| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | 1 | 847,134 | C→T | intergenic (‑26457/+2447) | unknown ← / ← unknown | tRNA‑Thr‑TGT/tRNA‑Met‑CAT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | 1 | 847,134 | 0 | C | T | 100.0% | 169.5 / NA | 61 | intergenic (‑26457/+2447) | unknown/unknown | tRNA‑Thr‑TGT/tRNA‑Met‑CAT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base T (20/41); total (20/41) | |||||||||||
CGTCTGGATTGTCGCTTACGGACAAATATTCTTCTCCCTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGCCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAGTGGGTTTACCAATGATGGTGGCTTCTACGCTCTTATTTAGCACCACCGCCGGTTTACCGATG > 1/846897‑847377 | cGTCTGGATTGCCGCTTACGGACAAATATTCTTCTCCCTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGcc > 1:827705/1‑244 (MQ=255) ccGCTTACGGACAAATATTCTTCTCCCTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAAcc < 1:63792/250‑1 (MQ=255) ccGCTTACGGACAAATATTCTTCTCCCTTTCCATGTGTTTCGGTATTATGGTGGCCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAAcc < 1:103769/250‑1 (MQ=255) gACAAATATTCTTCTCCCTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTaa > 1:65269/1‑250 (MQ=255) aCAAATATTCTTCTCCCTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAAcc < 1:195641/251‑1 (MQ=255) tatTCTTCTCCCTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAgcg > 1:848955/1‑251 (MQ=255) atTCTTCTCCCTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAgcgc < 1:631572/251‑1 (MQ=255) ttcttcTCCCTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCACCGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAAcc > 1:426060/1‑244 (MQ=255) ccTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGc < 1:146610/251‑1 (MQ=255) ccTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGc < 1:34758/251‑1 (MQ=255) tGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAgg < 1:90238/251‑1 (MQ=255) tGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAgg < 1:752556/251‑1 (MQ=255) ggTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCg < 1:230634/247‑1 (MQ=255) gTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑Aatta < 1:94527/239‑1 (MQ=255) gTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTa > 1:772460/1‑251 (MQ=255) tattatGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTAt < 1:749526/251‑1 (MQ=255) ttatGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTAttc < 1:194338/251‑1 (MQ=255) gACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGcc < 1:420531/181‑1 (MQ=255) gACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAAc < 1:669952/198‑1 (MQ=255) aTGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAggg > 1:89866/1‑218 (MQ=255) cTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGtt > 1:406499/1‑251 (MQ=255) aaCAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAAcc < 1:310038/251‑1 (MQ=255) aaCAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAAcc < 1:856954/251‑1 (MQ=255) gACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTa < 1:874536/175‑1 (MQ=255) gACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTa < 1:144296/250‑1 (MQ=255) aCTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTAt < 1:836139/250‑1 (MQ=255) cGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAg < 1:365432/251‑1 (MQ=255) cGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAg < 1:162384/251‑1 (MQ=255) cGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAg < 1:553572/251‑1 (MQ=255) ggTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAggg < 1:199735/177‑1 (MQ=255) gTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAAcc < 1:542146/227‑1 (MQ=255) ggCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCa < 1:101148/152‑1 (MQ=255) cagTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGAc < 1:867355/247‑1 (MQ=255) gTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTa > 1:837498/1‑251 (MQ=255) ttttGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAAtt < 1:634315/249‑1 (MQ=255) ttGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACg < 1:264384/250‑1 (MQ=255) cGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTcc < 1:712037/251‑1 (MQ=255) gTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAAcc < 1:269371/117‑1 (MQ=255) ccGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAGTg < 1:173970/251‑1 (MQ=255) tCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAGTGGGTTTACCAatg < 1:801340/251‑1 (MQ=255) cATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAGTGGGTTTACCAatga < 1:254585/251‑1 (MQ=255) cATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAGTGGGTTTACCAatga < 1:146767/251‑1 (MQ=255) cTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAGTGGGTTTACCAATGATGGTGGCt < 1:457920/251‑1 (MQ=255) tGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAGTGGGTTTACCAATGATGGTGGCtt < 1:364747/251‑1 (MQ=255) gCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAGTGGGTTTACCAATGATGGTGGCtt > 1:172661/1‑250 (MQ=255) aaCGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAGTGGGTTTACCAATGATGGTGGCTTCTa > 1:457163/1‑250 (MQ=255) cGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGGGCCA‑TAGGGCAAATTTTTAGG‑GTGGCAATCCTT‑GGTTCCTTGGTTTTTCCCGGCTTTAACTTCTTTTTTTTCGGAATGGAAGGGGTTATTTTCGCCGTCCCGGGAAAATTAAGGCCACGGCCCGTCCCTGGCCA‑GTTTTTAGTGGGGTTATCAatgaatgtggccttcaccgccctaat > 1:422087/1‑229 (MQ=255) aTGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAg > 1:363599/1‑213 (MQ=255) aTGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAGTGGGTTTACCAATGATGGTGGCTTCTACGCTCTTAttt > 1:487093/1‑251 (MQ=255) aaGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑Gcc < 1:611233/194‑1 (MQ=255) aaGTAGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAGTGGGTTTACCAATGATGGTGGCTTCTACGCTCTTATTTGGcaccac > 1:267765/1‑250 (MQ=255) aGCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCt < 1:795552/113‑1 (MQ=255) gCAAAAGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAGTGGGTTTACCAATGATGGTGGCTTCTACGCTCTTAttt < 1:806729/237‑1 (MQ=255) aGGCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAAcct > 1:137712/1‑113 (MQ=255) gCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAg > 1:683528/1‑132 (MQ=255) gCGGTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAGTGGGTTTACCAATGATGGTGGCTTCTACGCTCTTATTTGGCACCACCGCCGGTTTAcc < 1:730285/250‑1 (MQ=255) gTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCg < 1:759072/69‑1 (MQ=255) gTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAg > 1:222943/1‑189 (MQ=255) gTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAGTGGGTTTACCAATGAtgg > 1:67825/1‑207 (MQ=255) gTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAGTGGGTTTACCAATGATGGTGGc > 1:280574/1‑211 (MQ=255) gTATAGGTCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAGTGGGTTTACCAATGATGGTGGCTTCTACGCTCTTATTTGGCACCACCGCCGGTTTACCGATg > 1:182181/1‑251 (MQ=255) | CGTCTGGATTGTCGCTTACGGACAAATATTCTTCTCCCTTTCCATTTGTTTCGGTATTATGGTGACCTATGCTTCCTATTTGAAAAAACAATCGGACTTAACCGGCGCCGGTTTGGTGGTAGGCTTTGCCAACAGCAGTTTTGAAGTGTTGGCCGGTATCGGCGTATTCTCCGCCTTAGGTTTCATTGCCGCTGCCAACGGACACGATGTGAGCGAAGTAGCAAAAGGCGGTATAGGCCTCGCCTTCTTTGCCTTCCCAACCATCATTAACCAAGCGCCATTAGGGC‑AATTATTAGGCGT‑GCTATTCTTCGGTTCTTTGGTTTTCGCAGGCTTAACCTCCTTTATTTCCGTATTGGAAGTGATTATTTCCGCCGTCCAGGACAAATTACGTCTACGCCGCGTCCAT‑GCCACGTTTTTAGTGGGTTTACCAATGATGGTGGCTTCTACGCTCTTATTTAGCACCACCGCCGGTTTACCGATG > 1/846897‑847377 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |