| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 853,550 | C→T | intergenic (‑3893/‑68668) | unknown ← / → unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 853,550 | 0 | C | T | 100.0% | 166.4 / NA | 62 | intergenic (‑3893/‑68668) | unknown/unknown | tRNA‑Met‑CAT/tRNA‑Leu‑GAG |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (27/35); total (27/35) | |||||||||||
TTGTTAGCAACGGCTGTAAATAGAGTAGAGATGAATTACTGTCCCCTTTCTTGTAATAAATTTCAGATAATTTATAACGTGTGAGAGGATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTACTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTGAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCACAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACGCCTGGAGCTAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGATACTCATTTTTGCTGACAGCGTACCAAGCTTTTCTTCTATAGCTAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGTTGAATTAATTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTCAGACTTTGCTGCATTAC > 1/853303‑853787 | ttgttAGCAACGGCTGTAAGTAGAGTAGAGATGAACTACTGTCCCCTTTCTTGTAATAAATTTCAGATAATTTATAACGCGTGAGAGGATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAAt < 1:100346/251‑1 (MQ=255) gCTGTAAGTAGAGTAGAGATGAACTACTGTCCCCTTTCTTGTAATAAATTTCAGATAATTTATAACGCGTGAGAGGATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAAt < 1:701171/239‑1 (MQ=255) gCTGTAAGTAGAGTAGAGATGAACTACTGTCCCCTTTCTTGTAATAAATTTCAGATAATTTATAACGCGTGAGAGGATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAAc < 1:112687/244‑1 (MQ=255) tGTAAGTAGAGTAGAGATGAACTACTGTCCCCTTTCTTGTAATAAATTTCAGATAATTTATAACGCGTGAGAGGATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAag < 1:145183/251‑1 (MQ=255) gagtagagATGAACTACTGTCCCCTTTCTTGTAATAAATTTCAGATAATTTATAACGCGTGAGAGGATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAg > 1:26574/1‑251 (MQ=255) tagagATGAACTACTGTCCCCTTTCTTGTAATAAATTTCAGATAATTTATAACGCGTGAGAGGATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGaa < 1:779480/250‑1 (MQ=255) tagagATGAACTACTGTCCCCTTTCTTGTAATAAATTTCAGATAATTTATAACGCGCGAGAGGATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGaa < 1:449320/250‑1 (MQ=255) gaactACTGTCCCCTTTCTTGTAATAAATTTCAGATAATTTATAACGCGTGAGAGGATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAg > 1:505275/5‑221 (MQ=255) gaactACTGTCCCCTTTCTTGTAATAAATTTCAGATAATTTATAACGCGTGAGAGGATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGaa > 1:46744/5‑243 (MQ=255) tCCCCTTTCTTGTAATAAATTTCAGATAATTTATAACGCGTGAGAGGATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATAccc < 1:75869/251‑1 (MQ=255) gTAATAAATTTCAGATAATTTATAACGCGTGAGAGGATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAg < 1:771240/201‑1 (MQ=255) gTAATAAATTTCAGATAATTTATAACGCGTGAGAGGATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTAcac > 1:895961/1‑247 (MQ=255) tttATAACGCGTGAGAGGATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAAt > 1:529295/1‑181 (MQ=255) gcgtgAGAGGATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAg > 1:237155/3‑229 (MQ=255) gATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACataat > 1:233606/1‑251 (MQ=255) tcttctTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAaat > 1:775313/1‑231 (MQ=255) aTTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAAt < 1:497263/154‑1 (MQ=255) aTTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAAt > 1:503693/1‑250 (MQ=255) tCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAg < 1:6432/143‑1 (MQ=255) tCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAAc > 1:657900/1‑223 (MQ=255) aCATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTAcacc > 1:333570/1‑182 (MQ=255) aCATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTAcac > 1:647849/1‑182 (MQ=255) aTAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGccg > 1:257845/1‑249 (MQ=255) aTAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGccg > 1:763368/1‑249 (MQ=255) tAGTGATTTACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATaataaat < 1:543240/222‑1 (MQ=255) gATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACATATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATaataaat < 1:512030/218‑1 (MQ=255) gATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAggg < 1:833460/230‑1 (MQ=255) aTCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAgt < 1:250880/251‑2 (MQ=255) tCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATAccc < 1:707157/158‑1 (MQ=255) tgttAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAAc > 1:252357/1‑115 (MQ=255) tgttAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTttcttc < 1:574929/251‑1 (MQ=255) tgttAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCAGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTg < 1:757112/163‑1 (MQ=255) ttAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACCCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCta > 1:855882/1‑251 (MQ=255) ctGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAg > 1:82055/1‑201 (MQ=255) gATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAg > 1:170070/1‑230 (MQ=255) aaaGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTg < 1:9263/251‑1 (MQ=255) gTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTAcacc < 1:149795/143‑4 (MQ=255) gTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTttcttc < 1:404035/233‑1 (MQ=255) tGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAAt < 1:484612/250‑1 (MQ=255) cagcTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTttcttc > 1:269651/1‑221 (MQ=255) aaTTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCg > 1:567204/1‑251 (MQ=255) aaTTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCg < 1:250624/251‑1 (MQ=255) cACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGaac < 1:138701/251‑2 (MQ=255) aCTTAATGGTTTTTTATTTAGTACCGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCTCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGTGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGaact < 1:738981/251‑3 (MQ=255) aCTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAg > 1:669373/1‑157 (MQ=255) cTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAg > 1:22221/1‑65 (MQ=255) gTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGaact < 1:696888/243‑3 (MQ=255) ttttttATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTtgatga < 1:255279/251‑1 (MQ=255) tATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAAt < 1:625426/251‑1 (MQ=255) taGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGcc > 1:486632/2‑193 (MQ=255) taGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAAt < 1:235578/246‑1 (MQ=255) cagcagAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAaga > 1:467815/1‑56 (MQ=255) gcagAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAg > 1:674605/1‑95 (MQ=255) aaCATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCaaaa < 1:591410/249‑1 (MQ=255) cATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAatat > 1:325333/1‑203 (MQ=255) cAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTAcacc < 1:485407/74‑4 (MQ=255) aGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTtgatga < 1:79154/218‑1 (MQ=255) gATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAaataataa < 1:676778/95‑1 (MQ=255) gATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTAAGGCTTTGTTGCa > 1:72845/1‑251 (MQ=255) aGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACGCTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAatat < 1:890744/187‑1 (MQ=255) aTCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTAAGGCTTTGTTGCATTAc < 1:742358/249‑1 (MQ=255) aTCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCTATAGCCAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGCTGAACTAGTTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTAAGGCTTTGTTGCATTAc < 1:878934/249‑1 (MQ=255) | TTGTTAGCAACGGCTGTAAATAGAGTAGAGATGAATTACTGTCCCCTTTCTTGTAATAAATTTCAGATAATTTATAACGTGTGAGAGGATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTACTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTGAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCACAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACGCCTGGAGCTAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGATACTCATTTTTGCTGACAGCGTACCAAGCTTTTCTTCTATAGCTAATAATTGAATTTCTCTAATATCAGTCGATAGTTGAATTAATTGATGATAAATAGAGGAACCAAAATTCAGACTTTGCTGCATTAC > 1/853303‑853787 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |