| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 112,189 | G→A | intergenic (–/+18945) | – / ← unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 112,189 | 0 | G | A | 100.0% | 110.9 / NA | 43 | intergenic (–/+18945) | –/unknown | –/tRNA‑Ala‑GGC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (23/20); total (23/20) | |||||||||||
CGCCAGTATTAACTACAGGTGTCGGAGTACCGGAACCACCGCCGCCACTTCCGCAAGCTGTAACGGTTAATGATGTTAATACAATAAGACTCAATTTTGAAATTGAGTGTTTAAAATTACTCATAAAAAAACTCCTTAGAAATTAAAGTAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCGGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCGGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCGTGCATACCTAATTTTTTCTCCAAATAGTGGATATTAGTG > 1/111952‑112418 | cgcCAGTATTAACTACAGGTGTCGGAGTACCGGAACCACCGCCGCCACTTCCGCAAGCTGTAACGGTTAATGATGTTAATACAATAAGACTCAATTTTGAAATTGAGTGTTTAAAATTACTCATAAAAAAACTCCTTAGAAATTAAAGTAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAacac < 1:330394/247‑1 (MQ=255)cgcCAGTATTAACTACAGGTGTCGGAGTACCGAAACCACCGCCGCCACTTCCGCAAGCTGTAACGGTTAATGATGTTAATACAATAAGACTCAATTTTGAAATTGAGTGTTTAAAATTACTCATAAAAAAACTCCTTAGAAATTAAAGTAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAacac < 1:285016/247‑1 (MQ=255) gTATTAACTACGGGTGTCGGAGTACCGGAACCACCGCCGCCACTTCCGCAAGCTGTAACGGTTAATGATGTTAATACAATAAGACTCAATTTTGAAATTGAGTGTTTAAAATGACTCATAAAAAAACTCCTTAGAAATTAAAGTAATAGTCT‑ATATTTAAGTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAacac < 1:313928/241‑1 (MQ=255) gTATTAACTACAGGTGTCGGAGTACCGGAACCACCGCCGCCACTTCCGCAAGCTGTAACGGTTAATGATGTTAATACAATAAGACTCAATTTTGAAATTGAGTGTTTAAAATTACTCATAAAAAAACTCCTTAGAAATTAAAGTAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACa < 1:669688/250‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) gTAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAAc > 1:382529/1‑199 (MQ=255) tAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTattaaat < 1:519664/250‑1 (MQ=255) tAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTattaaat < 1:382076/250‑1 (MQ=255) 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(MQ=255) cGCATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCg > 1:780354/1‑209 (MQ=255) cATAAACTGCTTGGGCAGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCAGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCGTGCATACCTAATTTTTTCTCCAAATAGTGGATATTAGTg > 1:520228/1‑246 (MQ=255) | CGCCAGTATTAACTACAGGTGTCGGAGTACCGGAACCACCGCCGCCACTTCCGCAAGCTGTAACGGTTAATGATGTTAATACAATAAGACTCAATTTTGAAATTGAGTGTTTAAAATTACTCATAAAAAAACTCCTTAGAAATTAAAGTAATAGTCTAATATTTAATTAATAATCCCACTAAATTTTATAACTGCTTGAAATTTTTAAGTGGACGTAATCGCATAAACTGCTTGGGCGGTTTAACACAATAAACAAAATACGTTTATTGAAAATTAATAAAAGTGCGAAAAAAAACCGGAATATTTTATTCATAAGCTCATTTCTTTGCTTACCTATCCCTAAAACGTTCTTTAACACATTGAAAAACTTTGTTTTTTCTGACCGCACTTTATTAAATTAAGTTAAGGCTAAATATGCGGCTTATTCGTGCATACCTAATTTTTTCTCCAAATAGTGGATATTAGTG > 1/111952‑112418 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |