCTGTTGGTAAAGACACAGAGAGATCCTGCAATGCCTGCGACATACCGGTAATCTCGGATTTACGAATAATACGTaacataacat < 1:483186/217‑1 (MQ=255) gtgTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTAAGGCTTTGTTGCATTACAGTACAAAACATTCGGATTTCTGCTGTTGGTAAAGACACAGAGAGATCCTGCAATGCCTGCGACATACCGGTAATCTCGGATTTACGAATAATACGTAACATAACATAAGTCAGATc < 1:575591/227‑1 (MQ=255) gtgTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTAAGGCTTTGTTGCATTACAGTACAAAACATTCGGATTTCTGCTGTTGGTAAAGACACAGAGAGATCCTGCAATGCCTGCGACATACCGGTAATCTCGGATTTACGAATAATACGTAACATAACATAAGTCAGATCAGGGTTTAAtat < 1:748897/239‑3 (MQ=255) gTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTAAGGCTTTGTTGCATTACAGTACAAAACATTCGGATTTCTGCTGTTGGTAAAGACACAGAGATATCCTGCAATGCCTGCGACATACCGGTAATCTCGGATTTACGAATAATACGTAACATAACATAAGTCAGATCAGGGTTTAAtat < 1:344678/239‑3 (MQ=255) gTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTAAGGCTTTGTTGCATTACAGTACAAAACATTCGGATTTCTGCTGTTGGTAAAGACACAGAGAGATCCTGCAATGCCTGCGACATACCGGTAATCTCGGATTTACGAATAATACGTAACATAACATAAGTCAGATCAGGGTTTAAt > 1:644185/1‑237 (MQ=255) aCCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTAAGGCTTTGTTGCATTACAGTACAAAACATTCGGATTTCTGCTGTTGGTAAAGACACAGAGAGATCCTGCAATGCCTGCGACATACCGGTAATCTCGGATTTACGAATAATACGTAACATAACATAAGTCAGATCAGGGTTTAATATTTTAAAg < 1:566096/244‑1 (MQ=255) | TGTTAGTACTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTGAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCACAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACGCCTGGAGCTAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGATACTCATTTTTGCTGACAGCGTACCAAGCTTTTCTTCTATAGCTAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGTTGAATTAATTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTCAGACTTTGCTGCATTACAGTGCAAAACATCCTGATTTCCGTTGTTGGTAAAGACACAGAGAGATCCTGTAATGCTTGTGACATACCAGTAATTTCAGATTTACGAATAATACGTAACATAACATAAGTTAGATCAGGATTTAATGTTTTAAAG > 1/853444‑853923 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |