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tCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGAt < 1:708315/99‑1 (MQ=255) tCGTTGTTGTTAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATAccc < 1:707157/158‑1 (MQ=255) tgttAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAAc > 1:252357/1‑115 (MQ=255) tgttAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACTCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTttcttc < 1:574929/251‑1 (MQ=255) tgttAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCAGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTg < 1:757112/163‑1 (MQ=255) ttAGTGCTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTTAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCATAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACACCTGGAGCCAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGACACCCATTTTTGCCGACAGTGTACCAAGTTTTTCTTCta > 1:855882/1‑251 (MQ=255) | CTGTTTTCGACTTCCAACGCTTCTTGATAGCGCTTGAGTTGATTTAAATTTCTTGCTTGTAGAACTTTGGCCTTTTCACTTAACTGCCCACTGTTTGTTAGCAACGGCTGTAAATAGAGTAGAGATGAATTACTGTCCCCTTTCTTGTAATAAATTTCAGATAATTTATAACGTGTGAGAGGATCTTCTTTATTTTTAAGTCCATCACGATACATAGTGATTAACGCATCGTTGTTGTTAGTACTCTGATAAAGTGCTTCTTTAGCAGCTAATTTATCAGCACTTAATGGTTTTTTATTGAGTACAGCAGAACATGCAGTAACAGATAAGATCATGCCGCACAATAGAACATTTTTAAGAGATTTAGAATACATGTGGAAATACCCTCATTACGCCTGGAGCTAGAATTAAAATAATAATTGGAAACATAATAAATAGAATCAAAGGGATACTCATTTTTGCTGACAGCGTACCAAGCTTTTCTTCTA > 1/853209‑853696 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |