| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | 1 | 1,199,280 | 2455 bp→TT | intergenic (+39700/+219203) | unknown → / ← unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | 1 | 1199280 | 1201734 | 2455 | 56 [0] | [0] 57 | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | 1 | = 1199279 | 0 (0.000) | 56 (0.640) +TT |
36/426 | 1.1 | 100% | intergenic (+39699/+221658) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT |
| ? | 1 | 1201735 = | 0 (0.000) | intergenic (+42155/+219202) | unknown/unknown | tRNA‑Val‑GAC/tRNA‑Met‑CAT | |||||
GAAACCATCACACCAAACTATGCTTATGATGACGGTATTTTTACTTATCTTGGATTTGCCCCAAATAAAACCTTTCCTGCAGCCTTCTTGTTAGAAGGCTCCACGGAAAGTCTGTTAAATACTAATGTTAAACAAGACGGTAATTATCAGGTATTAGTCATCCAAAAAACAGCAGAAAAATTGGTATTACGTAGCGGTGAAAAAGTGGTCGGCATTTACAATCAAAGTTACGGAAAAACACCGGTAACTTATAACACGACCATTTCACCAAATGTGGCAAGAGACGAACGATAGGAGGCAGAGATGAACGATAACAAAACCATTCAGCCGACGGATGACAAAACGGAAACCGATTATCAACCGGAAGTCAGCAAAATTGCCAAACGCGGTAAAAACCAAAATCTATTTATTTTTCTGATTATTGCACTGCTTGCCGTGGCGTTTTTGGGTTATTCCTTTTTGAATAAAAAGGATACGCAACCGG > 1/1201501‑1201984 | ttagtcaatctatgagtagcagttttgccagctcactttttacaattattggcatgacactgacaatttactttttaggaaaaggatttgccgtaatatctggcaaaattgaagctccagcaacagcattaatttatgattttgtcacaaaaatgattattgtggcatttatgatgaattatggggggtatctagataactctttatcgataattgatgatcttaaaactagttAAAACGCcggtttc < 1:26449‑M2/14‑4 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |